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網絡藥理學導論

網絡藥理學導論

定 價:¥89.00

作 者: 李梢
出版社: 清華大學出版社
叢編項:
標 簽: 暫缺

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ISBN: 9787302619659 出版時間: 2022-12-01 包裝: 平裝-膠訂
開本: 16開 頁數(shù): 字數(shù):  

內容簡介

  本書致力于系統(tǒng)地介紹網絡藥理學的理論、方法和應用的研究進展,主要包括四大部分:1)網絡藥理學涉及的概念與理論;2)常用分析方法、數(shù)據(jù)庫與分析軟件;3)基于網絡藥理學的中醫(yī)藥現(xiàn)代化、現(xiàn)代藥物研究的典型案例;4)基于藥物、疾病的網絡藥理學實踐流程。適用于初接觸網絡藥理學、需要系統(tǒng)了解該領域的研究人員和學生。網絡藥理學是人工智能和大數(shù)據(jù)時代藥物系統(tǒng)性研究的新興前沿學科,也是融合系統(tǒng)生物學、生物信息學、網絡科學、系統(tǒng)藥理學等學科的原創(chuàng)性學科,強調從系統(tǒng)層次和生物網絡的整體角度出發(fā),解析藥物及其治療對象之間的分子關聯(lián)規(guī)律,揭示藥物的系統(tǒng)性藥理機制,指導新藥研發(fā)和臨床治療。隨著計算、實驗方法的進步,網絡藥理學的發(fā)展將有望幫助系統(tǒng)理解藥物和病證的相互作用關系,為藥物研發(fā)、機制闡釋、藥效評價、精準用藥等提供技術支撐,促進從“還原論”到“系統(tǒng)論”的方法論革新,為“下一代藥物研究模式”的推廣應用提供強勁動力。

作者簡介

  李梢,清華大學長聘教授、北京市中醫(yī)藥交叉研究所所長、英國皇家化學會會士、英國皇家生物學會會士、國家杰青、國家萬人計劃領軍人才、世界中醫(yī)藥學會聯(lián)合會網絡藥理學專委會會長、中國生物工程學會生物醫(yī)藥大數(shù)據(jù)專委會主任委員。為中醫(yī)藥網絡藥理學開拓者、胃癌極早期防治體系創(chuàng)建者。發(fā)表論文200余篇,被Nature、Science、Cell等引用9000余次,授權發(fā)明專利23項,領銜制定網絡藥理學首個國際標準。連續(xù)四年入選全球前2%頂尖科學家,獲中醫(yī)藥國際貢獻獎一等獎、李時珍醫(yī)藥創(chuàng)新獎、中國全面小康十大杰出貢獻人物,以及多項國家和省部級獎勵。

圖書目錄

第1章網絡靶標理論與網絡藥理學
1.1網絡藥理學: 下一代藥物研究模式
1.2中醫(yī)藥在網絡藥理學起源和發(fā)展中的關鍵作用
1.3網絡藥理學核心理論: 網絡靶標
1.3.1網絡靶標理論的提出與發(fā)展
1.3.2網絡靶標的概念
1.4網絡藥理學研究模式和特點概述
1.4.1“單靶標局部對抗”研究模式
1.4.2“網絡靶標系統(tǒng)調節(jié)”研究模式
1.4.3網絡藥理學分析典型場景
1.4.4網絡藥理學研究特點、挑戰(zhàn)及發(fā)展方向
參考文獻
第2章基于人工智能算法的網絡藥理學在藥物研發(fā)中的應用
2.1運用于網絡藥理學的人工智能方法介紹
2.1.1人工智能算法簡介
2.1.2人工智能算法性能評價方法
2.1.3人工智能方法應用條件
2.1.4人工智能方法的前沿和展望
2.2人工智能在網絡藥理學研究中的應用
2.2.1藥物靶點的預測和發(fā)現(xiàn)
2.2.2藥物作用機制的研究
2.2.3藥物新用途的發(fā)現(xiàn)
2.2.4中藥物質基礎與中醫(yī)治療理論的研究
2.3人工智能方法的應用展望
參考文獻
第3章網絡藥理學常用數(shù)據(jù)庫
3.1網絡藥理學常用中醫(yī)藥數(shù)據(jù)庫
3.1.1ETCM: 中醫(yī)藥百科全書
3.1.2SymMap: 關注證候關聯(lián)的中醫(yī)藥整合數(shù)據(jù)庫
3.1.3BATMANTCM: 中藥分子機制的生物信息學分析平臺
3.1.4TCMID: 用于中藥分子機制分析的中醫(yī)藥整合數(shù)據(jù)庫
3.1.5其他中醫(yī)藥數(shù)據(jù)庫
3.2網絡藥理學常用生物相關數(shù)據(jù)庫
3.2.1OMIM: 人類孟德爾遺傳病在線數(shù)據(jù)庫
3.2.2HPO: 人類表型本體數(shù)據(jù)庫
3.2.3DisGeNET: 疾病基因關聯(lián)數(shù)據(jù)庫
3.2.4MalaCards: 疾病信息數(shù)據(jù)庫
3.3網絡藥理學常用靶標相關數(shù)據(jù)庫
3.3.1TTD: 治療靶標數(shù)據(jù)庫
3.3.2PDB: 蛋白質晶體結構數(shù)據(jù)庫
3.3.3GeneCards: 基因信息數(shù)據(jù)庫
3.3.4KEGG: 京都基因與基因組百科全書
3.4網絡藥理學常用蛋白相互作用數(shù)據(jù)庫
3.4.1BioGRID: 生物學通用相互作用數(shù)據(jù)庫
3.4.2DIP: 蛋白質相互作用數(shù)據(jù)庫
3.4.3IntAct: 分子相互作用數(shù)據(jù)庫
3.4.4STRING: 基因/蛋白相互作用關系數(shù)據(jù)庫
參考文獻
第4章網絡藥理學常用軟件
4.1網絡藥理學軟件功能框架及分類
4.1.1總體軟件功能需求
4.1.2網絡藥理學軟件功能框架及分類
4.2網絡藥理學常用的Web軟件
4.2.1藥物靶標預測Web軟件
4.2.2藥物適應癥分析Web軟件
4.2.3基因功能富集分析Web軟件
4.2.4蛋白相互作用網絡構建Web軟件
4.3基于圖形化界面操作的軟件
4.3.1差異基因富集分析軟件
4.3.2網絡分析軟件
4.4基于編程語言的工具包
4.4.1C 、Java工具包的使用
4.4.2Python、R工具包的使用
參考文獻
第5章網絡藥理學和中醫(yī)藥現(xiàn)代化研究案例
5.1網絡藥理學與中醫(yī)證候研究案例
5.1.1寒、熱證候及對證方劑的網絡藥理學研究案例分析
5.1.2慢性乙型肝炎致肝纖維化的“同病異證”研究案例分析
5.2網絡藥理學與中藥方劑研究案例
5.3網絡藥理學與中藥創(chuàng)制研究案例
5.4網絡藥理學與民族藥研究案例
參考文獻
第6章網絡藥理學與現(xiàn)代藥物研發(fā)案例
6.1復雜疾病內在機制和干預靶標
6.2藥物系統(tǒng)性作用機制
6.3多靶標藥物研發(fā)
6.3.1缺血性中風: 從單一藥物靶標到協(xié)同的網絡藥理學
6.3.2聯(lián)合網絡藥理學與表型篩選開發(fā)新的止痛類藥物
6.4藥物重新定位
6.4.1基于網絡的藥物重定位預測及基于人群的驗證
6.4.2基于網絡藥理學的藥物重定位發(fā)現(xiàn)新的抗抑郁藥物
6.5組合藥物研發(fā)
參考文獻
第7章基于藥物的網絡藥理學實踐流程
7.1尋找單味中藥或方劑的有效成分
7.1.1數(shù)據(jù)采集與處理
7.1.2網絡構建與可視化
7.1.3網絡分析與預測
7.1.4驗證與總結
7.2闡述單味中藥或方劑的藥效機制
7.2.1數(shù)據(jù)采集與處理
7.2.2網絡構建與可視化
7.2.3網絡分析與預測
7.2.4驗證與總結
7.3詮釋中藥配伍理論的科學內涵
7.3.1數(shù)據(jù)采集與處理
7.3.2網絡構建與可視化
7.3.3網絡分析與預測
7.3.4驗證與總結
7.4解釋中藥與西藥之間的相互作用
7.4.1數(shù)據(jù)采集與處理
7.4.2網絡構建與可視化
7.4.3網絡分析與預測
7.4.4驗證與總結
7.5藥物臨床應用的重定位——中藥成分保護腦缺血再灌注損傷的新用途
7.5.1數(shù)據(jù)采集與處理
7.5.2網絡構建與可視化
7.5.3網絡分析與預測
7.5.4驗證與總結
7.6多靶點藥物的開發(fā)——中藥配伍保護低密度脂蛋白誘導的內皮細胞
損傷
7.6.1數(shù)據(jù)采集與處理
7.6.2網絡構建與可視化
7.6.3網絡分析與預測
7.6.4驗證與總結
參考文獻
第8章基于疾病的網絡藥理學實踐流程
8.1冠心病疾病網絡構建及分析
8.1.1數(shù)據(jù)采集與處理
8.1.2網絡構建與可視化
8.1.3網絡分析與預測
8.1.4驗證與總結
8.2疾病網絡用于中藥方劑的研究實踐
8.2.1中藥方劑的整合作用機制研究
8.2.2中藥方劑的“君臣佐使”配伍規(guī)律研究
8.2.3中藥方劑的“益氣、活血”功效研究
參考文獻
第9章基于藥物疾病的網絡藥理學實踐流程
9.1化橘紅治療呼吸系統(tǒng)疾病的網絡藥理學研究
9.1.1化橘紅治療呼吸系統(tǒng)疾病的作用靶點預測
9.1.2化橘紅治療呼吸系統(tǒng)疾病的作用靶點驗證
9.1.3化橘紅治療呼吸系統(tǒng)疾病的調控網絡分析
9.2丹紅注射液治療心血管疾病的網絡藥理學研究
9.2.1丹紅注射液治療心血管疾病的作用靶點預測
9.2.2丹紅注射液治療心血管疾病的作用靶點驗證
9.2.3丹紅注射液治療心血管疾病的調控網絡分析
參考文獻
附錄A網絡藥理學評價方法指南
附錄B網絡藥理學評價要素與評價指標
附錄C網絡藥理學研究報告示例
后記
 

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