蝶類線粒體基因組及分子系統(tǒng)發(fā)育研究

前言 第1章蝴蝶的分類研究 1.1國外蝶類分類研究 1.2國內蝶類分類研究 參考文獻 第2章蝶類線粒體基因組 2.1蝶類昆蟲線粒體基因組 2.2線粒體基因組的研究方法 2.2.1基于物理分離的方法 2.2.2基于常規(guī)PCR技術的方法 2.2.3基于LA—PCR技術的方法 2.2.4高通量測序技術 2.2.5線粒體基因組數據的分析方法 2.3蝶類線粒體基因組全序列測序進展 2.4線粒體基因組在蝶類系統(tǒng)發(fā)育研究中的應用 2.4.116SrDNA基因 2.4.2Cytb基因 2.4.3COI和COII基因 2.4.4ND1和ND5基因 2.4.5線粒體基因組全序列 參考文獻 第3章蝶類的分子系統(tǒng)學研究 3.1分子系統(tǒng)學的研究內容與方法 3.1.1蛋白質水平標記 3.1.2DNA分子標記 3.1.3DNA序列分析 3.2系統(tǒng)發(fā)育的推斷方法—構建分析系統(tǒng)發(fā)育樹 3.2.1系統(tǒng)發(fā)育樹 3.2.2常用的系統(tǒng)發(fā)育樹 3.3蝶類分子系統(tǒng)學的研究進展 參考文獻 第4章材料與方法 4.1材料 4.2方法 4.2.1DNA提取 4.2.2引物設計 4.2.3PCR擴增 4.2.4序列的拼接和注釋 4.3序列分析及系統(tǒng)發(fā)育樹的構建 4.3.1序列比對 4.3.2系統(tǒng)發(fā)育信號檢測 4.3.3系統(tǒng)發(fā)育樹的構建 參考文獻 第5章10種蝴蝶的線粒體基因組分析 5.1玉斑鳳蝶線粒體基因組 5.1.1線粒體基因組全序列的結構與組成 5.1.2基因間隔與重疊 5.1.3堿基組成特征 5.1.4蛋白質編碼基因 5.1.5核糖體RNA和轉運RNA 5.1.6A+T富含區(qū) 5.2玉帶鳳蝶線粒體基因組 5.2.1線粒體基因組全序列的結構與組成 5.2.2基因間隔與重疊 5.2.3堿基組成特征 5.2.4蛋白質編碼基因 5.2.5核糖體RNA及轉運RNA 5.2.6A+T富含區(qū) 5.3碧鳳蝶線粒體基因組 5.3.1線粒體基因組全序列的結構與組成 5.3.2基因間隔與重疊 5.3.3堿基組成特征 5.3.4蛋白質編碼基因 5.3.5核糖體RNA和轉運RNA 5.3.6A+T富含區(qū) 5.4金斑喙鳳蝶（廣西亞種）線粒體基因組 5.4.1線粒體基因組全序列的結構與組成 5.4.2基因間隔與重疊 5.4.3堿基組成特征 5.4.4蛋白質編碼基因 5.4.5核糖體RNA和轉運RNA 5.4.6A+T富含區(qū) 5.5燕風蝶線粒體基因組 5.5.1線粒體基因組全序列的結構與特征 5.5.2基因間隔與重疊 5.5.3堿基組成特征 5.5.4蛋白質編碼基因 5.5.5核糖體RNA和轉運RNA 5.5.6A+T富含區(qū) 5.6箭環(huán)蝶線粒體基因組 5.6.1線粒體基因組全序列的結構與特征 5.6.2基因間隔與重疊 5.6.3堿基組成特征 5.6.4蛋白質編碼基因 5.6.5核糖體RNA和轉運RNA 5.6.6A+T富含區(qū) 5.7藍點紫斑蝶線粒體基因組 5.7.1線粒體基因組全序列的結構與組成 5.7.2基因間隔與重疊 5.7.3堿基組成特征 5.7.4蛋白質編碼基因 5.7.5核糖體RNA和轉運RNA 5.7.6A+T富含區(qū) 5.8枯葉蛺蝶線粒體基因組 5.8.1線粒體全序列的結構與組成 5.8.2基因間隔與重疊 5.8.3堿基組成特征 5.8.4蛋白質編碼基因 5.8.5核糖體RNA和轉運RNA 5.8.6A+T富含區(qū) 5.9黃斑弄蝶線粒體基因組 5.9.1線粒體基因組全序列的結構與組成 5.9.2基因間隔與重疊 5.9.3堿基組成特征 5.9.4蛋白質編碼基因 5.9.5核糖體RNA及轉運RNA 5.9.6A+T富含區(qū) 5.10青斑蝶線粒體基因組 5.10.1線粒體基因組全序列的結構與組成 5.10.2基因間隔與重疊 5.10.3堿基組成與特征 5.10.4蛋白質編碼基因 5.10.5核糖體RNA和轉運RNA 5.10.6A+T富含區(qū) 參考文獻 第6章基于16SrRNA和16SrRNA+Wingless基因聯合序列蝶類的系統(tǒng)發(fā)育 6.1材料與方法 6.1.1材料 6.1.2系統(tǒng)發(fā)育樹的構建 6.2結果與分析 6.2.1基于16SrRNA序列構建的NJ、MP和BI系統(tǒng)發(fā)育樹 6.2.2基于16SrRNA+Wingless基因聯合序列構建的 NJ、MP和BI系統(tǒng)發(fā)育樹 6.3討論 6.3.1總科級分類單元的系統(tǒng)關系 6.3.2科級分類單元的系統(tǒng)關系 6.3.3不同數據集和構樹方法間的差異 6.3.4外群的選擇 參考文獻 第7章基于線粒體基因組全序列鱗翅目的系統(tǒng)發(fā)育分析 7.1材料與方法 7.1.1物種選取 7.1.2系統(tǒng)發(fā)育樹的構建 7.2結果與分析 7.3討論 7.3.1總科級分類單元的系統(tǒng)關系 7.3.2科級分類單元的系統(tǒng)關系 參考文獻 …… 第8章基于線粒體基因組全序列與核基因EF—1a序列的蝶類系統(tǒng)發(fā)育分析 第9章基于線粒體基因組全序列與無翅基因（Winglees）序列蝶類的系統(tǒng)發(fā)育分析