非編碼RNA

前言
第1章 核糖核酸調(diào)節(jié)子概述
　1.1 引言
　1.2 核糖核酸的特性
　1.3 編碼和非編碼轉錄物
　1.4 RNA調(diào)節(jié)子的功能
　1.5 展望
　參考文獻
第2章 內(nèi)含子和非編碼RNA：真核生物復雜性的隱含層
　2.1 引言
　2.2 非編碼RNA代表了哺乳動物及幾乎所有復雜生物基因組的主要產(chǎn)物
　2.3 內(nèi)含子和ncRNA是否代表了基因表達的第二個層次
　2.4 內(nèi)含子
　2.5 非編碼RNA
　2.6 非編碼RNA的起源和命名法
　2.7 “基因”的新定義——一個具有順式作用調(diào)節(jié)元件的轉錄集合
　2.8 涉及RNA的復雜遺傳現(xiàn)象
　2.9 RNA結合和信號轉導蛋白
　2.10 ncRNA的可能功能
　2.11 一個新的遺傳學
　參考文獻
第3章 基于計算發(fā)現(xiàn)非編碼RNA
　3.0 摘要
　3.1 引言
　3.2 蛋白質編碼基因和ncRNA基因的發(fā)現(xiàn)
　3.3 用戶定制的ncRNA基因發(fā)現(xiàn)程序
　3.4 可重新配置的ncRNA基因發(fā)現(xiàn)程序
　3.5 從頭開始的ncRNA基因發(fā)現(xiàn)——在沒有序列或結構先驗知識的情況下尋找基因
　3.6 ncRNA基因預測程序的現(xiàn)狀與展望
　致謝
　參考文獻
第4章 Xist RNA與染色質結合并導致基因沉默
　4.0 摘要
　4.1 引言
　4.2 Xist基因
　4.3 胚胎中Xist介導基因沉默的起始
　4.4 Xist表達的調(diào)控——計數(shù)和選擇X染色體
　4.5 Xist發(fā)揮功能的機制
　4.6 一種Xist功能模型
　4.7 關于進化的思考
　4.8 結語
　參考文獻
第5章 果蠅中的劑量補償作用：核蛋白體復合物介導的轉錄上調(diào)
　5.1 概述
　5.2 劑量補償作用的不同機制
　5.3 劑量補償作用的基本原則
　5.4 通過染色質修飾的雄性特異的高轉錄
　5.5 雄性特異劑量補償實現(xiàn)依賴于性別致死抑制子的缺失
　5.6 DCC的組成
　5.7 roX RNA是染色質進入位點
　5.8 DCC的有序組裝
　5.9 MSL蛋白的特殊功能以及它們之間的相互作用
　5.10 roX RNA是劑量補償所必需的
　5.11 模型和展望
　參考文獻
第6章 H19印跡RNA的結構、調(diào)節(jié)和功能
　6.0 摘要
　6.1 引言
　6.2 調(diào)節(jié)性RNA
　6.3 H19的印跡
　6.4 H19的組織特異性表達
　6.5 H19的保守序列
　6.6 H19與生長控制
　6.7 H19 RNA是否有功能？
　參考文獻
第7章 microRNA
　7.0 摘要
　7.1 引言
　7.2 miRNA的發(fā)現(xiàn)和分離
　7.3 miRNA的特征
　7.4 lin-4的作用機制
　7.5 參與miRNA產(chǎn)生與功能的蛋白質
　7.6 尋找miRNA的靶位點
　7.7 人工miRNA
　7.8 結語
　參考文獻
第8章 siRNA和miRNA：微小，但是強大
　8.0 摘要
　8.1 micoRNA
　8.2 小干擾RNA
　8.3 siRNA引發(fā)RNAi的應用
　參考文獻
第9章 植物中的轉錄后基因沉默
　9.0 摘要
　9.1 引言
　9.2 多條途徑產(chǎn)生雙鏈RNA起始植物PTGS
　9.3 從dsRNA到RNA降解途徑的沉默模型
　9.4 PTGS在植物中的作用
　9.5 結論
　參考文獻
第10章 RNA指導的DNA甲基化及染色質修飾
　10.0 摘要
　10.1 引言
　10.2 同源依賴的基因沉默
　10.3 RNA指導的DNA甲基化(RdDM)現(xiàn)象的發(fā)現(xiàn)及其特征
　10.4 RdDM的分子機制
　10.5 RNA指導的染色質修飾
　10.6 RNA沉默的進化機制
　10.7 展望
　致謝
　參考文獻
第11章 腦特異的非信使RNA
　11.0 摘要
　11.1 引言
　11.2 腦內(nèi)的大分子nmRNA
　11.3 腦內(nèi)的snmRNA
　11.4 展望
　致謝
　參考文獻
第12章 snoRNA世界的新領域
　12.0 摘要
　12.1 引言
　12.2 修飾指導snoRNA的兩大家族
　12.3 snoRNP的生成
　12.4 指導snRNA修飾的新snoRNA
　12.5 尋找RNA靶點時發(fā)現(xiàn)的孤兒snoRNA
　12.6 腦特異的印跡snoRNA
　12.7 修飾指導snoRNA的古菌同源物
　12.8 古菌tRNA同樣是靶點
　12.9 結語
　致謝
　補充證據(jù)
　參考文獻
第13章 植物細胞中非編碼RNA或短可讀框編碼RNA研究的新進展
　13.0 摘要
　13.1 存在于植物和動物中沒有長ORF的mRNA
　13.2 僅含有sORF的mRNA參與植物的生長和發(fā)育
　13.3 作用的可能機制
　13.4 展望：小調(diào)控RNA和sORF編碼的寡肽作為新基因表達調(diào)控子
　參考文獻
第14章 發(fā)育活化和應激誘導的非編碼黑腹果蠅hsrw基因整合其他核轉錄物的翻譯后加工　
　14.0 摘要
　14.1 引言
　14.2 果蠅中93D或入hsrw基因表現(xiàn)出獨特和保守的可誘導性，但顯然不產(chǎn)生蛋白質　
　14.3 果蠅中入hsrw基因具有獨特的保守結構，卻很少有堿基序列保守
　14.4 hsrw基因產(chǎn)生多個非編碼轉錄物
　14.5 hsrw基因在發(fā)育過程中廣泛表達
　14.6 hsrw基因啟動子區(qū)是復合體
　14.7 盡管是非編碼轉錄物，hsrw是有功能的
　14.8 hsrw轉錄物的功能
　14.9 未來展望
　致謝
　參考文獻
第15章 adapt基因的RNA轉錄物作為核糖核酸調(diào)節(jié)子
　15.0 摘要
　15.1 背景
　15.2 adapt15和adapt33的鑒定
　15.3 adapt15和adapt33的作用機制
　15.4 結語
　參考文獻
第16章 顯性非編碼微衛(wèi)星擴展紊亂中RNA的致病機制
　16.0 摘要
　16.1 引言
　16.2 Ⅰ型肌強直性營養(yǎng)不良：基因的發(fā)現(xiàn)和致病模型的提出
　16.3 8型脊髓小腦共濟失調(diào)
　16.4 10型脊髓小腦共濟失調(diào)
　16.5 DM1、SCA8和SCA10之間臨床和分子上的差別
　16.6 Ⅱ型肌強直性營養(yǎng)不良
　16.7 肌強直性營養(yǎng)不良中RNA的致病機制
　16.8 其他非編碼擴展失調(diào)
　16.9 總結
　參考文獻
第17章 由細菌染色體編碼的非編碼RNA
　17.0 摘要
　17.1 概述
　17.2 引言
　17.3 持家sRNA
　17.4 調(diào)控的反義RNA進入兩種境地
　17.5 反式編碼的反義RNA MicF是一個應激反應的調(diào)控因子
　17.6 sRNA可以調(diào)控多個基因
　17.7 一個調(diào)控RNA——兩個(或多個)靶RNA
　17.8 多個RNA作用于同一個靶
　17.9 sRNA的另一個作用：破壞同一個操縱子下的基因協(xié)調(diào)表達
　17.10 某些sRNA需要輔助蛋白
　17.11 例外(？)：E.coli染色體順式編碼反義RNA
　17.12 通過sRNA和蛋白質間相互作用調(diào)控基因表達
　17.13 sRNA的結構
　17.14 細胞中穩(wěn)定或不穩(wěn)定？
　17.15 初級或加工后轉錄本
　17.16 新sRNA的作用是什么？
　17.17 通過什么樣的機制發(fā)揮作用？
　17.18 有多少個sRNA？
　17.19 結論
　致謝
　參考文獻
第18章 我們數(shù)量眾多：非編碼調(diào)節(jié)RNA和Hfq
　18.0 摘要
　18.1 非編碼RNA
　18.2 非編碼RNA在革蘭陰性菌中的功能
　18.3 革蘭陽性細菌中非編碼RNA
　18.4 調(diào)節(jié)調(diào)節(jié)子。ncRNA如何被調(diào)節(jié)？
　18.5 RNA結合蛋白Hfq與ncRNA
　18.6 Hfq的功能如何？
　18.7 Hfq如何與RNA相互作用？
　18.8 結論
　致謝
　參考文獻
中西文對照
索引