醫(yī)學代謝組學

第一章 概述
第一節(jié) 代謝組學的歷史、地位和作用
一、概念和歷史沿革
二、代謝組學在系統(tǒng)生物學中的地位和作用
第二節(jié) 代謝組學研究現(xiàn)狀及研究領(lǐng)域簡介
一、代謝組學國內(nèi)外研究概況
二、代謝組學研究領(lǐng)域簡介
第二章 代謝組學與中醫(yī)藥
第一節(jié) 中醫(yī)理論的系統(tǒng)性特征
一、中醫(yī)的整體觀和系統(tǒng)觀
二、中醫(yī)的個體化治療
三、中醫(yī)的預測理論
四、中醫(yī)預防醫(yī)學
五、組學技術(shù)在中醫(yī)藥領(lǐng)域的應用前景
第二節(jié) 體現(xiàn)整體性與動態(tài)性的代謝組學與中醫(yī)藥的關(guān)聯(lián)與互融
第三節(jié) 代謝組學與中醫(yī)藥現(xiàn)代化
一、代謝組學與中醫(yī)辨證施治
二、中藥質(zhì)量標準化
三、中藥整體療效
四、中藥安全性
第三章 代謝物的生理作用
第一節(jié) 生物學分析的意義和生化代謝通路分析方法
一、代謝紊亂與疾病的關(guān)系
二、代謝物功能與分析
第二節(jié) 生化代謝通路
一、能量代謝
二、物質(zhì)傳遞相關(guān)
三、信息傳導相關(guān)的通路
四、胃腸道菌群相關(guān)代謝
第三節(jié) 與疾病相關(guān)的關(guān)鍵調(diào)控通路及網(wǎng)絡變化的生物學意義分析
一、實例介紹：出生缺陷與甲硫氨酸和葉酸代謝
二、腸道菌群對胰島素抵抗小鼠脂肪肝的貢獻
第四章 氣相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)
第一節(jié) 氣相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用的技術(shù)特點
一、氣相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)原理及特點
二、氣相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用系統(tǒng)的組成
三、氣相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)在代謝組學中的應用
第二節(jié) 代謝組學常用的氣相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用(GC／MS)儀器介紹
一、氣相色譜-四極桿質(zhì)譜儀(GC／Q-MS)
二、氣相色譜-飛行時間質(zhì)譜儀(GC／TOF-MS)
三、氣相色譜-離子阱串聯(lián)質(zhì)譜聯(lián)用儀(GC／IT-MS-MS)
四、全二維氣相色譜-飛行時間質(zhì)譜儀(GC×GC／TOF-MS)
第三節(jié) 氣質(zhì)聯(lián)用(GC／MS)分析的樣本處理
一、樣品的采集及提取方法
二、衍生化方法
第四節(jié) 圖譜數(shù)據(jù)的提取處理
一、數(shù)據(jù)提取
二、數(shù)據(jù)的預處理
三、模式識別
四、生物學信息的提取
第五節(jié) 實例介紹：基于GC／MS的尿毒癥代謝組學研究
一、實驗方法
二、結(jié)果與討論
第五章 液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)
第一節(jié) 液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用的特點及其在代謝組學上的應用
一、液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用(LC／MS)技術(shù)的發(fā)展
二、原理
三、分類
四、LC／MS與代謝組學
第二節(jié) 常用液相色譜-質(zhì)譜儀介紹
一、常用的4種LC／MS儀器
二、原理和特點
第三節(jié) 實例介紹：基于液質(zhì)聯(lián)用技術(shù)的代謝組學研究
第六章 核磁共振(NMR)技術(shù)
第一節(jié) 基于不同分辨率的核磁共振技術(shù)
一、原理簡介
二、不同分辨率NMR的代謝組學實例比較
第二節(jié) NMR的其他檢測方法
一、超低溫探頭檢測方法
二、動物組織原位研究的“魔角旋轉(zhuǎn)”磁共振檢測方法
三、LC／NMR聯(lián)儀系統(tǒng)
四、LC／SPE-CryoNMR-MS聯(lián)用儀
第三節(jié) 實例介紹：基于NMR的代謝組學研究
第七章 代謝組學研究的其他分析技術(shù)
第一節(jié) 毛細管電色譜(CEC)技術(shù)
一、原理
二、CEC在代謝組學研究中的應用
第二節(jié) 電感耦合等離子質(zhì)譜技術(shù)(ICP／MS)與微量元素組學
一、微量元素的生理意義
二、微量元素組——“金屬組學”
三、應用實例
第八章 代謝組學數(shù)據(jù)分析和處理技術(shù)
第一節(jié) 圖譜數(shù)據(jù)的預處理
一、歸一化方法
二、數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換
三、數(shù)據(jù)標準化(中心化／標度化)
第二節(jié) 多維與單維統(tǒng)計方法
一、實驗用數(shù)據(jù)信息
二、多維統(tǒng)計方法簡介
三、模型質(zhì)量評價
四、“多標準”篩選差異性變量
五、單維／多維分析結(jié)果
第三節(jié) 數(shù)據(jù)處理方法總結(jié)
第九章 基于代謝表型差異的疾病研究
第一節(jié) 心血管疾病的診斷和研究
第二節(jié) 腫瘤的診斷和研究
一、基于核磁共振(NMR)技術(shù)的腫瘤代謝組學研究
二、基于色質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)的腫瘤代謝組學研究
三、基于其他技術(shù)的腫瘤代謝組學研究
四、實例介紹：腸癌和肝癌的代謝組學研究
第三節(jié) 代謝性相關(guān)疾病的診斷和研究
一、糖尿病的代謝組學研究
二、肥胖相關(guān)代謝組學研究
三、胃腸道菌群與代謝綜合征研究
第四節(jié) 臨床疾病中醫(yī)證型的診斷
一、兩種中醫(yī)證型的骨關(guān)節(jié)炎的代謝組學研究
二、慢性腎衰和心衰的腎陽虛證的代謝組學研究
第十章 代謝組學用于藥物療效評價及機制研究
第一節(jié) 疾病模型及藥物干預
一、結(jié)腸癌癌前病變以及中藥干預
二、肉蓯蓉干預大鼠“腎陽虛”模型
三、藥物代謝組學研究
第二節(jié) 中藥的作用機制研究
一、人參皂苷的抗應激作用
二、中藥的保肝作用
第十一章 代謝組學用于毒性研究
第一節(jié) 肝毒性的代謝組學研究
一、化學藥物導致的急性肝損傷
二、乙醇(酒精)導致的肝損傷
第二節(jié) 其他毒性研究
一、馬兜鈴酸腎毒性的代謝組學研究
二、雷公藤多苷毒性的代謝組學研究
三、三聚氰胺毒性的代謝組學研究
第十二章 藥用植物的代謝組學
第一節(jié) 植物代謝組學研究進展
一、植物代謝組學的定義及發(fā)展
二、植物代謝組學分析方法及優(yōu)點
三、代謝組學在藥用植物中的應用前景
第二節(jié) 代謝組學在藥用植物中的應用
一、分類鑒定
二、化學成分分析
三、群體篩選
四、壓力下的代謝應答
第三節(jié) 代謝組學與其他組學整合
第四節(jié) 實例——普洱茶的代謝組學研究
一、不同種類茶葉的成分組成的差異
二、健康人群飲用普洱茶的代謝組學研究