高通量DNA測序和基因組學(xué)新型技術(shù)

定　價(jià)：￥98.00

作　者：	（澳）米切爾森
出版社：	科學(xué)出版社
叢編項(xiàng)：
標(biāo)　簽：	遺傳學(xué)

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ISBN：	9787030203465	出版時(shí)間：	2008-01-01	包裝：	精裝
開本：	16	頁數(shù)：	381	字?jǐn)?shù)：

內(nèi)容簡介

　　三十年前，由Sanger和G訂bert分別建立了DNA雙脫氧測序和化學(xué)測序技術(shù)?，F(xiàn)在DNA測序的規(guī)模逐漸擴(kuò)大，從每天能讀幾千個堿基對序列的小規(guī)模測序，發(fā)展到如今每天能夠進(jìn)行成千上萬個序列的精確測定，成為數(shù)十億美元的“產(chǎn)業(yè)”。世界上幾個大的測序中心建立了大規(guī)模的基因組測序平臺，支持幾乎所有大學(xué)和大型醫(yī)院的DNA測序工作。國際生物信息學(xué)中心擁有存儲約一千五百萬堿基對序列信息的能力，我們正處于一個“后基因組”時(shí)代。然而DNA測序在生命科學(xué)和醫(yī)學(xué)的許多領(lǐng)域，仍然是一個主要的診斷和研究手段。這種強(qiáng)勁的需求，推動了新的測序技術(shù)的發(fā)展。這些新技術(shù)既不用電泳，也不用Sanger測序方法，而是通過DNA合成的方法進(jìn)行測序，包括在固相表面上進(jìn)行的多重平行測序反應(yīng)，每一個循環(huán)的數(shù)據(jù)通過成像的方法獲得。最近有一項(xiàng)由454生命科學(xué)和馬普研究所制定的計(jì)劃，使用合成法測序技術(shù)測定穴居人基因組，該計(jì)劃顯示了這些新的DNA測序技術(shù)在后基因組學(xué)研究中的強(qiáng)大作用。這將成為第二代全人類基因組項(xiàng)目，而且預(yù)計(jì)將進(jìn)一步陜速提升我們對人類基因組生物學(xué)知識的認(rèn)識，加深我們對人類遺傳性疾病機(jī)制的了解。本書匯集了DNA測序技術(shù)的一些新的進(jìn)展，全書的框架由一系列綜述組成，主要包括Sange，和SBS測序方法的進(jìn)展（Kumar and Fuller）、毛細(xì)管電泳和微型集成系統(tǒng)（Xiong and Cheng）、MS測序（Ehrich et al.）和應(yīng)用（Mitchelson et al．）。還包括了一些最新的進(jìn)展，如SBS技術(shù)的新進(jìn)展（Margulies et al．）、核酸染料SBS測序方法（Edwards et al．）、通過循環(huán)合成實(shí)現(xiàn)單分子測序（Hebert and Brasiavsky）、納米孔測序（Lee and Meller），以及陣列DNA的光標(biāo)測（Schwartz et al．）。在書的最后，討論了基因組拼接（Mc（；rath）中的生物信息學(xué)工具、古代和環(huán)境DNA樣品（Kowalchuket al．）的測序和SBS序列拼接工具（Keith et al．）等SBs測序的新應(yīng)用。作者真誠希望此書的出版和發(fā)行能夠引起學(xué)生和研究人員對測序這個關(guān)鍵基因組學(xué)技術(shù)的興趣，并引發(fā)相關(guān)的技術(shù)革新。

作者簡介

　　Keith Mitchelson是博奧生物有限公司，生物芯片北京國家工程　研究中心的研究員，也是清華大學(xué)醫(yī)學(xué)院醫(yī)學(xué)系統(tǒng)生物學(xué)研究中心的訪問學(xué)者。

圖書目錄

現(xiàn)有技術(shù)
　第一章概述：DNA測序技術(shù)進(jìn)展
　　1　引言
　 1.1　超高通量測序能力的生物技術(shù)意義
　　2　測序前沿技術(shù)
　 2.1　毛細(xì)管電泳和Sanger測序法
　 2.2　高通量毛細(xì)管微陣列測序
　 2.3　染料和檢測器
　 2.4　微型芯片電泳
　 2.5　基于微型毛細(xì)管芯片的毛細(xì)管電泳測序
　 2.6　質(zhì)譜測序
　　3　固相陣列測序裝置
　 3.1　超敏感的檢測器和測序儀
　 3.2　合成測序
　 3.3 DNA單分子測序
　 3.4　雜交重組測序
　　4　技術(shù)展望
　 4.1　納米孔膜
　 4.2　DNA合成的直接電學(xué)檢測
　　5　基因組短片段測序應(yīng)用
　 5.1　基于重測序的基因分型
　　 5.1.1　polony基因分型
　　 5.1.2　焦磷酸測序的基因分型
　　 5.1.3　多態(tài)性比率測序
　　 5.1.4　BEAMing
　　 5.2　古生物基因組
　　 5.3　洞人基因組
　　 5.4　元基因組
　　 5.5　重復(fù)DNA序列的SAM測序
　　 5.6　轉(zhuǎn)錄組和表達(dá)RNA序列分析
　　　5.7　MPSS和基因組分析
　 5.8　光學(xué)定位
　　6　小結(jié)
　　參考文獻(xiàn)
　第二章　芯片毛細(xì)管電泳與系統(tǒng)遺傳分析系統(tǒng)
　　摘要
　　1　引言
　 1.1　各種基于芯片的毛細(xì)管電泳系統(tǒng)
　　2　芯片設(shè)計(jì)和流體操作
　 2.1　芯片設(shè)計(jì)
　 2.2　流體操作
　　3　材料和制作
　 3.1　材料
　 3.2　制作
　　 3.2.1　玻璃材料的制作步驟
　　 3.2.2　高分子材料的制作步驟
　　4　檢測
　 4.1　光學(xué)檢測
　　 4.1.1　激光誘導(dǎo)的熒光檢測
　　 4.1.2　吸光度檢測
　　 4.1.3　化學(xué)發(fā)光檢測
　　 4.2　電化學(xué)檢測
　　 4.2.1 電流檢測
　　 4.2.2 電導(dǎo)檢測
　　 4.2.3 電位檢測
　 4.3　質(zhì)譜
　　5　表面修飾
　 5.1　動態(tài)包被
　　 5.1.1　玻璃／石英基片的包被
　　5.1.2　PMMA基片的包被
　　 5.1.3　PDMS基片的包被
　　 5.2　永久性包被
　　 5.2.1　玻璃／石英基片的永久包被
　　 5.2.2　PMMA基片的永久包被
　　 5.2.3　PDMS基片的永久包被
　　6　應(yīng)用
　　 6.1　核酸分析
　　 6.1.1　篩分介質(zhì)
　　 6.1.2　依大小排列DNA片段
　　 6.1.3　基因分型
　　7　DNA測序
　……
　第三章　應(yīng)用MALDI-TOF質(zhì)譜法比較序列分析——利用知己序列尋找新的序列
　第四章　基于核苷酸偶聯(lián)染料的DNA測序進(jìn)展
合成測序技術(shù)平臺
　第五章　454生命科學(xué)（454Lif Sciences）皮升級測序系統(tǒng)　
　第六章　合成法DNA測序的集成系統(tǒng)　
單分子測序
　第七章　單分子熒光顯微鏡及其在基于循環(huán)合成的單分子測序中的應(yīng)用
　第八章　基于單個DNA鏈的納米級核苷酸序列快速測序
　第九章　全基因組水平的單分子測序系統(tǒng)　
序列驗(yàn)證和分析
　第十章　測序和誘導(dǎo)突變相結(jié)合有利于短讀長獲得全新百萬級的DNA片段序列
　第十一章　基因組測序和拼接
　第十二章　具有高污染風(fēng)險(xiǎn)的樣品——古DNA和環(huán)境DNA核酸序列信息的有效測定
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