酶活檢測(cè)：高能量篩選，遺傳選擇以及指紋分析

引言
酶活檢測(cè)
第一部分：高通量篩選
第二部分：遺傳選擇
第三部分：酶指紋分析
其他領(lǐng)域中的酶活檢測(cè)
如何使用本書(shū)
參考文獻(xiàn)
第一部分高通量篩選
1根據(jù)顏色變化定量檢測(cè)水解酶的活性和選擇性
11概述
12用顯色底物的直接檢測(cè)法
13使用耦聯(lián)反應(yīng)的間接檢測(cè)法——pH指示劑
131綜述利用pH指示劑進(jìn)行定量檢測(cè)
132應(yīng)用
133與其他方法對(duì)比
14選擇性的估算和測(cè)定
141無(wú)參考化合物的選擇性值的估算
142利用參考化合物定量測(cè)定選擇性（Quick E及相關(guān)方法）
143應(yīng)用
144優(yōu)勢(shì)與不足
參考文獻(xiàn)
2檢測(cè)酶對(duì)映體選擇性的高通量篩選體系
21引言
22基于紫外/可見(jiàn)光光譜的檢測(cè)方法
221用手性對(duì)硝基苯酯的動(dòng)力學(xué)拆分來(lái)篩選脂肪酶或酯酶的檢測(cè)
方法
222基于酶耦聯(lián)的紫外／可見(jiàn)光的脂肪酶和酯酶檢測(cè)
223酶法測(cè)定對(duì)映體過(guò)剩
224基于紫外/可見(jiàn)光的酶免疫測(cè)定作為測(cè)量對(duì)映體過(guò)剩的一種
手段
225其他基于紫外／可見(jiàn)光的ee檢測(cè)方法
23使用熒光的檢測(cè)方法
231基于傘形酮的體系
232用DNA微陣列進(jìn)行熒光檢測(cè)
233其他基于熒光的ee檢測(cè)方法
24基于質(zhì)譜的檢測(cè)方法
241使用同位素標(biāo)記的MS檢測(cè)方法
25基于核磁共振波譜的檢測(cè)方法
26基于傅里葉轉(zhuǎn)換紅外光譜法的脂肪酶和酯酶檢測(cè)方法
27基于氣相色譜的檢測(cè)方法
28基于HPLC的檢測(cè)方法
29基于毛細(xì)管陣列電泳的檢測(cè)方法
210基于圓二色光譜的檢測(cè)方法
211基于表面增強(qiáng)共振拉曼散射的檢測(cè)方法
212結(jié)論
參考文獻(xiàn)
3氧化還原酶的高通量篩選方法
31引言
32各種氧化還原酶的高通量方法
321脫氫酶
322氧化酶
323加氧酶
324漆酶
33小結(jié)
參考文獻(xiàn)
4檢測(cè)方法的工業(yè)前景
41引言
42化學(xué)品定制中一個(gè)有效的生物催化劑篩選的先決條件
43基于光譜（紫外/可見(jiàn)光及熒光）的適用于CCM的篩選方法
431基于產(chǎn)物本身光譜性質(zhì)的光譜方法
432基于產(chǎn)物連續(xù)轉(zhuǎn)化的光譜法
44基于常規(guī)儀器檢測(cè)的適應(yīng)于CCM的篩選方法
441以流動(dòng)注射式NMR作為高通量篩選酶活的分析工具
442用于高通量篩選酶活的快速LC/MS方法
45結(jié)論
參考文獻(xiàn)
第二部分遺傳選擇
5基于瓊脂平板的檢測(cè)
51引言
511酶的定向進(jìn)化：篩選或選擇
512瓊脂平板篩選的一般性質(zhì)
52基于易化篩選的方法
521酰胺酶
522酯酶
523糖苷合成酶
524半乳糖氧化酶
525單胺氧化酶
526P450單加氧酶
527類(lèi)胡蘿卜素的生物合成
528生物素連接酶
53體內(nèi)選擇法
531糖苷合成酶
532預(yù)苯酸脫水酶/分支酸變位酶
533萜環(huán)化酶
534色氨酸的生物合成
535核糖醇脫氫酶
536內(nèi)含肽
537氨酰tRNA合成酶
54總結(jié)及展望
參考文獻(xiàn)
6酶編碼基因的高通量篩選和選擇
61引言
62高通量篩選和選擇的基礎(chǔ)
63用噬菌體展示對(duì)酶進(jìn)行高通量選擇
64用細(xì)胞展示對(duì)酶進(jìn)行高通量選擇
65體內(nèi)遺傳篩選及選擇
66篩選異源蛋白的表達(dá)和穩(wěn)定性
661引言
662異源表達(dá)的篩選方法
663異源表達(dá)的定向進(jìn)化——近期實(shí)例
67體外區(qū)室化
68雙乳液中的IVC
69總結(jié)評(píng)述
參考文獻(xiàn)
7化學(xué)互補(bǔ)
71引言
72互補(bǔ)檢測(cè)法
721引言
722早期的互補(bǔ)檢測(cè)法
723互補(bǔ)法進(jìn)行酶學(xué)研究
724互補(bǔ)法進(jìn)行定向進(jìn)化
73化學(xué)互補(bǔ)法的發(fā)展
731引言
732三雜交檢測(cè)法
733化學(xué)互補(bǔ)法
74化學(xué)互補(bǔ)法的應(yīng)用
741引言
742酶抑制劑相互作用
743糖苷合成酶的進(jìn)化
75結(jié)論
參考文獻(xiàn)
8篩選新酶的分子途徑
81引言
82在能培養(yǎng)的微生物中用核酸探針來(lái)探測(cè)編碼酶的基因
821現(xiàn)有知識(shí)和應(yīng)用
822探針技術(shù)的缺陷和創(chuàng)新方法的需求
83微生物的宏基因組：一個(gè)新的天然產(chǎn)物和酶的源泉
831獲得不能培養(yǎng)的生物的多樣性：生物群落DNA概念
832拆分代謝功能：BAC策略
833分析宏基因組文庫(kù)：基于活性和基于序列的策略比較，特殊基因組
的富集以及高通量篩選方法的應(yīng)用
834宏基因組成果的延續(xù)
84總結(jié)評(píng)述
參考文獻(xiàn)
第三部分酶指紋分析
9解脂酶的熒光探針
91引言
92用于酶活檢測(cè)的熒光底物
921三酰甘油脂肪酶的活性檢測(cè)
922二酰甘油脂肪酶的活性檢測(cè)
923膽固醇酯酶的活性檢測(cè)
924磷脂酶的活性檢測(cè)
925神經(jīng)磷脂酶的活性檢測(cè)
93用于活性酶定量分析和功能酶指紋分析的熒光抑制物
931分析脂肪酶和酯酶
932探測(cè)酶的生物物理性質(zhì)
933基于親和性的蛋白質(zhì)組圖譜繪制
參考文獻(xiàn)
10水解酶的指紋分析方法
101引言
1011一個(gè)酶一個(gè)底物
1012酶活圖譜
1013鑒別微生物菌株的APIZYM系統(tǒng)
102水解酶的指紋分析
1021用熒光和顯色底物進(jìn)行指紋分析
1022用間接顯色檢測(cè)進(jìn)行指紋分析
1023雞尾酒指紋分析
103用指紋數(shù)據(jù)進(jìn)行分類(lèi)
1031指紋的表示
1032數(shù)據(jù)的歸一化
1033酶指紋的等級(jí)聚類(lèi)
1034底物相似性的分析
104展望
參考文獻(xiàn)
11蛋白酶底物圖譜
111引言
112功能性蛋白酶突破肽底物文庫(kù)
1121基于溶液的肽底物文庫(kù)
1122基于固體支持物的肽文庫(kù)的合成與篩選
1123確定蛋白酶底物特異性的基因方法
113大分子底物的鑒定
1131鑒定大分子底物的基因方法
1132鑒定蛋白酶底物的蛋白質(zhì)組學(xué)方法
114結(jié)論
參考文獻(xiàn)
12陣列上的酶活檢測(cè)
121引言
122固定化策略
1221共價(jià)和非共價(jià)固定化
1222定點(diǎn)和非定點(diǎn)固定化
1223肽鏈/小分子的定點(diǎn)固定化
1224蛋白質(zhì)的定點(diǎn)固定化
123檢測(cè)酶活的微陣列方法
1231用蛋白質(zhì)陣列進(jìn)行酶活檢測(cè)
1232用肽/小分子底物陣列進(jìn)行酶活檢測(cè)
1233用其他陣列進(jìn)行酶活檢測(cè)
124結(jié)論
參考文獻(xiàn)
中文索引
英文索引