化學(xué)基因組學(xué)

前言
第1章 什么是化學(xué)基因組學(xué)?
第2章 芯片上的化學(xué)基因組學(xué)
2.1 引言
2.2 將計(jì)算機(jī)技術(shù)應(yīng)用到化學(xué)基因組學(xué)
2.2.1 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)
2.2.2 蛋白質(zhì)的同源模建
2.2.3 選擇適當(dāng)?shù)男》肿?br />2.2.4 蛋白質(zhì)功能的預(yù)測
2.3 案例研究
2.3.1 同源模型構(gòu)建
2.3.2 基于蛋白質(zhì)序列的方法
2.3.3 基于蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的方法
參考文獻(xiàn)
第3章 化學(xué)基因組學(xué)過程的優(yōu)化
3.1 引言
3.2 化學(xué)基因組學(xué)的化合物庫
3.2.1 化學(xué)基因組學(xué)化合物庫的設(shè)計(jì)
3.2.2 化合物質(zhì)量
3.2.3 數(shù)據(jù)分析及整合
3.3 篩選進(jìn)展：化學(xué)基因組學(xué)途徑
3.3.1 靶點(diǎn)的產(chǎn)生
3.3.2 分析平臺
3.3.3 離子通道篩選的化學(xué)基因組學(xué)方法
3.3.4 確立設(shè)計(jì)一個(gè)持久有效的分析過程
3.3.5 重要的動力學(xué)因素
3.3.6 分析過程的穩(wěn)定性以及驗(yàn)證
3.3.7 小結(jié)
3.4 HTS技術(shù)及過程
3.4.1 選擇HTS平臺
3.4.2 該途徑的量度（n個(gè)靶點(diǎn)×y個(gè)化合物）
3.4.3 假陽性和假陰性可接受的比率
3.4.4 合適的精密度和準(zhǔn)確性
3.4.5 來自不同篩選階段的數(shù)據(jù)信息
3.4.6 HTS平臺與化合物處理的整合
3.5 結(jié)論
致謝
參考文獻(xiàn)
第4章 化學(xué)基因組學(xué)中基于微芯片技術(shù)的高通量篩選
4.1 引言
4.2 微陣列
4.2.1 轉(zhuǎn)錄組學(xué)（transcriptomics）：DNA陣列
4.2.2 化學(xué)基因組學(xué)：小分子陣列
4.2.3 蛋白質(zhì)組學(xué)：大分子陣列
4.2.4 基于細(xì)胞的陣列：細(xì)胞組學(xué)方法
4.3 微流體
4.4 小結(jié)與展望
致謝
參考文獻(xiàn)
第5章 小分子在化學(xué)基因組學(xué)中的應(yīng)用：有前景的高通量方法
5.1 引言
5.2 小分子在化學(xué)基因組學(xué)/蛋白質(zhì)組學(xué)中：單一化合物方法與文庫方法
5.2.1 單個(gè)化合物作為探詢配體
5.2.2 化合物庫
5.3 庫的設(shè)計(jì)與選擇
5.3.1 化學(xué)基因組學(xué)中小分子探針的設(shè)計(jì)
5.3.2 基于組合片段的設(shè)計(jì)
5.3.3 動態(tài)配體自組裝
5.3.4 用于產(chǎn)生選擇性GPCR配體的多結(jié)合位點(diǎn)方法
5.3.5 用于設(shè)計(jì)篩選片段的Graffinity方法
5.3.6 基于片段的高通量結(jié)晶
5.3.7 ADME傾向性的設(shè)計(jì)：透膜小分子庫
5.4 復(fù)用與高通量技術(shù)
5.4.1 高通量基于細(xì)胞的檢測（細(xì)胞陣列）
5.4.2 反向雙雜交體系
5.4.3 平行親和柱分離
5.4.4 平行凝膠排阻色譜法（parallel size-exclusion chromatography）：復(fù)雜混合物中快速親和選擇
5.4.5 化學(xué)微陣列
5.4.6 組合tehtering用液相平行合成
5.5 小結(jié)
致謝
參考文獻(xiàn)
第6章 用于快速蛋白質(zhì)鑒定的多功能光探針
6.1 引言
6.2 主要光活性基團(tuán)的化學(xué)性質(zhì)
6.3 提高光親和標(biāo)記通量的生物素化重氮甲烷
6.4 在固態(tài)基質(zhì)上的光親和標(biāo)記
參考文獻(xiàn)
第7章 定義脂質(zhì)組：一個(gè)新的治療靶標(biāo)
7.1 引言
7.2 治療學(xué)中主要的脂質(zhì)組學(xué)靶標(biāo)
7.2.1 磷酸肌醇
7.2.2 神經(jīng)鞘脂類
7.2.3 溶血磷脂類
7.3 脂質(zhì)組分析的方法
7.3.1 分析型脂質(zhì)組學(xué)
7.3.2 功能性脂質(zhì)組學(xué)
7.4 結(jié)語
參考文獻(xiàn)
第8章 多巴胺能神經(jīng)遞質(zhì)相關(guān)的基因多態(tài)性的藥物毒理學(xué)表現(xiàn)
8.1 多巴胺系統(tǒng)的概述
8.1.1 多巴胺的合成、功能和代謝
8.1.2 主要多巴胺能系統(tǒng)及與精神病理學(xué)的關(guān)聯(lián)
8.1.3 多巴胺系統(tǒng)的遺傳藥理學(xué)
8.2 鑒定基因多態(tài)性的方法
8.3 多巴胺受體
8.3.1 多態(tài)的多巴胺D2受體基因
8.3.2 多巴胺D2受體的遺傳藥理學(xué)
8.3.3 多巴胺D3受體基因的多態(tài)性
8.3.4 多巴胺D3受體基因的遺傳藥理學(xué)
8.3.5 高多態(tài)的多巴胺D4受體基因
8.3.6 多巴胺D4受體的遺傳藥理學(xué)
8.4 多巴胺轉(zhuǎn)運(yùn)體
8.4.1 多巴胺轉(zhuǎn)運(yùn)體及其變異體
8.4.2 多巴胺轉(zhuǎn)運(yùn)體的遺傳藥理學(xué)
參考文獻(xiàn)
第9章 用于藥學(xué)產(chǎn)業(yè)中DNA專利申請?jiān)u估的近似線性配對算法
9.1 引言
9.2 結(jié)果
9.3 結(jié)論
參考文獻(xiàn)