生物信息學中計算機技術應用

第1章 緒論
1.1 引言
1.2 生物信息學
1.2.1 生物信息學產生的背景
1.2.2 生物學數(shù)據庫
1.2.3 生物信息學的主要研究內容
1.2.4 與生物信息學關系密切的數(shù)學領域
1.2.5 與生物信息學密切相關的計算機科學技術
1.2.6 生物信息學工業(yè)
1.3 生物信息學中的計算機技術應用
1.4 蛋白質結構模型
1.5 生物系統(tǒng)背景知識
1.6 本書研究的內容
1.7 本書的組織結構
1.8 本章小結
第2章 、生物信息學中的結構比較
2.1 結構比對
2.2 VAST與DALI
2.3 全局與局部結構比較
2.4 利用數(shù)學記號進行結構比較
2.5 生物大分子表面結構的比較
2.6 本章小結
第3章 三維結構比較
3.1 三維結構比較研究
3.2 基于體模型的比較
3.2.1 外形特點分析
3.2.2 特征提取與匹配
3.3 基于三維模型幾何相似性的比較
3.3.1 基于輪廓的幾何相似性比較算法
3.3.2 基于拓撲結構的幾何相似性比較算法
3.3.3 基于視覺的幾何相似性比較算法
3.4 三維模型相似性度量方法的分類
3.5 本章小結
第4章 蛋白質三維結構可視化
4.1 蛋白質存儲結構分析
4.2 PDB文件中對于大分子結構的描述
4.3 MATLAB下蛋白質三維結構可視化實現(xiàn)
4.4.本章小結
第5章 建立蛋白質三維結構頻譜
5.1 三維物體形狀特征提取
5.2 統(tǒng)一坐標系的建立
5.3 小波分析
5.4 基于蛋白質
5.5 基于統(tǒng)一坐標序列的蛋白質三維結構多分辨頻譜建立
5.6 本章小結
第6章 蛋白質三維結構相似性
6.1 三維模型相似性比較
6.2 灰色系統(tǒng)理論概述
6.3 蛋白質三維結構相似性的灰色關聯(lián)分析
6.3.1 原理與方法
6.3.2 實驗結果及討論
6.4 蛋白質三維結構頻譜的灰色關聯(lián)分析
6.4.1 方法與步驟
6.4.2 實驗結果及討論
6.5 本章小結
第7章 蛋白質三維結構空間復雜性
7.1 生物學中的分形
7.2 分形的概述
7.3 基于分形的蛋白質三維空間結構復雜性研究
7.3.1 原子覆蓋法的碳骨架分維數(shù)計算
7.3.2 實驗結果及討論
7.4 基于結構頻譜分維的蛋白質三維結構相似性比較
7.4.1 方法與步驟
7.4.2 實驗結果及討論
7.5 本章小結
第8章 蛋白質三維結構視圖系統(tǒng)
8.1 系統(tǒng)框架
8.2 系統(tǒng)功能
8.3 本章小結
后記
參考文獻