分子生物學（第二版）

緒論第1章 核酸的結(jié)構(gòu)與性質(zhì)1.1 DNA的結(jié)構(gòu) 61.1.1 DNA的化學組成 61.1.2　DNA雙螺旋 81.1.3　DNA結(jié)構(gòu)的多態(tài)性 91.1.4 DNA拓撲學 111.2　DNA的變性和復性 161.2.1　DNA變性 161.2.2 復性 181.3 RNA結(jié)構(gòu) 19第2章 基因組DNA和染色體2.1 原核生物的基因組和染色體 232.1.1 原核生物基因組的遺傳結(jié)構(gòu) 232.1.2 原核生物的染色體 242.2 真核生物的基因組 262.2.1 真核生物的C值矛盾與非編碼DNA 262.2.2 真核生物基因組的序列組分 272.3 真核生物的染色體和染色質(zhì) 332.3.1 組蛋白 332.3.2 核小體 342.3.3 從核小體到中期染色體 352.3.4 異染色質(zhì)與常染色質(zhì) 372.3.5 真核生物染色體DNA上的幾個重要元件 382.4 核外基因組 412.4.1 質(zhì)粒基因組 412.4.2 線粒體基因組 432.4.3 葉綠體基因組 44第3章 DNA的復制3.1 DNA復制的一般特征 473.1.1 半保留復制 473.1.2 雙向復制 483.1.3 DNA合成的引發(fā) 493.1.4 半不連續(xù)復制 493.2 DNA聚合酶 493.2.1 DNA合成的化學基礎(chǔ) 493.2.2 DNA聚合酶的催化機制 503.2.3 原核生物DNA聚合酶 533.2.4 真核生物DNA聚合酶 553.3 大腸桿菌染色體DNA的復制 553.3.1 復制的起始 563.3.2 復制的延伸 573.3.3 復制的終止 613.3.4 復制起始調(diào)控 613.4 真核生物基因組DNA的復制 623.4.1 SV40 DNA的復制 623.4.2 核小體的組裝 643.4.3 端粒DNA復制 663.4.4 真核生物基因組復制的調(diào)控 673.5 滾環(huán)復制與D環(huán)復制 683.5.1 滾環(huán)復制 683.5.2 D環(huán)復制 713.6 反轉(zhuǎn)錄與反轉(zhuǎn)錄病毒 713.6.1 反轉(zhuǎn)錄病毒的結(jié)構(gòu) 713.6.2 反轉(zhuǎn)錄病毒的基因組 723.6.3 反轉(zhuǎn)錄過程 72第4章 DNA的突變和修復4.1 DNA突變 764.1.1 突變的主要類型 764.1.2 突變的產(chǎn)生 794.1.3 正向突變、回復突變與突變的校正 864.1.4 突變熱點 874.2 DNA修復 884.2.1 光復活 894.2.2 烷基的轉(zhuǎn)移 894.2.3 切除修復 904.2.4 錯配修復 914.2.5 極小補丁修復 934.2.6 重組修復 934.2.7 SOS反應(yīng) 944.2.8 真核生物的DNA修復 96第5章 DNA的重組5.1 同源重組 1015.1.1 同源重組的分子模型 1015.1.2 大腸桿菌的同源重組 1045.1.3 真核細胞的同源重組 1065.1.4 接合型轉(zhuǎn)換 1085.1.5 基因轉(zhuǎn)換 1115.2 保守性位點特異性重組 1115.2.1 保守性位點特異性重組發(fā)生在特定的DNA序列之間 1115.2.2 CSSR可以產(chǎn)生3種不同類型的DNA重排 1125.2.3 位點特異性重組酶 1135.2.4 位點特異性重組在生物學過程中的作用 1145.3 轉(zhuǎn)座 1165.3.1 DNA轉(zhuǎn)座子 1185.3.2 反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子 1265.3.3 V(D)J重組產(chǎn)生抗體的多樣性 1315.3.4 Mu噬菌體 136第6章 DNA的轉(zhuǎn)錄6.1 原核生物的轉(zhuǎn)錄機制 1406.1.1 大腸桿菌RNA聚合酶 1406.1.2 σ70啟動子 1416.1.3 原核生物的轉(zhuǎn)錄周期 1426.2 真核生物的轉(zhuǎn)錄機制 1476.2.1 真核生物RNA聚合酶 1476.2.2 RNA聚合酶Ⅱ基因的轉(zhuǎn)錄 1486.2.3 RNA聚合酶Ⅰ基因的轉(zhuǎn)錄 1566.2.4 RNA聚合酶Ⅲ基因的轉(zhuǎn)錄 158第7章 RNA的轉(zhuǎn)錄后加工7.1 真核生物前體mRNA的加工 1627.1.1 5′-端加帽 1637.1.2 3′-端加尾 1647.1.3 剪接 1657.1.4 RNA編輯 1737.1.5 mRNA運出細胞核 1767.2 mRNA降解 1777.2.1 原核生物mRNA的降解 1777.2.2 真核生物mRNA的降解 1777.3 前體rRNA和前體tRNA的加工 1787.3.1 原核生物前體rRNA的加工 1787.3.2 真核生物前體rRNA的加工 1797.3.3 原核生物前體tRNA的加工 1827.3.4 真核生物前體tRNA的加工 1837.4 四種內(nèi)含子的比較 1847.4.1 細胞核前體mRNA的GU–AG型內(nèi)含子 1847.4.2 Ⅰ型內(nèi)含子 1847.4.3 Ⅱ型內(nèi)含子 1857.4.4 真核生物前體tRNA內(nèi)含子 185第8章 蛋白質(zhì)的合成與加工8.1 遺傳密碼 1888.1.1 遺傳密碼是三聯(lián)體 1888.1.2 遺傳密碼的破譯 1898.1.3 密碼子的特性 1928.2 tRNA 1948.2.1 tRNA分子的二級結(jié)構(gòu) 1948.2.2 tRNA分子的三級結(jié)構(gòu) 1958.2.3 密碼子和反密碼子的相互作用 1958.3 氨酰-tRNA合成酶 1968.3.1 氨酰–tRNA合成酶催化的化學反應(yīng) 1968.3.2 氨酰–tRNA合成酶的分類 1978.3.3 氨酰–tRNA合成酶對tRNA的識別 1988.3.4 氨酰–tRNA合成酶的校正功能 1998.4 核糖體 2018.4.1 核糖體的結(jié)構(gòu) 2018.4.2 肽酰轉(zhuǎn)移酶反應(yīng) 2028.4.3 核糖體循環(huán)與多聚核糖體 2028.5 多肽鏈的合成 2038.5.1 原核生物多肽鏈的合成 2038.5.2 真核生物多肽鏈的合成 2088.6 反式翻譯 2118.6.1 tmRNA的結(jié)構(gòu)與功能 2118.6.2 反式翻譯的分子模型 2128.7 程序性核糖體移碼 2138.8 硒代半胱氨酸 2148.9 吡咯賴氨酸 2158.10 依賴翻譯的mRNA質(zhì)量監(jiān)控 2158.10.1 無義介導的mRNA降解 2158.10.2 無終止密碼子介導的mRNA降解 2178.11 蛋白質(zhì)合成的抑制劑 2178.12 蛋白質(zhì)翻譯后加工 2198.12.1 蛋白質(zhì)的折疊 2198.12.2 蛋白質(zhì)的化學修飾 2218.12.3 蛋白質(zhì)的酶解切割 2238.12.4 內(nèi)含肽與蛋白質(zhì)拼接 2248.13 蛋白質(zhì)的定向與分揀 2268.13.1 翻譯–轉(zhuǎn)運途徑 2268.13.2 翻譯后轉(zhuǎn)運途徑 2278.14 蛋白質(zhì)的降解 2308.14.1 溶酶體降解途徑 2318.14.2 泛素–蛋白酶體途徑 231第9章 原核生物基因表達調(diào)控9.1 轉(zhuǎn)錄水平的基因表達調(diào)控 2349.1.1 轉(zhuǎn)錄起始調(diào)控 2359.1.2 弱化作用與抗終止作用 2489.2 翻譯水平的基因表達調(diào)控 2529.2.1 反義RNA 2529.2.2 核糖體蛋白合成的自體控制 2529.2.3 一些mRNA分子必須經(jīng)過切割才能被翻譯 2549.2.4 嚴緊反應(yīng) 2559.3 核糖開關(guān) 2569.4 DNA重排對基因轉(zhuǎn)錄的調(diào)控 2589.5 λ噬菌體調(diào)控級聯(lián) 2599.5.1 裂解周期中的級聯(lián)調(diào)控 2599.5.2 溶原生長的自體調(diào)控 2619.5.3 溶原生長建立的分子機制 2639.5.4 裂解生長和溶原生長的選擇 2659.5.5 前噬菌體的誘導 265第10章 真核生物基因表達調(diào)控10.1 染色質(zhì)的結(jié)構(gòu)與基因表達 26910.1.1 具有轉(zhuǎn)錄活性的染色質(zhì) 26910.1.2 染色質(zhì)結(jié)構(gòu)的調(diào)節(jié) 27010.1.3 染色質(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能域 27510.2 DNA甲基化與基因組沉默 27810.2.1 真核生物DNA的甲基化 27810.2.2 DNA甲基化與基因沉默 27910.2.3 DNA甲基化與基因組印記 28010.2.4 X染色體失活 28110.3 真核生物的特異性轉(zhuǎn)錄因子 28210.3.1 轉(zhuǎn)錄因子的分離與鑒定 28210.3.2 轉(zhuǎn)錄因子的功能域 28410.4 轉(zhuǎn)錄因子的作用方式 28910.4.1 轉(zhuǎn)錄激活因子 28910.4.2 轉(zhuǎn)錄抑制因子 29110.5 細胞外信號與轉(zhuǎn)錄因子的控制 29110.5.1 脂溶性激素對轉(zhuǎn)錄因子活性的調(diào)節(jié) 29110.5.2 信號轉(zhuǎn)導對轉(zhuǎn)錄因子活性的調(diào)節(jié) 29310.6 轉(zhuǎn)錄后水平的基因表達調(diào)控 29810.7 翻譯水平的基因表達調(diào)控 29910.7.1 mRNA結(jié)合蛋白對翻譯的調(diào)控 29910.7.2 翻譯激活因子對翻譯的激活作用 30110.8 RNA介導的基因沉默 30110.8.1 RNA干擾 30110.8.2 轉(zhuǎn)錄后基因沉默 30210.8.3 siRNA誘導的轉(zhuǎn)錄沉默 30310.8.4 微小RNA 304參考文獻