藥物分子設(shè)計(jì)

前言
第1章 緒論(1)
11藥物的基本屬性(1)
12藥物與機(jī)體的相互作用(3)
121藥劑相(4)
122藥代動(dòng)力相(4)
123藥效相(5)
13新藥的研究與開發(fā)(5)
131新藥的研究階段(5)
132新藥的開發(fā)階段(9)
14藥物發(fā)展簡(jiǎn)史(10)
141以天然產(chǎn)物為主的發(fā)現(xiàn)時(shí)期(10)
142以合成藥物為主的發(fā)展時(shí)期(11)
143藥物分子設(shè)計(jì)時(shí)期(13)
144后基因組時(shí)代的藥物分子設(shè)計(jì)(16)
15結(jié)語(yǔ)(18)
參考文獻(xiàn)(19)
第2章 藥物作用的基本原理和相關(guān)知識(shí)(20)
21藥物受體的相互作用(20)
211影響焓變的相互作用(21)
212影響熵變的藥物受體相互作用(23)
213藥物受體結(jié)合的熱力學(xué)(25)
22分子力學(xué)(25)
221力學(xué)效應(yīng)(26)
222化學(xué)效應(yīng)(28)
223原子類型(29)
23分子動(dòng)力學(xué)(29)
24酶抑制劑(31)
241酶反應(yīng)的特點(diǎn)(31)
242藥物抑制的靶酶(32)
243酶抑制劑的作用環(huán)節(jié)(36)
244酶抑制劑分類(38)
25作用于受體的藥物(43)
251受體的結(jié)構(gòu)與分類(43)
252作用于受體靶標(biāo)的藥物——受體調(diào)節(jié)劑(46)
253配體受體相互作用的動(dòng)力學(xué)分析(48)
254受體結(jié)合實(shí)驗(yàn)(49)
255藥物受體的相互作用(50)
26作用于離子通道的藥物(51)
261離子通道的基本特征(51)
262離子通道調(diào)節(jié)劑(52)
27核酸(52)
271核酸的基本結(jié)構(gòu)(52)
272作用于核酸的藥物(53)
參考文獻(xiàn)(53)
第3章 分子的多樣性——先導(dǎo)物的發(fā)現(xiàn)與優(yōu)化(55)
31分子的多樣性(55)
311分子多樣性的表示方法(55)
312藥物分子的結(jié)構(gòu)多樣性的生物學(xué)基礎(chǔ)(57)
32天然生物活性物質(zhì)——次級(jí)代謝產(chǎn)物(59)
321天然產(chǎn)物的防御和繁衍機(jī)制(59)
322次級(jí)代謝產(chǎn)物及其結(jié)構(gòu)修飾(61)
33組合化學(xué)(73)
331組合化學(xué)的一般概念(73)
332組合化學(xué)原理(74)
333組合合成方法(75)
334以天然產(chǎn)物為模板合成化合物庫(kù)(80)
34組合生物合成(85)
341原理(85)
342聚酮(86)
343肽類(88)
344其他(90)
35組合生物催化(91)
351原理(91)
352天然產(chǎn)物庫(kù)(91)
353生物催化用于組合化學(xué)(95)
36虛擬篩選(97)
361基于受體結(jié)構(gòu)設(shè)計(jì)組合庫(kù)(97)
362組合庫(kù)的設(shè)計(jì)(99)
363定向庫(kù)(101)
364基于知識(shí)的化合物庫(kù)(101)
37動(dòng)態(tài)組合化學(xué)(106)
371一般原理(106)
372動(dòng)態(tài)庫(kù)的構(gòu)建(107)
373舉例(108)
38多組分反應(yīng)(112)
381原理(112)
382多組分反應(yīng)的特點(diǎn)和在合成上的優(yōu)勢(shì)(113)
383重要的多組分反應(yīng)(115)
384多組分反應(yīng)在新藥研究中的應(yīng)用(117)
385發(fā)現(xiàn)新的多組分反應(yīng)的策略(118)
參考文獻(xiàn)(121)
第4章 分子的互補(bǔ)性——先導(dǎo)物的發(fā)現(xiàn)與優(yōu)化(128)
41分子識(shí)別與相互作用(128)
411靜電作用能(129)
412立體作用(131)
413疏水作用(132)
414蛋白質(zhì)配體相互作用中的溶劑作用(133)
42藥物受體相互作用的基團(tuán)貢獻(xiàn)(134)
421基團(tuán)貢獻(xiàn)的加和性(134)
422平均結(jié)合能(135)
43藥物受體相互作用及其原理(135)
431鎖鑰學(xué)說(shuō)(135)
432誘導(dǎo)契合學(xué)說(shuō)(136)
433受體構(gòu)象群的穩(wěn)定化——受體選擇模型(136)
44基于受體結(jié)構(gòu)的分子設(shè)計(jì)(140)
441基本概念(140)
442基于數(shù)據(jù)庫(kù)搜尋的分子設(shè)計(jì)(147)
443全新藥物分子設(shè)計(jì)(160)
444基于受體結(jié)構(gòu)的組合化學(xué)庫(kù)的設(shè)計(jì)(178)
45基于代謝產(chǎn)物的藥物分子設(shè)計(jì)(180)
451引言(180)
452細(xì)胞色素P450(182)
453化學(xué)結(jié)構(gòu)與氧化代謝的關(guān)系(183)
454基于代謝活化的分子設(shè)計(jì)(184)
455前藥(186)
456利用載體分子內(nèi)反應(yīng)的前藥(193)
457利用酶反應(yīng)或特異性結(jié)合作用設(shè)計(jì)前藥(197)
458逆代謝藥物設(shè)計(jì)——軟藥(199)
46抗體藥物(209)
461結(jié)構(gòu)互補(bǔ)性——抗體抗原的相互作用(209)
462單克隆抗體藥物(213)
463用作藥物轉(zhuǎn)釋載體的單克隆抗體(216)
464基于單克隆抗體結(jié)構(gòu)的分子設(shè)計(jì)(219)
465抗體導(dǎo)向酶催化前藥療法(222)
47高分子藥物和高分子前藥(229)
471引言(229)
472聚乙二醇化(229)
473HPMA共聚物作骨架(233)
474可生物降解的聚天然氨基酸(235)
475部位特異性高分子藥物(235)
48基于片斷的先導(dǎo)化合物的發(fā)現(xiàn)(236)
481基本原理(236)
482基于片斷發(fā)現(xiàn)先導(dǎo)物的方法(237)
49手性藥物(246)
491一般概念(247)
492手性藥物的藥代動(dòng)力學(xué)(251)
493手性藥物的藥效學(xué)(258)
參考文獻(xiàn)(261)
第5章 分子的相似性——先導(dǎo)物的發(fā)現(xiàn)與優(yōu)化(276)
51分子的相似性(276)
511分子相似性的定義和內(nèi)容(276)
512藥物分子設(shè)計(jì)中的相似性原理和方法(277)
52同系物、不飽和性、合環(huán)和開環(huán)(279)
521同系物(279)
522不飽和鍵(284)
523合環(huán)與開環(huán)(287)
53生物電子等排(292)
531電子等排的一般概念(292)
532一價(jià)基團(tuán)的電子等排體(293)
533二價(jià)基團(tuán)的電子等排體(303)
534三價(jià)原子或基團(tuán)的電子等排體(305)
535四取代原子的電子等排體(307)
536環(huán)與非環(huán)的電子等排體(308)
537Topliss決策法(311)
54過渡態(tài)類似物(315)
541原理(315)
542舉例(315)
55酶自殺性底物(325)
551氨己烯酸和加巴苦林(325)
552依氟鳥氨酸(326)
553克拉維酸和舒巴克坦(328)
554司來(lái)吉蘭(329)
555非那雄胺(330)
556谷胱甘肽S轉(zhuǎn)移酶抑制劑(331)
56肽模擬物(332)
561肽類化合物的結(jié)構(gòu)特征(332)
562肽模擬物(336)
563構(gòu)象限制(337)
564非肽結(jié)構(gòu)的肽模擬物(364)
57藥效團(tuán)(372)
571一般概念(372)
572藥效團(tuán)的表達(dá)方法(373)
573基于受體結(jié)合特征確定藥效團(tuán)——神經(jīng)氨酸酶抑制劑(383)
58優(yōu)勢(shì)結(jié)構(gòu)(384)
581基本概念(384)
582優(yōu)勢(shì)結(jié)構(gòu)的特征(385)
583內(nèi)源性物質(zhì)的優(yōu)勢(shì)結(jié)構(gòu)(390)
59基于配體分子的藥物設(shè)計(jì)(405)
591組胺H2受體拮抗劑(405)
5925羥色胺受體調(diào)節(jié)劑(406)
593Ⅱb/Ⅲa糖蛋白受體拮抗劑(407)
594白三烯受體拮抗劑(409)
595P物質(zhì)拮抗劑(410)
596維甲類化合物(411)
597甲氨蝶呤(413)
510攣藥(414)
5101同攣藥物(414)
5102異攣藥物(415)
參考文獻(xiàn)(417)
第6章 分子的相似性和互補(bǔ)性交匯——定量構(gòu)效關(guān)系(436)
61二維定量構(gòu)效關(guān)系(437)
611二維定量構(gòu)效關(guān)系的基本原理(438)
612生物活性表示法(438)
62二維定量構(gòu)效關(guān)系模型——Hansch藤田超熱力學(xué)分析(439)
621線性自由能相關(guān)參數(shù)(440)
622首批化合物的合成和Hansch藤田分析的要點(diǎn)(458)
623Hansch藤田分析用于藥物分子設(shè)計(jì)的實(shí)例(460)
624比較定量構(gòu)效關(guān)系(468)
63FreeWilson模型(470)
631經(jīng)典的FreeWilson模型(470)
632FujitaBan改良模型(475)
633FreeWilson模型與Hansch藤田方法的異同(477)
64分子連接性方法(477)
641原子的支化值——點(diǎn)價(jià)(478)
642分子連接性指數(shù)的計(jì)算(480)
643分子連接性指數(shù)的物理化學(xué)意義(483)
644分子連接性在QSAR分析中的應(yīng)用(438)
645分子連接性指數(shù)與Hansch藤田分析的關(guān)系(484)
65三維定量構(gòu)效關(guān)系(484)
651三維定量構(gòu)效關(guān)系的一般特征(485)
652三維定量構(gòu)效關(guān)系分析法(491)
653舉例(498)
66全息定量構(gòu)效關(guān)系(504)
661分子全息的生成(504)
662HQSAR模型表示法(505)
663舉例(505)
參考文獻(xiàn)(506)
第7章 藥物分子設(shè)計(jì)的整合性(510)
71新藥創(chuàng)制的價(jià)值鏈(510)
72結(jié)構(gòu)優(yōu)化(511)
73分子設(shè)計(jì)策略的整合性(511)
731藥學(xué)性質(zhì)的優(yōu)化(512)
732藥代動(dòng)力學(xué)性質(zhì)的優(yōu)化(513)
733藥效學(xué)性質(zhì)的優(yōu)化(514)
734安全性評(píng)價(jià)(515)
735虛擬篩選(515)
74分子設(shè)計(jì)方法的整合性(516)
參考文獻(xiàn)(517)
附錄藥物化學(xué)名詞(519)
索引(526)
后記(539)