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常用生物數(shù)據(jù)分析軟件

常用生物數(shù)據(jù)分析軟件

定 價:¥65.00

作 者: 王俊、叢麗娟、鄭洪坤
出版社: 科學(xué)出版社
叢編項:
標(biāo) 簽: 生物科學(xué)的理論與方法

ISBN: 9787030206220 出版時間: 2008-01-01 包裝: 平裝
開本: 16 頁數(shù): 364 字?jǐn)?shù):  

內(nèi)容簡介

  本書較為系統(tǒng)全面地介紹了生物信息學(xué)分析各個方面的軟件用法,結(jié)合光盤具體實例,方便使用。全書共分8章,內(nèi)容包括:Unix/Linux操作系統(tǒng)介紹,介紹了基本的Unix/Linux操作命令;數(shù)據(jù)的基本處理,介紹了如何處理常用的生物信息學(xué)數(shù)據(jù);序列的比對,介紹了常用比對軟件的用法及其在應(yīng)用過程中要注意的問題;基因組/基因的注釋,介紹了Coding和.Non-Codoing基因的預(yù)測方法;SNP分析,介紹了常用的從生物學(xué)數(shù)據(jù)中尋找SNP的軟件;進化分析專題,介紹了幾種分子進化分析軟件,內(nèi)容涉及進化樹的構(gòu)建、Ka/Ks的計算等;基因表達分析專題,介紹了EST、及生物芯片分析的流程和方法;蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測,介紹了蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)預(yù)測的流程及方法。本書適合于生物信息學(xué)專業(yè)本科生及研究生使用。

作者簡介

暫缺《常用生物數(shù)據(jù)分析軟件》作者簡介

圖書目錄


前言
第1章 Unix/Linux操作系統(tǒng)介紹
1.1 遠(yuǎn)程登錄
1.2 文件的復(fù)制、刪除和移動命令
1.3 目錄的創(chuàng)建、刪除及更改目錄命令
1.4 文本查看命令
1.5 文本處理命令
1.6 改變文件或目錄的權(quán)限命令
1.7 備份與壓縮命令
1.8 磁盤及系統(tǒng)管理
1.9 軟件安裝簡介
1.10 其他
第2章 數(shù)據(jù)的基本處理
2.1 數(shù)據(jù)常用格式介紹
2.2 測序原理介紹
2.3 華圖轉(zhuǎn)化(Phred)
2.4 文件轉(zhuǎn)換(phd2fasta)
2.5 載體屏蔽(cross_match)
2.6 序列聚類拼接
2.7 Consed
2.8 引物設(shè)計(Primer3)
主要參考文獻
第3章 序列的比對
3.1 全局比對
3.2 局部比對
主要參考文獻
第4章 基因組/基因的注釋
4.1 重復(fù)序列分析
4.2 RNA分析
4.3 基因預(yù)測
4.4 基因功能注釋
主要參考文獻
第5章 SNP分析
5.1 Polyphred
5.2 SNPdetector
5.3 cross_match
主要參考文獻
第6章 進化分析專題
6.1 Phylip
6.2 Paml
6.3 KaKs_Calculator
6.4 FGF
6.5 MEGA
主要參考文獻
第7章 基因表達分析專題
7.1 EST表達序列標(biāo)簽分析
7.2 生物芯片分析
7.3 Motif預(yù)測
主要參考文獻
第8章 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測
8.1 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)知識介紹
8.2 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測方法
8.3 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測的Threading方法
8.4 蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)預(yù)測流程介紹
主要參考文獻

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