神宗范天合道哲肅敦簡(jiǎn)光文章武安仁止孝顯皇帝，叫朱翊鈞，穆宗第三子。其母為李貴妃。
隆慶二年(1568)，被立為皇太子，當(dāng)時(shí)年方六歲。翊鈞少年聰慧，穆宗曾馳馬宮中，他進(jìn)諫道：“陛下為天下之主，獨(dú)騎而騁，寧無銜橛憂?！蹦伦诖笙玻埋R大加撫慰。陳皇后病居別宮，翊鈞每晨隨母前往探問，皇后每聽到腳步聲就高興起來，并掙扎著坐起，取出經(jīng)書考問他，翊鈞總是高聲回答，其母李貴妃也十分高興，兩宮因此而越來越和睦。
隆慶六年(1572)五月，穆宗駕崩。六月初一，日食。初十，朱翊鈞繼承皇帝之位。定第二年為萬歷元年，頒詔大赦天下。在鄉(xiāng)間祭祀建文朝盡節(jié)諸臣，有子孫后代的加以恤錄。十六日，罷免高拱。二十三日，高儀死去。二十八日，禮部尚書呂調(diào)陽兼任文淵閣大學(xué)士，參預(yù)機(jī)要事務(wù)。
秋七月初四，漕運(yùn)初通至密云。初七，考察京師官員。十五日，告誡朝廷諸臣“：近年來，士習(xí)慣于澆薄，為官之禮法被削弱，誣蔑老成為無用，驕狂者便佞為有才。于是使朝廷賦予的權(quán)力，僅僅成為人臣報(bào)復(fù)的資本。雖需要加以懲戒，但我都予以寬恕。諸臣應(yīng)力改前過，共維新政。若仍沉溺于故習(xí)，背公徇私，獲罪于祖宗，朕不敢赦免?！笔呷眨鸱Q陳皇后為仁圣皇太后，李貴妃為慈圣皇太后。八月初五，祭祀大社大稷。九月十一日，將莊皇帝安葬于昭陵。
冬十月初六，侍郎王遴、吳百朋、汪道昆分別巡視邊防。初八，中止行刑。十一月十三日，河工完成。十二月初九，賑濟(jì)榆林、延綏饑荒。二十二日，以穆宗駕崩不久為由，下詔免設(shè)元夕燈火及宮中宴席。
萬歷元年(1573)春二月初二日，聽取經(jīng)筵講解。三月十六日，詔令內(nèi)外官員舉薦將材。
夏四月十六日，潮、惠賊寇被平定。二十一日，天大旱，諭百官修身反省。五月初五，詔令內(nèi)外官員慎重進(jìn)行刑獄之事。六月二十四日，賑濟(jì)淮安水災(zāi)。
秋七月，黃河在徐州決口。九月初六，賑濟(jì)荊州、承天及濟(jì)南災(zāi)害。初九，四川都掌蠻被平定。二十六日，中止行刑。
冬十一月初四，朱翊鈞詔令諸司訂立章程限制文書上報(bào)時(shí)間，以防延遲緩慢。十二月十三日，賑濟(jì)遼東饑荒。
萬歷二年(1574)春正月十八日，朱翊鈞在皇極門召見朝覲廉能之官。二月初九，賑濟(jì)四川被賊寇侵?jǐn)_諸縣。三月十八日，賜予孫繼皋等人進(jìn)士及第以及其他不同的出身。
夏四月二十二日，朱翊鈞詔諭百官行久任之法。五月二十八日，穆宗牌位附于太廟。八月二十八日，賑濟(jì)山西災(zāi)害。二十九日，賑濟(jì)淮、揚(yáng)、徐水災(zāi)。
冬十月十三日，審理囚犯。二十六日，上朝辦公審閱選官制度。閏十二月二十日，下詔免去第二年元夕燈火。當(dāng)年，琉球前來朝貢。
萬歷三年(1575)春正月初七，祭獻(xiàn)太廟。二月初九，祭祀大社大稷。十二日，詔令南京職務(wù)應(yīng)精簡(jiǎn)為宜，官吏不得虛占其位以充數(shù)。二十七日，開始命日講官分別記注起居，纂輯章奏，臨朝值班。
夏四月初一，日食，為日全食。初四，翊鈞書寫謹(jǐn)天戒、任賢能、親賢臣、遠(yuǎn)嬖佞、明賞罰、謹(jǐn)出入、慎起居、節(jié)飲食、收放心、存敬畏、納忠言、節(jié)財(cái)用十二事置于座右側(cè)，以期自警。五月初三，淮、揚(yáng)發(fā)生大水災(zāi)，于是他詔令審察二府官吏，罷免了有貪污等老毛病的官員。六月初一，浙江海潮泛濫。十一日，命撫、按官員，官吏是否賢能一并舉薦和彈劾，不得偏重甲科進(jìn)士。當(dāng)年夏天，蘇、松、常、鎮(zhèn)普發(fā)大水。
秋八月十一日，禮部侍郎張四維被升為禮部尚書兼任東閣大學(xué)士，參與機(jī)要事務(wù)。十二日，黃河在高郵、碭山?jīng)Q口。二十三日，朝廷免除淮、揚(yáng)、鳳、徐等發(fā)生水災(zāi)之地的田租。九月二十三日，京師發(fā)生地震。
冬十月初三，京師再次地震，命群臣修身反省。初四，中止行刑。十一月十一日，朱翊鈞在京城南郊祭天。十二月初七，朱翊鈞又詔諭免去第二年元夕燈火。這一年，有安南、琉球、暹羅、土魯番前來朝貢。
萬歷四年(1576)春正月二十三日，遼東巡按御史劉臺(tái)因談?wù)搹埦诱淮度氇z，削除官籍。
夏五月十六日，祭祀地于北郊。六月十九日，又遣內(nèi)臣監(jiān)督蘇、杭織造。
秋七月初六，朱翊鈞詔諭吏、戶二部清理吏治，并分別免除所欠賦稅，折十分之三成收取明年漕運(yùn)糧。十一日，又派遣御史督修江、浙水利。十三日，興修泗州祖陵。二十日，完成草灣黃河工程。八月初二，祭奠先師孔子。當(dāng)年秋天，黃河在崔鎮(zhèn)決口。
冬十月十四日，賑濟(jì)徐州及豐、沛、睢寧、金鄉(xiāng)、魚臺(tái)、單、曹七縣水災(zāi)，免除不同數(shù)量的田租。這一年，有安南、琉球、烏斯藏、土魯番、天方、撒馬兒罕、魯迷、哈密前來朝貢。
萬歷五年(1577)春正月二十一日，朱翊鈞詔令鳳陽、淮安大力號(hào)召墾田。二月初七，賑濟(jì)廣西饑荒。三月十八日，賜予沈懋學(xué)等為進(jìn)士及第以及其他不同的出身。
夏五月初六，廣東羅旁瑤被平定。
秋八月初八，黃河又在崔鎮(zhèn)決口。閏八月初一，日食，因陰云而未見。九月初二，重新起用張居正。
冬十月二十二日，因談?wù)搹埦诱蚋竼适露┧胤k公、不參加吉禮一事，編修吳中行、檢討趙三賢、員外郎艾穆、主事沈思孝等皆受杖刑，并分別被罷免和廢黜，甚至遭到貶謫和戍邊。二十四日，進(jìn)士鄒元標(biāo)被杖擊，進(jìn)而將其戍邊。十一月初一，朝廷以星位變化考察百官。當(dāng)年，有琉球前來朝貢。
萬歷六年(1578)春正月，朝廷征集民工修筑黃河缺口堤岸。二月十七日，免除兗、青、登、萊所轄地區(qū)的拖欠賦稅。十九日，冊(cè)立王氏為皇后。三月初三，禮部尚書馬自強(qiáng)兼任文淵閣大學(xué)士，吏部侍郎申時(shí)行兼任東閣大學(xué)士，參與機(jī)要事務(wù)。十三日，張居正因安葬父親而還鄉(xiāng)。
夏四月十四日，免除湖廣、四川所欠的賦稅。二十五日，朱翊鈞詔諭戶部每年增收金花銀二十萬兩。六月十五日，張居正回京師。
秋七月初六，呂調(diào)陽辭官。二十七日，朝廷詔諭江北各府百姓，十五歲以上而無田者，官府供給其一頭牛和五十畝田，開墾三年后開始征收賦稅。九月二十二日，又詔諭蘇州諸府開墾荒田，六年之后起科。二十三日，中止行刑。
冬十月十四日，馬自強(qiáng)死去。十一月十四日，祭祀天于南郊。這一年，有烏斯藏前來朝貢。
萬歷七年(1579)春正月二十二日，朱翊鈞下詔搗毀天下書院。二月十四日，派人分頭巡視邊防。三月十九日，朝廷免除淮、揚(yáng)拖欠賦稅。
夏五月十九日，祭祀地于北郊。六月十七日，核查兩畿、山東、陜西等地勛官、皇戚的田賦。
秋七月初八，賑濟(jì)蘇、松水災(zāi)，免除其稅糧。十四日，京師發(fā)生地震。這一年，有烏斯藏前來朝貢。
萬歷八年(1580)春二月初一，有日食。十八日，耕種謖田。二十八日，完成黃河決口工程。三月十二日，侍奉兩宮皇太后到天壽山謁陵，免除所過地方的田租。十五日，回宮。二十八日，賜予張懋修等人為進(jìn)士及第以及其他不同的出身。
夏閏四月二十二日，官軍平定廣西八寨賊寇。
冬十月初五，淘汰宮內(nèi)宮外冗官。初九，賑濟(jì)蘇、松、常、鎮(zhèn)饑荒。十一月初十，下詔丈量百姓田地。這年，有琉球前來朝貢。
萬歷九年(1581)春正月初五，詔令邊臣備警。初六，裁減諸司冗員。初八，土蠻進(jìn)犯錦州，游擊周之望敗死。十四日，朱翊鈞詔命翰林官每天四人入閣供職。十六日，裁減南京冗官。十九日，遼東總兵官李成梁在襖郎兔擊敗土蠻。三月初三，隆重檢閱軍隊(duì)。當(dāng)月，土蠻進(jìn)犯遼陽，副總兵曹..領(lǐng)兵抵抗，戰(zhàn)敗。
夏四月初四，賑濟(jì)山西發(fā)生災(zāi)害的州縣。二十二日，賑濟(jì)蘇、松、淮、鳳、徐、宿災(zāi)害。戶部呈上《萬歷會(huì)計(jì)錄》。
秋八月十六日，揚(yáng)州發(fā)大水。九月二十六日，中止行刑。
冬十月初八，土蠻進(jìn)犯廣寧、義州，李成梁將其擊退。十一月二十六日，賑濟(jì)真定、順德、廣平災(zāi)害，免除稅糧。當(dāng)年，裁減各省冗官，核查徭役賦稅，淘汰諸司冒濫冗費(fèi)。有琉球、安南、土魯番、天方、撒馬兒罕、魯迷、哈密、烏斯藏前來朝貢。
萬歷十年(1582)春二月初四，順義王俺答死去。初八，免去天下歷年拖欠的賦稅。三月初二，杭州發(fā)生兵變，巡撫吳善言被抓。初九，兵部侍郎張佳胤巡撫浙江討伐叛軍，繼而予以平定。十八日，泰寧衛(wèi)部長(zhǎng)速把亥進(jìn)犯義州，李成梁將其擊敗。二十一日，倭寇侵犯溫州。
夏四月初一，朱翊鈞告諭禮部，要倡導(dǎo)百姓及時(shí)耕種農(nóng)桑，不要游手好閑。初七，寧夏土軍馬景殺害參將許汝繼，巡撫都御史晉應(yīng)槐領(lǐng)兵對(duì)其討伐并誅殺了他。十三日，由于久旱不雨，命令百官修身反省。五月初三，或多或少地免除了先師孔子和宋儒朱熹、李侗、羅從彥、蔡沈、胡安國、游酢、真德秀、劉子..、已故大學(xué)士楊榮等人后裔的賦稅徭役。二十三日，賑濟(jì)京畿饑荒。六月初一，有日食。十六日，賑濟(jì)太原、平陽、潞安饑荒。十九日，前禮部尚書潘晟兼任武英殿大學(xué)士，吏部侍郎余有丁擔(dān)任禮部尚書兼文淵閣大學(xué)士，參與機(jī)要事務(wù)。不久，潘晟又被罷免。二十日，張居正死去。
秋七月十五日，賑濟(jì)平、慶、延、臨、鞏饑荒。九月初一，朱翊鈞因得皇長(zhǎng)子而頒詔大赦天下。初九，上兩宮皇太后徽號(hào)。
冬十月十二日，蘇、松發(fā)大水，朝廷采取了免賦和賑濟(jì)的措施。十二月八日，太監(jiān)馮保被貶為奉御，全家削去官籍。十八日，恢復(fù)建言諸臣職務(wù)。當(dāng)年，又免除京畿內(nèi)、山西受災(zāi)害之地的稅糧。哈密、烏斯藏曾來京朝貢。
萬歷十一年(1583)春正月初八，命令嚴(yán)加防范邊疆。閏二月十一日，俺答之子乞慶哈世襲順義王封號(hào)。緬甸侵犯永昌。十二日，朱翊鈞到天壽山進(jìn)謁九陵，免除路過之地的田租。十七日，又到西山進(jìn)謁恭讓章皇后、景皇帝之陵。十八日回宮。乙酉日，賑濟(jì)臨、鞏、平、延、慶五府旱災(zāi)，免除其田租。三月初二追削張居正的官級(jí)。十八日，賜予朱國祚等人為進(jìn)士及第和其他不同的出身。
夏四月初六，張四維因父喪離職。初八，吏部侍郎許國擔(dān)任禮部尚書兼東閣大學(xué)士，參與機(jī)要事務(wù)。二十三日，承天普降大雨，長(zhǎng)江水勢(shì)泛濫。同月，廣東羅定發(fā)生兵變。五月，大清太祖高皇帝起兵征伐尼堪外蘭，攻克圖倫城。六月十五日，賑濟(jì)承天、漢陽、鄖陽、襄陽災(zāi)害。
秋八月初七，免除山西受災(zāi)地區(qū)的稅糧。九月初六日，朱翊鈞到天壽山拜謁祖陵，十一日回宮。
冬十月十五日，中止行刑。二十三日，河南發(fā)生水災(zāi)，分別予以免租和賑濟(jì)。十一月初一，有日食。十二月二十二日，慈慶宮受災(zāi)，詔諭修身反省。當(dāng)年，有琉球前來朝貢。
萬歷十二年(1584)春二月二十日，京師地震。二十二日，釋放建文諸臣外親遭貶及戍邊者的后裔。三月二十二日，減少江西瓷器的燒造。
夏四月初九，查抄張居正家。十一日，游擊將軍劉纟廷討伐平定隴川賊寇。五月十九日，京師地震。六月初六，以云南用兵為由，免去稅糧及拖欠賦役。
秋八月十三日，將張居正之罪張榜公布于天下，并將其家屬戍邊。九月十三日，事奉兩宮皇太后到天壽山拜謁皇陵。十六日，建造壽宮。二十一日，返回宮中。
冬十月十五日，中止行刑。二十四日，免除湖廣、山東受災(zāi)地方的稅糧。十一月十六日，余有丁死去。十二月初二，前禮部侍郎王錫爵擔(dān)任禮部尚書兼文淵閣大學(xué)士，吏部侍郎王家屏兼東閣大學(xué)士，參與機(jī)要事務(wù)。二十二日，停止開采銀礦。這一年有安南、烏斯藏入朝進(jìn)貢。
萬歷十三年(1585)春正月十九日，四川建武所兵變，擊傷總兵沈思學(xué)。二月初六日，南京發(fā)生地震。京師自去年八月以來沒有降雨。三十日，舉行盛大祈雨祭祀。三月十三日，再次隆重舉行祈雨祭祀。十八日，李成梁出塞襲擊把兔兒炒花，取得大勝。二十一日，減少杭州織造及尚衣監(jiān)料銀。尚寶司少卿徐貞明督治京畿水田。
夏四月初五，舉行盛大祈雨祭祀。初七，由于久旱不雨，朱翊鈞詔令各地審理、平反冤案，釋放鳳陽輕犯以及監(jiān)禁長(zhǎng)時(shí)間的罪犯。十七日，又步行至南郊祈禱，對(duì)大學(xué)士們說：“天大旱，是因?yàn)殡薏坏?，也是因?yàn)楦鞯赜兴矩澙?，盤剝百姓，致使天怒，今后必須慎選官吏?！泵獬煜率転?zāi)地區(qū)一年田租。五月十六日，下雨。六月初二，慈寧宮建成。初三，建武所叛軍被平定。同月，四川松、茂番人作亂。
秋八月十一日，京師地震。閏九月初一，賑濟(jì)淮、鳳災(zāi)害。初五，朱翊鈞到天壽山觀看壽宮。初十回宮。二十二日中止行刑。
冬十二月初一，淘汰惜薪司內(nèi)官冗員。當(dāng)月，順義王乞慶哈死去。這一年有土魯番、烏斯藏前來朝貢。
萬歷十四年(1586)春二月十八日，嚴(yán)禁外官饋送禮物。三月初三，由于久旱，要廷臣疏陳時(shí)政。初八，禁止部曹言事，放棄整治京畿水田。十八日，賜予唐文獻(xiàn)等人為進(jìn)士及第以及其他不同的出身。二十三日，仍然久旱不雨，朱翊鈞又命天下修身反省。
夏四月初九，京師地震。六月二十日，松茂番被平定。這年夏天，賑濟(jì)直隸、河南、陜西及廣西潯、柳、平樂，廣東瓊山等十二縣饑荒。山西始鬧盜賊。
秋七月初十，賑濟(jì)江西災(zāi)害。十五日，朱翊鈞詔令戶、兵二部安撫災(zāi)民，嚴(yán)格保甲制度。當(dāng)月，淇縣賊人王安聚眾打劫，被剿平。九月初一，王家屏因父喪去職。二十四日，中止行刑。二十八日，朝廷下發(fā)帑并派官吏賑濟(jì)河南、山東、直隸、陜西、遼東、淮、鳳災(zāi)害。
冬十月初五，禮部主事盧洪春上疏奏請(qǐng)謹(jǐn)慎對(duì)待弊端，被施杖刑后削去官籍。十一月十三日，在京城南郊祭祀上天。這一年，有土魯番前來朝貢。
萬歷十五年(1587)春正月初三，分發(fā)國庫所藏的金帛以賑濟(jì)山西、陜西、河南、山東各地宗室。三月二十六日，乞慶哈之子扯力克世襲順義王之封號(hào)。
夏四月，京師大旱，瘟疫流行。六月初十，禁令廷臣奢侈。當(dāng)月，京師連降大雨，朝廷賑濟(jì)撫恤貧民百姓。
秋七月，江北發(fā)生蝗災(zāi)，江南發(fā)生水災(zāi)，山西、陜西、河南、山東又發(fā)生旱災(zāi)，黃河也在開封決口，朝廷分別給予減免賦稅和賑濟(jì)。八月初三，朱翊鈞以頻繁發(fā)生災(zāi)害為由，命各撫、按官員力懲貪官，清理冤案，減免賦稅，賑濟(jì)撫恤百姓。九月初一，應(yīng)有日食，但因陰云遮掩而不能看見。初三，中止行刑。
冬十月初五，大學(xué)士申時(shí)行奏請(qǐng)皇帝批示轉(zhuǎn)發(fā)留在宮禁中的各種奏章。十一月初三，鄖陽發(fā)生士卒喧亂，巡撫都御史李材被撤職。這一年，有哈密、琉球、烏斯藏前來朝貢。
萬歷十六年(1588)春三月初十，朱翊鈞下詔修改《景皇帝實(shí)錄》，刪去成阝戾王之封號(hào)，后來沒有實(shí)行。山西、陜西、河南及南畿、浙江同時(shí)發(fā)生饑荒和瘟疫。
夏四月，賑濟(jì)江北、大名、開封各府饑荒。五月，四川建昌番作亂，被討伐平定。二十三日，朱翊鈞以倉儲(chǔ)軍械被焚和各省災(zāi)傷為由，命內(nèi)外官員修身反省。六月初八，京師發(fā)生地震。十二日，因?yàn)?zāi)害而停止和減少蘇、杭織造。
秋七月初四，免除山東受災(zāi)之地的夏糧賦稅。十九日，制訂考察邊疆官員政績(jī)的方法。八月十四日，朱翊鈞詔令從太倉取銀二十萬兩充作閱陵的犒賞費(fèi)用。九月初九，中止行刑。初十，朱翊鈞到天壽山視察壽宮。十四日，在石景山停留觀看渾河。十五日回宮。二十日，甘肅發(fā)生兵變，巡撫都御史曹子登被罷免。當(dāng)月，青海部長(zhǎng)他不囊進(jìn)犯西寧，殺害其副將李魁。冬十一月十二日，禁止空泛、冗長(zhǎng)之奏章。這一年有烏斯藏前來朝貢。
萬歷十七年(1589)春正月初一，有日食。初九，太湖、宿、松一帶有劉汝國等賊寇作亂，安慶指揮陳越率兵討伐，戰(zhàn)死。二月十九日，吳松指揮陳懋功討伐并平定亂賊。三月初九，被罷免和升遷的官員上朝面謝。從此以后皇帝臨御逐漸減少。十六日，云南永昌發(fā)生兵變。十八日，賜焦..等人以進(jìn)士及第和其他不同出身。
夏四月二十三日，王家屏重新入閣。始興妖僧李圓朗作亂，進(jìn)犯南雄，被有司率兵討伐并斬死。六月初九，浙江發(fā)生風(fēng)災(zāi)，海潮泛濫。十四日，永昌叛軍被平定。三十日，南畿、浙江大旱，太湖干涸，撥國庫銀四十萬兩予以賑濟(jì)。
秋八月二十七日，嚴(yán)申匿名揭發(fā)禁令。
冬十月初九，中止行刑。二十九日，完成黃河決口筑堤工程。十二月十六日，朱翊鈞告誡各位官員遇事不要爭(zhēng)強(qiáng)好勝。這一年，安南、烏斯藏曾來進(jìn)貢。
萬歷十八年(1590)春正月初一，朱翊鈞召見大學(xué)士申時(shí)行等人于毓德宮，并引皇長(zhǎng)子前來相見。
夏四月十三日，賑濟(jì)湖廣饑荒。六月初九，免京畿受災(zāi)地區(qū)的夏糧賦稅。十四日，青海部長(zhǎng)火落赤進(jìn)犯洮州，副總兵李聯(lián)芳戰(zhàn)敗死去。十五日，更改宗藩先例，對(duì)無封爵者聽其自便。
秋七月初一，有日食。二十六日，朱翊鈞召見內(nèi)閣大臣商議邊防大事，同時(shí)要他們舉薦將材。三十日，兵部尚書鄭雒經(jīng)略陜西四鎮(zhèn)及山西、宣、大邊務(wù)。當(dāng)月，火落赤再次進(jìn)犯河州、臨洮，總兵官劉承嗣戰(zhàn)敗。八月初四，停止扯力克互市及對(duì)其的賞賜。
冬十月初十，賑濟(jì)臨洮遭受戰(zhàn)亂的軍隊(duì)和百姓。十二月十六日，朱翊鈞派遣朝廷大臣九人視察邊防。這一年有安南前來朝貢。
萬歷十九年(1591)春正月，緬甸攻占永昌、騰越。二月十八日，總兵官尤繼先在莽剌川打敗火落赤余眾。閏三月十二日，朱翊鈞以出現(xiàn)彗星為由，命群臣修身反省。十四日，責(zé)備給事中、御史擅進(jìn)譏諷皇帝之言，罰減其官俸一年。
夏四月初一，祭祀太廟。此后，廟中祭祀都遣人代替。五月十八日，四川四哨番作亂，巡撫都御史李尚思討伐平定叛亂。六月十九日，王錫爵歸鄉(xiāng)探親。
秋七月二十日，朱翊鈞告誡廷臣：因國事紛紜，使得大臣爭(zhēng)相請(qǐng)求辭官還鄉(xiāng)，以后有肆行誣蔑的人要從重治罪。八月初五，免除河南受災(zāi)地方的田租。九月初十，許國辭官。十二日，申時(shí)行辭官。十五日，吏部侍郎趙志皋擔(dān)任禮部尚書，原禮部侍郎張位擔(dān)任吏部侍郎，一同兼任東閣大學(xué)士，參與機(jī)要事務(wù)。
冬十月初一，京營軍官在長(zhǎng)安門嘩變。十二月初二，下詔規(guī)定戚臣莊田數(shù)目。二十一日，河套部敵進(jìn)犯榆林、延綏，總兵官杜桐將其擊敗。這一年，京師發(fā)生蝗災(zāi)，南畿、浙江發(fā)生水災(zāi)，朝廷分別予以賑濟(jì)和減免賦稅。同年，琉球前來朝貢。
萬歷二十年(1592)春正月二十六日，給事中孟養(yǎng)浩建議立太子，被施杖刑于闕下，并被削除官籍。三月初八，寧夏已辭官的副總兵口孛拜殺害巡撫都御史黨馨、副使石繼芳，占據(jù)城池反叛。十一日，王家屏辭官。十二日，總督軍務(wù)的兵部尚書魏學(xué)曾領(lǐng)兵討伐寧夏叛賊。十八日，朱翊鈞賜予翁正春等人以進(jìn)士及第及其他不同的出身。
夏四月十五日，總兵官李如松提督陜西討賊軍務(wù)。二十六日，甘肅巡撫都御史葉夢(mèng)熊率兵會(huì)同魏學(xué)曾討賊。扯力克擒住賊首，開關(guān)獻(xiàn)俘，于是朝廷返還其兩年互市賞賜。五月，倭寇進(jìn)犯朝鮮，攻陷王京，朝鮮王李日公逃往義州求救。六月十九日，各路兵馬進(jìn)軍到寧夏，賊寇引誘河套部進(jìn)犯，被官軍擊退。
秋七月十六日，免除陜西拖欠賦稅。十七日，副總兵祖成訓(xùn)率兵援救朝鮮，在平壤與倭寇交戰(zhàn)，戰(zhàn)敗。二十七日，罷免三邊總督魏學(xué)曾，以葉夢(mèng)熊取而代之，不久逮捕魏學(xué)曾，打進(jìn)監(jiān)獄。八月十八日，兵部右侍郎宋應(yīng)昌經(jīng)略防備倭寇之軍務(wù)。二十二日，朝廷詔諭各地督撫舉薦將材。九月十六日，平定寧夏賊寇。
冬十月十六日，李如松提督薊、遼、保定、山東軍務(wù)，并擔(dān)任防海御倭總兵官，援救朝鮮。同月，賑濟(jì)京畿、浙江、河南受災(zāi)各府，并分別對(duì)田租予以減免。十一月十二日，朱翊鈞駕臨午門，接受寧夏戰(zhàn)俘。十二月八日，告示天下：寧夏賊寇已被平定。這一年，有暹羅、土魯番前來朝貢。
萬歷二十一年(1593)春正月十九日，李如松將平壤倭寇擊敗。十六日，王錫爵還朝。二十六日，朱翊鈞下詔封三個(gè)皇子為王，朝廷大臣據(jù)理力爭(zhēng)，不久作罷。二十七日，李如松進(jìn)攻王京，在碧蹄館與倭寇相遇，戰(zhàn)敗。二月二十九日，犒勞東征將士。
夏四月十九日，倭寇放棄王京而遁。六月十四日，朱翊鈞詔令天下各地每年夏季審訊囚犯，對(duì)輕犯之類予以減刑和釋放，以兩京為例。二十日，倭使小西飛真誠請(qǐng)求投降。
秋七月初一，詔諭救援朝鮮的各邊鎮(zhèn)軍隊(duì)返回。初三，出現(xiàn)彗星，命群臣修身反省。八月初五，朱翊鈞以災(zāi)異頻繁為由，命內(nèi)外諸臣修舉實(shí)政。
冬十月十六日，中止行刑。十二月初七，薊遼總督顧養(yǎng)謙兼理朝鮮事務(wù)，召回宋應(yīng)昌、李如松。當(dāng)年，賑濟(jì)江北、湖廣、河南、浙江、山東饑荒。河南礦賊大起。烏斯藏前來朝貢。
萬歷二十二年(1594)春正月二十日，朱翊鈞詔示天下：各省災(zāi)害頻繁，尤以山東、河南、徐、淮為甚，盜賊四起，官吏玩忽職守，朝廷詔令不行，自今以后，要以安民除盜之政績(jī)來決定罷免和升遷撫按官員。二月初四，皇長(zhǎng)子朱常洛出閣講學(xué)。十六日，派官員賑濟(jì)河南，并免除其田租。三月二十五日，詔令修訂國史。
夏四月初一，日食。五月十四日，禮部尚書陳于陛、南京禮部尚書沈一貫同時(shí)兼任東閣大學(xué)士，參與機(jī)要事務(wù)。二十四日，王錫爵辭官。六月初二，雷雨交加，西華門遭災(zāi)，詔令修身反省。
秋七月二十日，河套部長(zhǎng)卜失兔進(jìn)犯延綏。當(dāng)月，延綏總兵官麻貴在下馬關(guān)擊敗河套部敵軍。
冬十月十五日，南京兵部右侍郎邢..總督川、貴軍務(wù)，討伐播州宣慰使楊應(yīng)龍。二十三日，詔諭倭使入朝。當(dāng)月，炒花進(jìn)犯遼東，總兵官董一元將其擊敗。這一年，琉球、烏斯藏入朝進(jìn)貢。
萬歷二十三年(1595)春正月癸卯日，朝廷派遣都督僉事李宗城、指揮楊方亨封平秀吉為日本國王。三月二十三日，賜朱之蕃等人為進(jìn)士及第以及其他不同出身。
夏五月二十六日，京師地震，朱翊鈞命令群臣修身反省。
秋九月初九，青海部長(zhǎng)永邵卜進(jìn)犯甘肅，參將達(dá)云將其擊敗。十六日，下詔恢復(fù)建文年號(hào)。
冬十一月初三，湖廣遭災(zāi)，分別予以減免賦稅和賑濟(jì)。十二月初三，大學(xué)士趙志皋等人請(qǐng)求批發(fā)留在宮禁中的奏章，未得答復(fù)。這一年，江北發(fā)生水災(zāi)，淮河水漫河堤，淹沒泗州祖陵。
萬歷二十四年(1596)春二月十一日，麻貴將河套部擊敗。三月初八，乾清、坤寧二宮遭火災(zāi)，朱翊鈞命群臣修身反省。二十五日，下詔自責(zé)。當(dāng)月，火落赤進(jìn)犯洮河，總兵官劉纟廷將其大敗而逃。
夏四月初三，李宗城從倭營跑回王京。五月初二，河套部之?dāng)耻娺M(jìn)犯甘肅，總兵官楊..將其擊敗。初四，再次商議封倭事宜，命都督僉事楊方亨、游擊沈惟敬前往。六月，賑濟(jì)福建饑荒。
秋七月初二，吏部尚書孫丕揚(yáng)請(qǐng)求批發(fā)推舉補(bǔ)缺官員的奏章，未予答復(fù)。十三日，仁圣皇太后駕崩。二十日，開始派遣中官在畿內(nèi)開礦。不久，河南、山東、山西、浙江、陜西之礦皆獲準(zhǔn)開采，以中官統(tǒng)領(lǐng)。群臣屢次進(jìn)諫，皆未聽取。閏八月初一，日食。初三，大學(xué)士趙志皋奏請(qǐng)朱翊鈞臨朝執(zhí)政，批發(fā)章奏，結(jié)束開礦，未予答復(fù)。九月初二，楊方亨到達(dá)日本，平秀吉拒受封號(hào)，再次侵犯朝鮮。二十二日，安葬孝安莊皇后。此月，河套部又侵犯寧夏。總兵官李如柏將其擊敗。當(dāng)年秋天，黃河在黃土固口決堤。
冬十月十三日，中止行刑。二十二日，開始命中官專管通州專賣稅收。此后，各省皆設(shè)稅使。群臣屢諫不聽。十二月十三日，陳于陛死去。
萬歷二十五年(1597)春正月二十六日，朝鮮使者請(qǐng)求救援。二月初五，再次商議討伐倭寇。十五日，原都督同知麻貴擔(dān)任防倭總兵官，統(tǒng)率南北各路兵馬。三月十五日，山東右參政楊鎬擔(dān)任僉都御史，經(jīng)略朝鮮軍務(wù)。三十日，兵部侍郎邢..擔(dān)任尚書，總督薊、遼、保定軍務(wù)，經(jīng)略防倭事宜。
夏六月十九日，皇極、中極、建極三殿發(fā)生火災(zāi)。二十四日，終止編修國史。
秋七月初四，誡諭群臣。初八，詔令大赦天下。當(dāng)月，楊應(yīng)龍反叛，攻占合江、綦江。八月十九日，倭寇攻破朝鮮閑山，于是逼近南原，副總兵楊元棄城逃走，倭兵逼近王京。二十六日，京師地震。九月初四，逮捕原兵部尚書石星，將其投進(jìn)監(jiān)獄，判為死罪。
冬十月十七日，安南黎惟潭篡位自立，并前來請(qǐng)罪，詔令授予其安南都統(tǒng)使。
萬歷二十六年(1598)春正月，官軍攻擊蔚山倭寇，未克，楊鎬、麻貴逃奔王京。三月十八日，賜趙秉忠等人以進(jìn)士及第以及其他不同的出身。二十七日，群臣前往文華門疏請(qǐng)皇長(zhǎng)子成年完婚，未得允許。
夏四月十三日，遼東總兵官李如松出塞，遇伏戰(zhàn)死。十八日，京師大旱，朱翊鈞令群臣修身反省。六月初四，楊鎬被免職。初五，中官李敬在廣東開采珍珠。十三日，張位被免職。二十三日，巡撫天津的僉都御史萬世德經(jīng)略朝鮮。
秋七月初三，中官魯保專賣兩淮的余鹽。八月二十四日，京師地震。九月初十，免除浙江遭災(zāi)地區(qū)的田租。
冬十月初三，總兵官劉纟廷、麻貴分兵攻擊倭寇，將其擊敗。董一元攻擊新寨倭寇，戰(zhàn)敗。十一月十七日，倭兵放棄蔚山逃遁，官軍分兵追擊。十二月，總兵官陳瞞在乙山打敗倭寇，于是朝鮮被平定。這一年，有烏斯藏前來朝貢。
萬歷二十七年(1599)春二月初二，分別派中官統(tǒng)領(lǐng)浙江、福建、廣東市舶司。當(dāng)月，貴州巡撫江東之派兵討伐楊應(yīng)龍。戰(zhàn)敗。三月二十日，原兵部侍郎李化龍總督川、湖、貴州軍務(wù)，討伐楊應(yīng)龍。
夏四月二十五日，朱翊鈞駕臨午門，接受倭寇俘虜。當(dāng)月，臨清百姓叛亂，焚燒稅使馬堂官署，殺其隨從三十四人。閏月初八，詔示天下倭寇被平定，免除加派的東征賦稅。十二日，因久旱不雨而令群臣修身反省。十九日，因各位皇子結(jié)婚而令從太倉取銀二千四百萬兩。戶部匱乏，令從嚴(yán)核實(shí)各地積蓄儲(chǔ)備。六月二十三日，楊應(yīng)龍攻陷綦江，參將房嘉寵、游擊張良賢戰(zhàn)死。
秋八月十八日，陜西狄道縣發(fā)生山崩。九月，土蠻進(jìn)犯錦州。
冬十月初六，賑濟(jì)京城饑民。初十，由于播州用兵，加派四川、湖廣地區(qū)的田賦。十二日，貴州宣慰使安疆臣犯罪，詔令他討伐賊寇以贖罪。十一月初四，免除河南受災(zāi)地區(qū)的田租。二十八日，賑濟(jì)畿輔及鳳陽等地饑荒。十二月初二，武昌、漢陽百姓叛亂，打傷稅使陳奉。十三日，賑濟(jì)京師流民。這一年，琉球前來朝貢。
萬歷二十八年(1600)春二月初四，京師地震。十二日，李化龍率師分八路進(jìn)軍討伐播州。
夏六月初六，攻克海龍囤，楊應(yīng)龍自縊而死，播州平定。
秋七月初十，天大旱，朱翊鈞又令群臣修身反省。八月初一，建成慈慶宮。初六，撤除朝鮮守兵。九月十四日，中止行刑。同年秋天，炒花進(jìn)犯遼東，副總兵解生等人戰(zhàn)敗死去。
冬十月初一，貴州皮林苗叛亂，總兵官陳瞞率兵討伐。初六，云南稅監(jiān)楊榮開采阿瓦、孟密寶井。十二月二十六日，朱翊鈞駕臨午門，察看播州戰(zhàn)俘。
這一年，兩畿各省災(zāi)傷頻繁，民饑盜起，內(nèi)外群臣上奏請(qǐng)求將礦稅監(jiān)官免職，朱翊鈞全不采納。大西洋人利瑪竇進(jìn)獻(xiàn)地方特產(chǎn)。
萬歷二十九年(1601)春正月十三日，詔告天下：由于平定了播州，免除四川、貴州、湖廣、云南加派的田租賦稅，同時(shí)免除官民牽連之罪。當(dāng)月，皮林苗賊被平定。二月初五，賑濟(jì)大同、宣府饑荒。三月十七日，賜封張以誠等人以進(jìn)士及第和其他不同的出身。當(dāng)月，武昌發(fā)生民變，殺掉稅監(jiān)陳奉隨從六人，焚毀巡撫公署。
夏四月十八日，召回陳奉，派守備承天的中官杜茂替代。五月，蘇州民變，殺掉織造中官孫隆隨從數(shù)人。六月，京師已一年未降雨，直到當(dāng)月初九才開始下雨。山東、山西、河南普遍大旱。二十二日，法官奏請(qǐng)熱審，朱翊鈞未予答復(fù)。這年夏天，賑濟(jì)畿內(nèi)饑荒。
秋九月初八，黃河在開封、歸德決堤。十三日，趙志皋死去。十九日，賑濟(jì)貴州饑荒。二十四日，原禮部尚書沈鯉、朱賡同時(shí)兼任東閣大學(xué)士，參與機(jī)要事務(wù)。
冬十月十五日，冊(cè)立皇長(zhǎng)子朱常洛為皇太子，冊(cè)封其他各位皇子常洵為福王、常浩為瑞王、常潤為惠王、常瀛為桂王。并下詔大赦天下。二十八日，加上慈圣皇太后尊號(hào)。十二月初八，詔令恢復(fù)朵顏馬市。
萬歷三十年(1602)春正月二十六日，以四方災(zāi)害頻繁為由令群臣修身反省。二月十六日，朱翊鈞身體不適，召大學(xué)士沈一貫至啟祥宮，詔諭免除礦稅，停止織造，釋放囚犯，恢復(fù)進(jìn)諫的各位大臣職務(wù)。次日，病愈，擱置前詔。二十一日，重建乾清、坤寧二宮。閏月初三，恢復(fù)河套各部貢市。十五日，河州黃河干涸。三月二十二日，騰越民變，殺掉稅監(jiān)所委派的官員。
夏四月初十，賑濟(jì)順天、永平饑荒。五月十四日，法官奏請(qǐng)熱審，未允許。
秋七月二十二日，邊餉匱乏，命從嚴(yán)從快催交拖欠賦稅。當(dāng)月，緬賊攻陷蠻莫宣撫司，宣撫司思正跑回騰越，賊兵追至，官吏殺掉思正進(jìn)獻(xiàn)賊兵，才得解圍。
冬十月初十，賑濟(jì)江北災(zāi)害。二十八日，中止行刑。這一年有琉球、哈密前來朝貢。
萬歷三十一年(1603)春三月初二，吏部奏告天下郡守闕員，沒作答復(fù)。當(dāng)月，播州余賊吳洪等人作亂，有關(guān)官吏討伐并予以平定。
夏四月初一，日食。五月初一，閣臣奏請(qǐng)熱審，未予回復(fù)。二十三日，京師地震。鳳陽天降大雨和冰雹，砸毀皇陵殿脊梁。當(dāng)年夏天，黃河在蘇家莊決堤，淹沒江北豐、沛、魚臺(tái)、單縣。
秋九月十一日，江北發(fā)生盜賊。
冬十月初二，中止行刑。十四日，睢州賊楊思敬作亂，被有司討伐擒獲。十一月十二日，得到一本妖書，傳說皇帝要改立太子，詔令到處嚴(yán)加搜索。十二月初五，朱翊鈞召見皇太子于啟祥宮，賜給皇太子手令給予安慰。
萬歷三十二年(1604)春二月二十一日，閣臣奏請(qǐng)補(bǔ)充司、道、郡、守及派遣巡視各地的御史，未予答復(fù)。三月十四日，建成乾清宮。十五日，賜封楊守勤等人以進(jìn)士及第和其他不同的出身。
夏四月初一，日食。當(dāng)月，完成疏通氵加河的工程。五月二十三日，雷火焚燒了長(zhǎng)陵明樓。六月初七，以長(zhǎng)陵發(fā)生災(zāi)害為由，命補(bǔ)闕官撫恤帶刑在獄囚犯。二十日，昌平發(fā)生水災(zāi)，毀壞長(zhǎng)、泰、康、昭四陵石梁。
秋七月初一，京師大雨，毀壞一些城墻。十二日，賑濟(jì)遭受水災(zāi)之居民。八月二十三日，群臣跪伏文華門，上疏請(qǐng)求提倡修舉實(shí)政，降旨督促。二十八日，完成黃河分水工程。九月初一，賑濟(jì)畿南六府饑荒。閏月二十四日，武昌宗人蘊(yùn)軫等人作亂，殺掉巡撫都御史趙可懷。
冬十月初八，開始對(duì)平定播州的官兵論功。這一年有琉球、烏斯藏前來朝貢。
萬歷三十三年(1605)春正月，重新修復(fù)京師外城。初五，銀定、歹成進(jìn)犯鎮(zhèn)番，總兵官達(dá)云將其擊敗。
夏四月初七，蘊(yùn)軫等被殺。五月二十四日，鳳陽遭受大風(fēng)大雨，毀壞陵殿神座。二十八日，雷擊圜丘望燈高桿。六月初二，以雷擊為由令群臣修身反省。
秋八月二十八日，中止行刑。九月二十四日，昭和殿發(fā)生火災(zāi)。二十六日，京師地震。
冬十一月十一日，免除淮陽遭災(zāi)地區(qū)的田租。十二月初二，詔令天下各地停止開礦。又將稅務(wù)事宜交還有司，將每年收入的一半交至內(nèi)府，另一半交至戶、工二部。初六，免去河南遭災(zāi)地區(qū)的田租。十五日，以皇長(zhǎng)孫出生為由而詔令大赦天下。開宗室科舉入仕之先例。停止開采廣東珠池和云南寶井。
萬歷三十四年(1606)春二月十一日，加上皇太后徽號(hào)。十二日，大學(xué)士沈鯉、朱賡奏請(qǐng)皇帝補(bǔ)齊六部主要官員，未得到答復(fù)。三月十一日，云南百姓殺死稅監(jiān)楊榮，焚燒其尸體。三十日，真定、順德、廣平、大名等地遭災(zāi)，朝廷分別給予減免賦稅和賑濟(jì)。
夏四月二十五日，完成朱旺口黃河疏通工程。五月初六，河套部進(jìn)犯延綏，官軍將其擊潰。六月初六，緬甸攻陷木邦。同月，畿內(nèi)蝗災(zāi)大起。
秋七月十六日，沈一貫、沈鯉辭官。九月二十九日，朱翊鈞要陜西邊防嚴(yán)加防患。
冬十月初一，中止行刑。十一月初四，朵顏來犯，總兵官姜顯謨領(lǐng)兵將敵擊退。十二月十八日，南京妖賊劉天緒謀反，事情敗露伏誅。這一年，有安南、琉球前來朝貢。蒙古喀爾喀各部歸順大清。
萬歷三十五年(1607)春正月初七，給事中翁憲祥進(jìn)言：撫、按官員解任后應(yīng)該隨時(shí)候命，不應(yīng)聽其自流。未得到批復(fù)。二月初五，安南賊人武德成進(jìn)犯云南，總兵官沐睿又將敵擊退。三月十八日，賜封黃士俊等人為進(jìn)士及第以及其他不同的出身。
夏四月初六，銀定、歹成進(jìn)犯涼州，副總兵柴國柱將其擊退。二十日，順義王扌奢力克死去。五月二十七日，原禮部尚書于慎行及禮部侍郎李廷機(jī)、南京吏部侍郎葉向高一同擔(dān)任禮部尚書兼任東閣大學(xué)士，參與機(jī)要事務(wù)。六月，湖廣及徽、寧、太平、嚴(yán)州發(fā)生水災(zāi)。閏月二十日，恢復(fù)河套各部的貢市。
秋七月初十，京師連年陰雨。刑部奏請(qǐng)皇帝批發(fā)關(guān)于熱審的奏章，未予答復(fù)。八月初六，賑濟(jì)畿內(nèi)饑荒。九月初四，中止行刑。
冬十月十四日，山東大旱，饑荒嚴(yán)重，朝廷分別給予賑濟(jì)。十一月二十五日，于慎行死去。十二月，金沙江蠻阿克反叛，攻陷武定，圍攻云南，攻占嵩明、祿豐。安南賊兵進(jìn)犯欽州。這一年，琉球前來朝貢。
萬歷三十六年(1608)春正月，河南、江北發(fā)生饑荒。二月十一日，京師地震。
夏六月二十五日，南畿發(fā)生大水。
秋七月十三日，京師地震。郴州礦賊大起。八月初九，懲治云南失事有罪之臣，巡撫都御史陳用賓、總兵官沐睿又被逮捕入獄，論為死罪。二十七日，賑南畿和嘉興、湖州饑荒。九月初十，四川巡撫都御史喬璧星在東川擒獲阿克，賊寇被平定。
冬十一月三十日，朱賡死去。十二月初五，再次賑濟(jì)南畿，免除其稅糧。這一年，有琉球前來朝貢。
萬歷三十七年(1609)春三月初十，拱兔攻陷大勝堡，游擊于守志在小凌河被戰(zhàn)敗。二十九日，大學(xué)士葉向高奏請(qǐng)皇帝公布群臣互相攻擊的奏文，以論斷是非、整肅人心，未予答復(fù)。
夏四月，倭賊侵犯溫州。
秋九月二十五日，左都御史詹沂封印私自離去。二十九日，中止行刑。當(dāng)年秋季，福建、浙江、江西發(fā)生大水災(zāi)。湖廣、四川、河南、陜西、山西大旱，畿內(nèi)、山東、徐州大鬧蝗災(zāi)。
冬十二月二十二日，朝廷將畿內(nèi)、山東諸省所收稅收的三分之一用作賑濟(jì)饑民費(fèi)用。這一年，日本侵入琉球，抓住其國王尚寧。哈密入朝進(jìn)貢。
萬歷三十八年(1610)春三月十七日，賜封韓敬等人為進(jìn)士及第以及其他不同的出身。
夏四月初二，正陽門樓遭火災(zāi)。十六日，以旱災(zāi)異常為由，要群臣完成自己份內(nèi)職責(zé)，不準(zhǔn)互相攻擊。二十六日，賑濟(jì)畿內(nèi)、山東、山西、河南、陜西、福建、四川饑民。五月，河南賊人陳自管等人作亂，被官吏擒獲。
冬十月辛丑日，中止行刑。十一月初一，有日食。二十七日，以缺乏軍餉為由，要廷臣陳述充倉足庫之策，而且不得從宮內(nèi)撥出金帛。這一年，烏斯藏入朝進(jìn)貢。
萬歷三十九年(1611)春二月庚子日，河套部敵軍進(jìn)犯甘州的紅崖、青湖，被官軍擊退。
夏四月，京師大旱。十九日，怡神殿發(fā)生火災(zāi)。二十七日，設(shè)置邊鎮(zhèn)常平倉。五月初三，御史徐兆魁上奏皇帝，指責(zé)東林講學(xué)諸人暗中支持制定不同的禮典、制度，致使諸臣互相攻擊。廣西、廣東發(fā)生大水災(zāi)。六月，從徐州到北京普遍發(fā)生大水災(zāi)。當(dāng)年夏天，停止熱審。
冬十月初一，戶部尚書趙世卿上書離去。十八日，中止行刑。內(nèi)閣大臣請(qǐng)求釋放輕罪犯人，未予答復(fù)。這一年，暹羅前來朝貢。
萬歷四十年(1612)春二月十九日，吏部尚書孫丕揚(yáng)上書自去官職回鄉(xiāng)。三月十二日，賑濟(jì)京師流民。
夏四月初二，南京各道御史進(jìn)言：“官衙空缺，各方面事務(wù)廢墮，皇上深居宮中二十余年，未接見過大臣，天下將有失去的危險(xiǎn)?！比匀晃从璐饛?fù)。五月初一，日食。
秋八月，黃河在徐州決口。九月十九日，李廷機(jī)自動(dòng)離職。
冬十月二十四日，中止行刑。這一年，琉球中山王尚寧派人奏請(qǐng)歸附。
萬歷四十一年(1613)春正月初二，詔諭朝鮮練兵以防止倭寇。三月十五日，賜封周延儒等人為進(jìn)士及第以及其他不同出身。
夏五月十二日，朱翊鈞詔諭吏部都察院“：幾年來議論紛紛，混淆視聽，朝廷寬容不予追查，致使攻擊誣陷愈來愈甚，朝廷大臣猶疑畏懼，都想辭官回鄉(xiāng)，嚴(yán)重?fù)p害了國體。自今以后，仍有結(jié)黨亂政者，定罪絕不饒恕?！绷鲁醢?，卜失兔世襲順義王封號(hào)。
秋七月初八，兵部尚書掌管都察院事務(wù)的孫瑋辭職回鄉(xiāng)。九月十七日，吏部左侍郎方從哲、原吏部左侍郎吳道南和禮部尚書兼任東閣大學(xué)士，參與機(jī)要事務(wù)。二十五日，吏部尚書趙煥自動(dòng)離職。當(dāng)年，兩畿、山東、江西、河南、廣西、湖廣、遼東發(fā)生水災(zāi)。烏斯藏前來朝貢。
萬歷四十二年(1614)春正月十二日，總兵官劉纟廷率兵討伐建昌叛蠻，將其平定。二月初九，慈圣皇太后駕崩。二十七日，賑濟(jì)畿內(nèi)饑荒。三月二十四日，福王來到都城。
夏四月初四，以皇太后遺命為由大赦天下。六月十三日，安葬孝定皇后。
秋八月十四日，禮部右侍郎孫慎行上疏自動(dòng)去職。二十三日，葉向高辭官。這一年有安南、土魯番前來朝貢。
萬歷四十三年(1615)春正月十八日，完成了徐州黃河決口的筑堤工程。三月初一，有日食。
夏五月初四，薊州一男子張差手持木棒闖入慈慶宮，打傷守門的侍衛(wèi)，被抓進(jìn)監(jiān)獄。十二日，刑部提牢主事王之肕弄清其情況，這就是后來所說的木廷擊案。二十五日，對(duì)皇城門禁嚴(yán)加戒備。二十九日，在慈慶宮召見廷臣。御史劉光復(fù)被抓進(jìn)監(jiān)獄。三十日，張差伏誅。六月初三，由于久旱不雨，朱翊鈞命群臣修身反省。
秋七月初四，賑濟(jì)畿內(nèi)饑荒。二十九日，中止行刑。閏八月初六，重建三殿。十三日，山東大旱，朱翊鈞下詔將稅銀留下進(jìn)行賑濟(jì)。二十三日，河套諸部進(jìn)犯延綏，官軍戰(zhàn)敗，副將孫弘謨被抓獲。
冬十月十八日，京師地震。十一月初六，賑濟(jì)京師饑民。
萬歷四十四年(1616)春三月初一，有日食。十五日，賜封錢士升等人進(jìn)士及第以及其他不同出身。當(dāng)年春天，畿內(nèi)、山東、河南、淮、徐發(fā)生大饑荒，朝廷分別給以賑濟(jì)和減免田賦。
夏四月十九日，河南出現(xiàn)盜賊，朝廷命官吏進(jìn)行安撫和圍剿。六月初三，河套各部落進(jìn)犯延綏，總兵官杜文煥將其擊退。二十九日，黃河在祥符朱家口決堤，淹沒陳、杞、睢、柘各州縣。
秋七月二十八日，河套部落首領(lǐng)吉能率兵進(jìn)犯高家堡，參將王國興戰(zhàn)敗。當(dāng)月，陜西大旱，江西、廣東發(fā)生水災(zāi)，河南、淮、揚(yáng)、常、鎮(zhèn)大鬧蝗災(zāi)，山東盜賊大起。
冬十月初十，中止行刑。十一月初二，隆德殿發(fā)生火災(zāi)。
萬歷四十五年(1617)春二月二十三日，由于前一年冬季無雪，入春以后又沒有下雨，朱翊鈞要群臣修身反省。三月初六，鎮(zhèn)撫司缺乏官吏，獄中很多囚犯因關(guān)押太久而死亡，大學(xué)士方從哲據(jù)此上奏，未得到答復(fù)。初十，賑濟(jì)江西饑荒。
夏五月十三日，久旱不雨，朱翊鈞又命群臣修身反省。六月初三，畿南大鬧饑荒，當(dāng)?shù)毓倮粽?qǐng)求賑濟(jì)，未得到及時(shí)答復(fù)。當(dāng)月，閣臣法官奏請(qǐng)熱審，未得答復(fù)。
秋七月初一，日食。初五，吳道南因丁服父母喪事離職。這一年，兩畿、河南、山東、山西、陜西、江西、湖廣、福建、廣東遭災(zāi)。暹羅、烏斯藏曾來朝進(jìn)貢。
萬歷四十六年(1618)春二月十五日，賑濟(jì)廣東饑荒。
夏四月十五日，大清軍隊(duì)攻克撫順，千總王命印戰(zhàn)死。二十日，總兵官張承胤領(lǐng)兵救援撫順，也全軍覆沒。閏月初二，楊鎬擔(dān)任兵部左侍郎兼右僉都御史，經(jīng)略遼東。六月二十六日，京師地震。這年夏天，官吏奏請(qǐng)熱審，未得到答復(fù)。
秋七月二十日，大清軍隊(duì)攻占清河堡，守將鄒儲(chǔ)賢、張旆戰(zhàn)死。八月十六日，朝廷將軍餉海運(yùn)到遼東。二十四日，乃蠻等七部落請(qǐng)求與朝廷相通。二十五日中止行刑。九月初七，守遼軍隊(duì)缺乏糧餉，有關(guān)官員奏請(qǐng)撥用各省稅銀，未得到及時(shí)答復(fù)。二十六日，加派天下田賦。三十日，京師發(fā)生地震。
冬十一月初九，因?yàn)?zāi)異頻繁而令群臣修身反省。十二月初二，河套部落首領(lǐng)猛克什力前來投降。這一年有土魯番、天方、撒馬兒罕、魯迷、哈密、烏斯藏前來朝貢。
萬歷四十七年(1619)春二月十一日，經(jīng)略楊鎬在遼陽誓師，總兵官李如柏、杜松、劉纟廷、馬林分道出塞。三月初一，杜松在吉林崖遭遇大清軍隊(duì)，戰(zhàn)死。初二，馬林在飛芬山戰(zhàn)敗，兵備僉事潘宗顏戰(zhàn)死。初七，劉纟廷率軍深入阿布達(dá)里岡，戰(zhàn)死。十八日，賜莊際昌等人為進(jìn)士及第以及其他不同出身。
夏四月二十日，盔甲廠發(fā)生火災(zāi)。六月十六日，大清軍隊(duì)攻克開原，馬林全軍覆沒。二十二日，大理寺丞熊廷弼擔(dān)任兵部右侍郎兼右僉都御史，經(jīng)略遼東。二十三日，朝廷大臣聚于文華門，奏請(qǐng)皇帝批復(fù)奏章以及增派援軍和分發(fā)糧餉，未得到答復(fù)。
秋八月初五，山東蝗災(zāi)。十三日，逮捕楊鎬。九月初一，中止行刑。初九，百官跪伏于宮殿階下，奏請(qǐng)朱翊鈞上朝處理政事，未得到答復(fù)。
冬十月初八，賑濟(jì)京師饑民。十二月，又加派全國田租賦稅。二十二日，鎮(zhèn)江、寬奠、云爰陽新募援兵被擊潰。這一年有暹羅前來朝貢。
萬歷四十八年(1620)春正月二十一日，朝鮮請(qǐng)求救援。三月十二日，再次加派全國田租賦稅。
夏四月初六，皇后王氏死去。十一日，朱翊鈞病發(fā)，在弘德殿召見方從哲。
秋七月十七日，朱翊鈞病情加重，在弘德殿召見英國公張惟賢，大學(xué)士方從哲，尚書周嘉謨、李汝華、黃嘉善、張問達(dá)、黃克纘，侍郎孫如游，勉勵(lì)各位大臣勤政敬職。二十一日，死去，時(shí)年五十八歲。遺詔停止一切榷稅和新增織造等。九月初十，追加尊敬謚號(hào)，廟號(hào)神宗，安葬于定陵。
隆慶二年(1568)，被立為皇太子，當(dāng)時(shí)年方六歲。翊鈞少年聰慧，穆宗曾馳馬宮中，他進(jìn)諫道：“陛下為天下之主，獨(dú)騎而騁，寧無銜橛憂?！蹦伦诖笙玻埋R大加撫慰。陳皇后病居別宮，翊鈞每晨隨母前往探問，皇后每聽到腳步聲就高興起來，并掙扎著坐起，取出經(jīng)書考問他，翊鈞總是高聲回答，其母李貴妃也十分高興，兩宮因此而越來越和睦。
隆慶六年(1572)五月，穆宗駕崩。六月初一，日食。初十，朱翊鈞繼承皇帝之位。定第二年為萬歷元年，頒詔大赦天下。在鄉(xiāng)間祭祀建文朝盡節(jié)諸臣，有子孫后代的加以恤錄。十六日，罷免高拱。二十三日，高儀死去。二十八日，禮部尚書呂調(diào)陽兼任文淵閣大學(xué)士，參預(yù)機(jī)要事務(wù)。
秋七月初四，漕運(yùn)初通至密云。初七，考察京師官員。十五日，告誡朝廷諸臣“：近年來，士習(xí)慣于澆薄，為官之禮法被削弱，誣蔑老成為無用，驕狂者便佞為有才。于是使朝廷賦予的權(quán)力，僅僅成為人臣報(bào)復(fù)的資本。雖需要加以懲戒，但我都予以寬恕。諸臣應(yīng)力改前過，共維新政。若仍沉溺于故習(xí)，背公徇私，獲罪于祖宗，朕不敢赦免?！笔呷眨鸱Q陳皇后為仁圣皇太后，李貴妃為慈圣皇太后。八月初五，祭祀大社大稷。九月十一日，將莊皇帝安葬于昭陵。
冬十月初六，侍郎王遴、吳百朋、汪道昆分別巡視邊防。初八，中止行刑。十一月十三日，河工完成。十二月初九，賑濟(jì)榆林、延綏饑荒。二十二日，以穆宗駕崩不久為由，下詔免設(shè)元夕燈火及宮中宴席。
萬歷元年(1573)春二月初二日，聽取經(jīng)筵講解。三月十六日，詔令內(nèi)外官員舉薦將材。
夏四月十六日，潮、惠賊寇被平定。二十一日，天大旱，諭百官修身反省。五月初五，詔令內(nèi)外官員慎重進(jìn)行刑獄之事。六月二十四日，賑濟(jì)淮安水災(zāi)。
秋七月，黃河在徐州決口。九月初六，賑濟(jì)荊州、承天及濟(jì)南災(zāi)害。初九，四川都掌蠻被平定。二十六日，中止行刑。
冬十一月初四，朱翊鈞詔令諸司訂立章程限制文書上報(bào)時(shí)間，以防延遲緩慢。十二月十三日，賑濟(jì)遼東饑荒。
萬歷二年(1574)春正月十八日，朱翊鈞在皇極門召見朝覲廉能之官。二月初九，賑濟(jì)四川被賊寇侵?jǐn)_諸縣。三月十八日，賜予孫繼皋等人進(jìn)士及第以及其他不同的出身。
夏四月二十二日，朱翊鈞詔諭百官行久任之法。五月二十八日，穆宗牌位附于太廟。八月二十八日，賑濟(jì)山西災(zāi)害。二十九日，賑濟(jì)淮、揚(yáng)、徐水災(zāi)。
冬十月十三日，審理囚犯。二十六日，上朝辦公審閱選官制度。閏十二月二十日，下詔免去第二年元夕燈火。當(dāng)年，琉球前來朝貢。
萬歷三年(1575)春正月初七，祭獻(xiàn)太廟。二月初九，祭祀大社大稷。十二日，詔令南京職務(wù)應(yīng)精簡(jiǎn)為宜，官吏不得虛占其位以充數(shù)。二十七日，開始命日講官分別記注起居，纂輯章奏，臨朝值班。
夏四月初一，日食，為日全食。初四，翊鈞書寫謹(jǐn)天戒、任賢能、親賢臣、遠(yuǎn)嬖佞、明賞罰、謹(jǐn)出入、慎起居、節(jié)飲食、收放心、存敬畏、納忠言、節(jié)財(cái)用十二事置于座右側(cè)，以期自警。五月初三，淮、揚(yáng)發(fā)生大水災(zāi)，于是他詔令審察二府官吏，罷免了有貪污等老毛病的官員。六月初一，浙江海潮泛濫。十一日，命撫、按官員，官吏是否賢能一并舉薦和彈劾，不得偏重甲科進(jìn)士。當(dāng)年夏天，蘇、松、常、鎮(zhèn)普發(fā)大水。
秋八月十一日，禮部侍郎張四維被升為禮部尚書兼任東閣大學(xué)士，參與機(jī)要事務(wù)。十二日，黃河在高郵、碭山?jīng)Q口。二十三日，朝廷免除淮、揚(yáng)、鳳、徐等發(fā)生水災(zāi)之地的田租。九月二十三日，京師發(fā)生地震。
冬十月初三，京師再次地震，命群臣修身反省。初四，中止行刑。十一月十一日，朱翊鈞在京城南郊祭天。十二月初七，朱翊鈞又詔諭免去第二年元夕燈火。這一年，有安南、琉球、暹羅、土魯番前來朝貢。
萬歷四年(1576)春正月二十三日，遼東巡按御史劉臺(tái)因談?wù)搹埦诱淮度氇z，削除官籍。
夏五月十六日，祭祀地于北郊。六月十九日，又遣內(nèi)臣監(jiān)督蘇、杭織造。
秋七月初六，朱翊鈞詔諭吏、戶二部清理吏治，并分別免除所欠賦稅，折十分之三成收取明年漕運(yùn)糧。十一日，又派遣御史督修江、浙水利。十三日，興修泗州祖陵。二十日，完成草灣黃河工程。八月初二，祭奠先師孔子。當(dāng)年秋天，黃河在崔鎮(zhèn)決口。
冬十月十四日，賑濟(jì)徐州及豐、沛、睢寧、金鄉(xiāng)、魚臺(tái)、單、曹七縣水災(zāi)，免除不同數(shù)量的田租。這一年，有安南、琉球、烏斯藏、土魯番、天方、撒馬兒罕、魯迷、哈密前來朝貢。
萬歷五年(1577)春正月二十一日，朱翊鈞詔令鳳陽、淮安大力號(hào)召墾田。二月初七，賑濟(jì)廣西饑荒。三月十八日，賜予沈懋學(xué)等為進(jìn)士及第以及其他不同的出身。
夏五月初六，廣東羅旁瑤被平定。
秋八月初八，黃河又在崔鎮(zhèn)決口。閏八月初一，日食，因陰云而未見。九月初二，重新起用張居正。
冬十月二十二日，因談?wù)搹埦诱蚋竼适露┧胤k公、不參加吉禮一事，編修吳中行、檢討趙三賢、員外郎艾穆、主事沈思孝等皆受杖刑，并分別被罷免和廢黜，甚至遭到貶謫和戍邊。二十四日，進(jìn)士鄒元標(biāo)被杖擊，進(jìn)而將其戍邊。十一月初一，朝廷以星位變化考察百官。當(dāng)年，有琉球前來朝貢。
萬歷六年(1578)春正月，朝廷征集民工修筑黃河缺口堤岸。二月十七日，免除兗、青、登、萊所轄地區(qū)的拖欠賦稅。十九日，冊(cè)立王氏為皇后。三月初三，禮部尚書馬自強(qiáng)兼任文淵閣大學(xué)士，吏部侍郎申時(shí)行兼任東閣大學(xué)士，參與機(jī)要事務(wù)。十三日，張居正因安葬父親而還鄉(xiāng)。
夏四月十四日，免除湖廣、四川所欠的賦稅。二十五日，朱翊鈞詔諭戶部每年增收金花銀二十萬兩。六月十五日，張居正回京師。
秋七月初六，呂調(diào)陽辭官。二十七日，朝廷詔諭江北各府百姓，十五歲以上而無田者，官府供給其一頭牛和五十畝田，開墾三年后開始征收賦稅。九月二十二日，又詔諭蘇州諸府開墾荒田，六年之后起科。二十三日，中止行刑。
冬十月十四日，馬自強(qiáng)死去。十一月十四日，祭祀天于南郊。這一年，有烏斯藏前來朝貢。
萬歷七年(1579)春正月二十二日，朱翊鈞下詔搗毀天下書院。二月十四日，派人分頭巡視邊防。三月十九日，朝廷免除淮、揚(yáng)拖欠賦稅。
夏五月十九日，祭祀地于北郊。六月十七日，核查兩畿、山東、陜西等地勛官、皇戚的田賦。
秋七月初八，賑濟(jì)蘇、松水災(zāi)，免除其稅糧。十四日，京師發(fā)生地震。這一年，有烏斯藏前來朝貢。
萬歷八年(1580)春二月初一，有日食。十八日，耕種謖田。二十八日，完成黃河決口工程。三月十二日，侍奉兩宮皇太后到天壽山謁陵，免除所過地方的田租。十五日，回宮。二十八日，賜予張懋修等人為進(jìn)士及第以及其他不同的出身。
夏閏四月二十二日，官軍平定廣西八寨賊寇。
冬十月初五，淘汰宮內(nèi)宮外冗官。初九，賑濟(jì)蘇、松、常、鎮(zhèn)饑荒。十一月初十，下詔丈量百姓田地。這年，有琉球前來朝貢。
萬歷九年(1581)春正月初五，詔令邊臣備警。初六，裁減諸司冗員。初八，土蠻進(jìn)犯錦州，游擊周之望敗死。十四日，朱翊鈞詔命翰林官每天四人入閣供職。十六日，裁減南京冗官。十九日，遼東總兵官李成梁在襖郎兔擊敗土蠻。三月初三，隆重檢閱軍隊(duì)。當(dāng)月，土蠻進(jìn)犯遼陽，副總兵曹..領(lǐng)兵抵抗，戰(zhàn)敗。
夏四月初四，賑濟(jì)山西發(fā)生災(zāi)害的州縣。二十二日，賑濟(jì)蘇、松、淮、鳳、徐、宿災(zāi)害。戶部呈上《萬歷會(huì)計(jì)錄》。
秋八月十六日，揚(yáng)州發(fā)大水。九月二十六日，中止行刑。
冬十月初八，土蠻進(jìn)犯廣寧、義州，李成梁將其擊退。十一月二十六日，賑濟(jì)真定、順德、廣平災(zāi)害，免除稅糧。當(dāng)年，裁減各省冗官，核查徭役賦稅，淘汰諸司冒濫冗費(fèi)。有琉球、安南、土魯番、天方、撒馬兒罕、魯迷、哈密、烏斯藏前來朝貢。
萬歷十年(1582)春二月初四，順義王俺答死去。初八，免去天下歷年拖欠的賦稅。三月初二，杭州發(fā)生兵變，巡撫吳善言被抓。初九，兵部侍郎張佳胤巡撫浙江討伐叛軍，繼而予以平定。十八日，泰寧衛(wèi)部長(zhǎng)速把亥進(jìn)犯義州，李成梁將其擊敗。二十一日，倭寇侵犯溫州。
夏四月初一，朱翊鈞告諭禮部，要倡導(dǎo)百姓及時(shí)耕種農(nóng)桑，不要游手好閑。初七，寧夏土軍馬景殺害參將許汝繼，巡撫都御史晉應(yīng)槐領(lǐng)兵對(duì)其討伐并誅殺了他。十三日，由于久旱不雨，命令百官修身反省。五月初三，或多或少地免除了先師孔子和宋儒朱熹、李侗、羅從彥、蔡沈、胡安國、游酢、真德秀、劉子..、已故大學(xué)士楊榮等人后裔的賦稅徭役。二十三日，賑濟(jì)京畿饑荒。六月初一，有日食。十六日，賑濟(jì)太原、平陽、潞安饑荒。十九日，前禮部尚書潘晟兼任武英殿大學(xué)士，吏部侍郎余有丁擔(dān)任禮部尚書兼文淵閣大學(xué)士，參與機(jī)要事務(wù)。不久，潘晟又被罷免。二十日，張居正死去。
秋七月十五日，賑濟(jì)平、慶、延、臨、鞏饑荒。九月初一，朱翊鈞因得皇長(zhǎng)子而頒詔大赦天下。初九，上兩宮皇太后徽號(hào)。
冬十月十二日，蘇、松發(fā)大水，朝廷采取了免賦和賑濟(jì)的措施。十二月八日，太監(jiān)馮保被貶為奉御，全家削去官籍。十八日，恢復(fù)建言諸臣職務(wù)。當(dāng)年，又免除京畿內(nèi)、山西受災(zāi)害之地的稅糧。哈密、烏斯藏曾來京朝貢。
萬歷十一年(1583)春正月初八，命令嚴(yán)加防范邊疆。閏二月十一日，俺答之子乞慶哈世襲順義王封號(hào)。緬甸侵犯永昌。十二日，朱翊鈞到天壽山進(jìn)謁九陵，免除路過之地的田租。十七日，又到西山進(jìn)謁恭讓章皇后、景皇帝之陵。十八日回宮。乙酉日，賑濟(jì)臨、鞏、平、延、慶五府旱災(zāi)，免除其田租。三月初二追削張居正的官級(jí)。十八日，賜予朱國祚等人為進(jìn)士及第和其他不同的出身。
夏四月初六，張四維因父喪離職。初八，吏部侍郎許國擔(dān)任禮部尚書兼東閣大學(xué)士，參與機(jī)要事務(wù)。二十三日，承天普降大雨，長(zhǎng)江水勢(shì)泛濫。同月，廣東羅定發(fā)生兵變。五月，大清太祖高皇帝起兵征伐尼堪外蘭，攻克圖倫城。六月十五日，賑濟(jì)承天、漢陽、鄖陽、襄陽災(zāi)害。
秋八月初七，免除山西受災(zāi)地區(qū)的稅糧。九月初六日，朱翊鈞到天壽山拜謁祖陵，十一日回宮。
冬十月十五日，中止行刑。二十三日，河南發(fā)生水災(zāi)，分別予以免租和賑濟(jì)。十一月初一，有日食。十二月二十二日，慈慶宮受災(zāi)，詔諭修身反省。當(dāng)年，有琉球前來朝貢。
萬歷十二年(1584)春二月二十日，京師地震。二十二日，釋放建文諸臣外親遭貶及戍邊者的后裔。三月二十二日，減少江西瓷器的燒造。
夏四月初九，查抄張居正家。十一日，游擊將軍劉纟廷討伐平定隴川賊寇。五月十九日，京師地震。六月初六，以云南用兵為由，免去稅糧及拖欠賦役。
秋八月十三日，將張居正之罪張榜公布于天下，并將其家屬戍邊。九月十三日，事奉兩宮皇太后到天壽山拜謁皇陵。十六日，建造壽宮。二十一日，返回宮中。
冬十月十五日，中止行刑。二十四日，免除湖廣、山東受災(zāi)地方的稅糧。十一月十六日，余有丁死去。十二月初二，前禮部侍郎王錫爵擔(dān)任禮部尚書兼文淵閣大學(xué)士，吏部侍郎王家屏兼東閣大學(xué)士，參與機(jī)要事務(wù)。二十二日，停止開采銀礦。這一年有安南、烏斯藏入朝進(jìn)貢。
萬歷十三年(1585)春正月十九日，四川建武所兵變，擊傷總兵沈思學(xué)。二月初六日，南京發(fā)生地震。京師自去年八月以來沒有降雨。三十日，舉行盛大祈雨祭祀。三月十三日，再次隆重舉行祈雨祭祀。十八日，李成梁出塞襲擊把兔兒炒花，取得大勝。二十一日，減少杭州織造及尚衣監(jiān)料銀。尚寶司少卿徐貞明督治京畿水田。
夏四月初五，舉行盛大祈雨祭祀。初七，由于久旱不雨，朱翊鈞詔令各地審理、平反冤案，釋放鳳陽輕犯以及監(jiān)禁長(zhǎng)時(shí)間的罪犯。十七日，又步行至南郊祈禱，對(duì)大學(xué)士們說：“天大旱，是因?yàn)殡薏坏?，也是因?yàn)楦鞯赜兴矩澙?，盤剝百姓，致使天怒，今后必須慎選官吏?！泵獬煜率転?zāi)地區(qū)一年田租。五月十六日，下雨。六月初二，慈寧宮建成。初三，建武所叛軍被平定。同月，四川松、茂番人作亂。
秋八月十一日，京師地震。閏九月初一，賑濟(jì)淮、鳳災(zāi)害。初五，朱翊鈞到天壽山觀看壽宮。初十回宮。二十二日中止行刑。
冬十二月初一，淘汰惜薪司內(nèi)官冗員。當(dāng)月，順義王乞慶哈死去。這一年有土魯番、烏斯藏前來朝貢。
萬歷十四年(1586)春二月十八日，嚴(yán)禁外官饋送禮物。三月初三，由于久旱，要廷臣疏陳時(shí)政。初八，禁止部曹言事，放棄整治京畿水田。十八日，賜予唐文獻(xiàn)等人為進(jìn)士及第以及其他不同的出身。二十三日，仍然久旱不雨，朱翊鈞又命天下修身反省。
夏四月初九，京師地震。六月二十日，松茂番被平定。這年夏天，賑濟(jì)直隸、河南、陜西及廣西潯、柳、平樂，廣東瓊山等十二縣饑荒。山西始鬧盜賊。
秋七月初十，賑濟(jì)江西災(zāi)害。十五日，朱翊鈞詔令戶、兵二部安撫災(zāi)民，嚴(yán)格保甲制度。當(dāng)月，淇縣賊人王安聚眾打劫，被剿平。九月初一，王家屏因父喪去職。二十四日，中止行刑。二十八日，朝廷下發(fā)帑并派官吏賑濟(jì)河南、山東、直隸、陜西、遼東、淮、鳳災(zāi)害。
冬十月初五，禮部主事盧洪春上疏奏請(qǐng)謹(jǐn)慎對(duì)待弊端，被施杖刑后削去官籍。十一月十三日，在京城南郊祭祀上天。這一年，有土魯番前來朝貢。
萬歷十五年(1587)春正月初三，分發(fā)國庫所藏的金帛以賑濟(jì)山西、陜西、河南、山東各地宗室。三月二十六日，乞慶哈之子扯力克世襲順義王之封號(hào)。
夏四月，京師大旱，瘟疫流行。六月初十，禁令廷臣奢侈。當(dāng)月，京師連降大雨，朝廷賑濟(jì)撫恤貧民百姓。
秋七月，江北發(fā)生蝗災(zāi)，江南發(fā)生水災(zāi)，山西、陜西、河南、山東又發(fā)生旱災(zāi)，黃河也在開封決口，朝廷分別給予減免賦稅和賑濟(jì)。八月初三，朱翊鈞以頻繁發(fā)生災(zāi)害為由，命各撫、按官員力懲貪官，清理冤案，減免賦稅，賑濟(jì)撫恤百姓。九月初一，應(yīng)有日食，但因陰云遮掩而不能看見。初三，中止行刑。
冬十月初五，大學(xué)士申時(shí)行奏請(qǐng)皇帝批示轉(zhuǎn)發(fā)留在宮禁中的各種奏章。十一月初三，鄖陽發(fā)生士卒喧亂，巡撫都御史李材被撤職。這一年，有哈密、琉球、烏斯藏前來朝貢。
萬歷十六年(1588)春三月初十，朱翊鈞下詔修改《景皇帝實(shí)錄》，刪去成阝戾王之封號(hào)，后來沒有實(shí)行。山西、陜西、河南及南畿、浙江同時(shí)發(fā)生饑荒和瘟疫。
夏四月，賑濟(jì)江北、大名、開封各府饑荒。五月，四川建昌番作亂，被討伐平定。二十三日，朱翊鈞以倉儲(chǔ)軍械被焚和各省災(zāi)傷為由，命內(nèi)外官員修身反省。六月初八，京師發(fā)生地震。十二日，因?yàn)?zāi)害而停止和減少蘇、杭織造。
秋七月初四，免除山東受災(zāi)之地的夏糧賦稅。十九日，制訂考察邊疆官員政績(jī)的方法。八月十四日，朱翊鈞詔令從太倉取銀二十萬兩充作閱陵的犒賞費(fèi)用。九月初九，中止行刑。初十，朱翊鈞到天壽山視察壽宮。十四日，在石景山停留觀看渾河。十五日回宮。二十日，甘肅發(fā)生兵變，巡撫都御史曹子登被罷免。當(dāng)月，青海部長(zhǎng)他不囊進(jìn)犯西寧，殺害其副將李魁。冬十一月十二日，禁止空泛、冗長(zhǎng)之奏章。這一年有烏斯藏前來朝貢。
萬歷十七年(1589)春正月初一，有日食。初九，太湖、宿、松一帶有劉汝國等賊寇作亂，安慶指揮陳越率兵討伐，戰(zhàn)死。二月十九日，吳松指揮陳懋功討伐并平定亂賊。三月初九，被罷免和升遷的官員上朝面謝。從此以后皇帝臨御逐漸減少。十六日，云南永昌發(fā)生兵變。十八日，賜焦..等人以進(jìn)士及第和其他不同出身。
夏四月二十三日，王家屏重新入閣。始興妖僧李圓朗作亂，進(jìn)犯南雄，被有司率兵討伐并斬死。六月初九，浙江發(fā)生風(fēng)災(zāi)，海潮泛濫。十四日，永昌叛軍被平定。三十日，南畿、浙江大旱，太湖干涸，撥國庫銀四十萬兩予以賑濟(jì)。
秋八月二十七日，嚴(yán)申匿名揭發(fā)禁令。
冬十月初九，中止行刑。二十九日，完成黃河決口筑堤工程。十二月十六日，朱翊鈞告誡各位官員遇事不要爭(zhēng)強(qiáng)好勝。這一年，安南、烏斯藏曾來進(jìn)貢。
萬歷十八年(1590)春正月初一，朱翊鈞召見大學(xué)士申時(shí)行等人于毓德宮，并引皇長(zhǎng)子前來相見。
夏四月十三日，賑濟(jì)湖廣饑荒。六月初九，免京畿受災(zāi)地區(qū)的夏糧賦稅。十四日，青海部長(zhǎng)火落赤進(jìn)犯洮州，副總兵李聯(lián)芳戰(zhàn)敗死去。十五日，更改宗藩先例，對(duì)無封爵者聽其自便。
秋七月初一，有日食。二十六日，朱翊鈞召見內(nèi)閣大臣商議邊防大事，同時(shí)要他們舉薦將材。三十日，兵部尚書鄭雒經(jīng)略陜西四鎮(zhèn)及山西、宣、大邊務(wù)。當(dāng)月，火落赤再次進(jìn)犯河州、臨洮，總兵官劉承嗣戰(zhàn)敗。八月初四，停止扯力克互市及對(duì)其的賞賜。
冬十月初十，賑濟(jì)臨洮遭受戰(zhàn)亂的軍隊(duì)和百姓。十二月十六日，朱翊鈞派遣朝廷大臣九人視察邊防。這一年有安南前來朝貢。
萬歷十九年(1591)春正月，緬甸攻占永昌、騰越。二月十八日，總兵官尤繼先在莽剌川打敗火落赤余眾。閏三月十二日，朱翊鈞以出現(xiàn)彗星為由，命群臣修身反省。十四日，責(zé)備給事中、御史擅進(jìn)譏諷皇帝之言，罰減其官俸一年。
夏四月初一，祭祀太廟。此后，廟中祭祀都遣人代替。五月十八日，四川四哨番作亂，巡撫都御史李尚思討伐平定叛亂。六月十九日，王錫爵歸鄉(xiāng)探親。
秋七月二十日，朱翊鈞告誡廷臣：因國事紛紜，使得大臣爭(zhēng)相請(qǐng)求辭官還鄉(xiāng)，以后有肆行誣蔑的人要從重治罪。八月初五，免除河南受災(zāi)地方的田租。九月初十，許國辭官。十二日，申時(shí)行辭官。十五日，吏部侍郎趙志皋擔(dān)任禮部尚書，原禮部侍郎張位擔(dān)任吏部侍郎，一同兼任東閣大學(xué)士，參與機(jī)要事務(wù)。
冬十月初一，京營軍官在長(zhǎng)安門嘩變。十二月初二，下詔規(guī)定戚臣莊田數(shù)目。二十一日，河套部敵進(jìn)犯榆林、延綏，總兵官杜桐將其擊敗。這一年，京師發(fā)生蝗災(zāi)，南畿、浙江發(fā)生水災(zāi)，朝廷分別予以賑濟(jì)和減免賦稅。同年，琉球前來朝貢。
萬歷二十年(1592)春正月二十六日，給事中孟養(yǎng)浩建議立太子，被施杖刑于闕下，并被削除官籍。三月初八，寧夏已辭官的副總兵口孛拜殺害巡撫都御史黨馨、副使石繼芳，占據(jù)城池反叛。十一日，王家屏辭官。十二日，總督軍務(wù)的兵部尚書魏學(xué)曾領(lǐng)兵討伐寧夏叛賊。十八日，朱翊鈞賜予翁正春等人以進(jìn)士及第及其他不同的出身。
夏四月十五日，總兵官李如松提督陜西討賊軍務(wù)。二十六日，甘肅巡撫都御史葉夢(mèng)熊率兵會(huì)同魏學(xué)曾討賊。扯力克擒住賊首，開關(guān)獻(xiàn)俘，于是朝廷返還其兩年互市賞賜。五月，倭寇進(jìn)犯朝鮮，攻陷王京，朝鮮王李日公逃往義州求救。六月十九日，各路兵馬進(jìn)軍到寧夏，賊寇引誘河套部進(jìn)犯，被官軍擊退。
秋七月十六日，免除陜西拖欠賦稅。十七日，副總兵祖成訓(xùn)率兵援救朝鮮，在平壤與倭寇交戰(zhàn)，戰(zhàn)敗。二十七日，罷免三邊總督魏學(xué)曾，以葉夢(mèng)熊取而代之，不久逮捕魏學(xué)曾，打進(jìn)監(jiān)獄。八月十八日，兵部右侍郎宋應(yīng)昌經(jīng)略防備倭寇之軍務(wù)。二十二日，朝廷詔諭各地督撫舉薦將材。九月十六日，平定寧夏賊寇。
冬十月十六日，李如松提督薊、遼、保定、山東軍務(wù)，并擔(dān)任防海御倭總兵官，援救朝鮮。同月，賑濟(jì)京畿、浙江、河南受災(zāi)各府，并分別對(duì)田租予以減免。十一月十二日，朱翊鈞駕臨午門，接受寧夏戰(zhàn)俘。十二月八日，告示天下：寧夏賊寇已被平定。這一年，有暹羅、土魯番前來朝貢。
萬歷二十一年(1593)春正月十九日，李如松將平壤倭寇擊敗。十六日，王錫爵還朝。二十六日，朱翊鈞下詔封三個(gè)皇子為王，朝廷大臣據(jù)理力爭(zhēng)，不久作罷。二十七日，李如松進(jìn)攻王京，在碧蹄館與倭寇相遇，戰(zhàn)敗。二月二十九日，犒勞東征將士。
夏四月十九日，倭寇放棄王京而遁。六月十四日，朱翊鈞詔令天下各地每年夏季審訊囚犯，對(duì)輕犯之類予以減刑和釋放，以兩京為例。二十日，倭使小西飛真誠請(qǐng)求投降。
秋七月初一，詔諭救援朝鮮的各邊鎮(zhèn)軍隊(duì)返回。初三，出現(xiàn)彗星，命群臣修身反省。八月初五，朱翊鈞以災(zāi)異頻繁為由，命內(nèi)外諸臣修舉實(shí)政。
冬十月十六日，中止行刑。十二月初七，薊遼總督顧養(yǎng)謙兼理朝鮮事務(wù)，召回宋應(yīng)昌、李如松。當(dāng)年，賑濟(jì)江北、湖廣、河南、浙江、山東饑荒。河南礦賊大起。烏斯藏前來朝貢。
萬歷二十二年(1594)春正月二十日，朱翊鈞詔示天下：各省災(zāi)害頻繁，尤以山東、河南、徐、淮為甚，盜賊四起，官吏玩忽職守，朝廷詔令不行，自今以后，要以安民除盜之政績(jī)來決定罷免和升遷撫按官員。二月初四，皇長(zhǎng)子朱常洛出閣講學(xué)。十六日，派官員賑濟(jì)河南，并免除其田租。三月二十五日，詔令修訂國史。
夏四月初一，日食。五月十四日，禮部尚書陳于陛、南京禮部尚書沈一貫同時(shí)兼任東閣大學(xué)士，參與機(jī)要事務(wù)。二十四日，王錫爵辭官。六月初二，雷雨交加，西華門遭災(zāi)，詔令修身反省。
秋七月二十日，河套部長(zhǎng)卜失兔進(jìn)犯延綏。當(dāng)月，延綏總兵官麻貴在下馬關(guān)擊敗河套部敵軍。
冬十月十五日，南京兵部右侍郎邢..總督川、貴軍務(wù)，討伐播州宣慰使楊應(yīng)龍。二十三日，詔諭倭使入朝。當(dāng)月，炒花進(jìn)犯遼東，總兵官董一元將其擊敗。這一年，琉球、烏斯藏入朝進(jìn)貢。
萬歷二十三年(1595)春正月癸卯日，朝廷派遣都督僉事李宗城、指揮楊方亨封平秀吉為日本國王。三月二十三日，賜朱之蕃等人為進(jìn)士及第以及其他不同出身。
夏五月二十六日，京師地震，朱翊鈞命令群臣修身反省。
秋九月初九，青海部長(zhǎng)永邵卜進(jìn)犯甘肅，參將達(dá)云將其擊敗。十六日，下詔恢復(fù)建文年號(hào)。
冬十一月初三，湖廣遭災(zāi)，分別予以減免賦稅和賑濟(jì)。十二月初三，大學(xué)士趙志皋等人請(qǐng)求批發(fā)留在宮禁中的奏章，未得答復(fù)。這一年，江北發(fā)生水災(zāi)，淮河水漫河堤，淹沒泗州祖陵。
萬歷二十四年(1596)春二月十一日，麻貴將河套部擊敗。三月初八，乾清、坤寧二宮遭火災(zāi)，朱翊鈞命群臣修身反省。二十五日，下詔自責(zé)。當(dāng)月，火落赤進(jìn)犯洮河，總兵官劉纟廷將其大敗而逃。
夏四月初三，李宗城從倭營跑回王京。五月初二，河套部之?dāng)耻娺M(jìn)犯甘肅，總兵官楊..將其擊敗。初四，再次商議封倭事宜，命都督僉事楊方亨、游擊沈惟敬前往。六月，賑濟(jì)福建饑荒。
秋七月初二，吏部尚書孫丕揚(yáng)請(qǐng)求批發(fā)推舉補(bǔ)缺官員的奏章，未予答復(fù)。十三日，仁圣皇太后駕崩。二十日，開始派遣中官在畿內(nèi)開礦。不久，河南、山東、山西、浙江、陜西之礦皆獲準(zhǔn)開采，以中官統(tǒng)領(lǐng)。群臣屢次進(jìn)諫，皆未聽取。閏八月初一，日食。初三，大學(xué)士趙志皋奏請(qǐng)朱翊鈞臨朝執(zhí)政，批發(fā)章奏，結(jié)束開礦，未予答復(fù)。九月初二，楊方亨到達(dá)日本，平秀吉拒受封號(hào)，再次侵犯朝鮮。二十二日，安葬孝安莊皇后。此月，河套部又侵犯寧夏。總兵官李如柏將其擊敗。當(dāng)年秋天，黃河在黃土固口決堤。
冬十月十三日，中止行刑。二十二日，開始命中官專管通州專賣稅收。此后，各省皆設(shè)稅使。群臣屢諫不聽。十二月十三日，陳于陛死去。
萬歷二十五年(1597)春正月二十六日，朝鮮使者請(qǐng)求救援。二月初五，再次商議討伐倭寇。十五日，原都督同知麻貴擔(dān)任防倭總兵官，統(tǒng)率南北各路兵馬。三月十五日，山東右參政楊鎬擔(dān)任僉都御史，經(jīng)略朝鮮軍務(wù)。三十日，兵部侍郎邢..擔(dān)任尚書，總督薊、遼、保定軍務(wù)，經(jīng)略防倭事宜。
夏六月十九日，皇極、中極、建極三殿發(fā)生火災(zāi)。二十四日，終止編修國史。
秋七月初四，誡諭群臣。初八，詔令大赦天下。當(dāng)月，楊應(yīng)龍反叛，攻占合江、綦江。八月十九日，倭寇攻破朝鮮閑山，于是逼近南原，副總兵楊元棄城逃走，倭兵逼近王京。二十六日，京師地震。九月初四，逮捕原兵部尚書石星，將其投進(jìn)監(jiān)獄，判為死罪。
冬十月十七日，安南黎惟潭篡位自立，并前來請(qǐng)罪，詔令授予其安南都統(tǒng)使。
萬歷二十六年(1598)春正月，官軍攻擊蔚山倭寇，未克，楊鎬、麻貴逃奔王京。三月十八日，賜趙秉忠等人以進(jìn)士及第以及其他不同的出身。二十七日，群臣前往文華門疏請(qǐng)皇長(zhǎng)子成年完婚，未得允許。
夏四月十三日，遼東總兵官李如松出塞，遇伏戰(zhàn)死。十八日，京師大旱，朱翊鈞令群臣修身反省。六月初四，楊鎬被免職。初五，中官李敬在廣東開采珍珠。十三日，張位被免職。二十三日，巡撫天津的僉都御史萬世德經(jīng)略朝鮮。
秋七月初三，中官魯保專賣兩淮的余鹽。八月二十四日，京師地震。九月初十，免除浙江遭災(zāi)地區(qū)的田租。
冬十月初三，總兵官劉纟廷、麻貴分兵攻擊倭寇，將其擊敗。董一元攻擊新寨倭寇，戰(zhàn)敗。十一月十七日，倭兵放棄蔚山逃遁，官軍分兵追擊。十二月，總兵官陳瞞在乙山打敗倭寇，于是朝鮮被平定。這一年，有烏斯藏前來朝貢。
萬歷二十七年(1599)春二月初二，分別派中官統(tǒng)領(lǐng)浙江、福建、廣東市舶司。當(dāng)月，貴州巡撫江東之派兵討伐楊應(yīng)龍。戰(zhàn)敗。三月二十日，原兵部侍郎李化龍總督川、湖、貴州軍務(wù)，討伐楊應(yīng)龍。
夏四月二十五日，朱翊鈞駕臨午門，接受倭寇俘虜。當(dāng)月，臨清百姓叛亂，焚燒稅使馬堂官署，殺其隨從三十四人。閏月初八，詔示天下倭寇被平定，免除加派的東征賦稅。十二日，因久旱不雨而令群臣修身反省。十九日，因各位皇子結(jié)婚而令從太倉取銀二千四百萬兩。戶部匱乏，令從嚴(yán)核實(shí)各地積蓄儲(chǔ)備。六月二十三日，楊應(yīng)龍攻陷綦江，參將房嘉寵、游擊張良賢戰(zhàn)死。
秋八月十八日，陜西狄道縣發(fā)生山崩。九月，土蠻進(jìn)犯錦州。
冬十月初六，賑濟(jì)京城饑民。初十，由于播州用兵，加派四川、湖廣地區(qū)的田賦。十二日，貴州宣慰使安疆臣犯罪，詔令他討伐賊寇以贖罪。十一月初四，免除河南受災(zāi)地區(qū)的田租。二十八日，賑濟(jì)畿輔及鳳陽等地饑荒。十二月初二，武昌、漢陽百姓叛亂，打傷稅使陳奉。十三日，賑濟(jì)京師流民。這一年，琉球前來朝貢。
萬歷二十八年(1600)春二月初四，京師地震。十二日，李化龍率師分八路進(jìn)軍討伐播州。
夏六月初六，攻克海龍囤，楊應(yīng)龍自縊而死，播州平定。
秋七月初十，天大旱，朱翊鈞又令群臣修身反省。八月初一，建成慈慶宮。初六，撤除朝鮮守兵。九月十四日，中止行刑。同年秋天，炒花進(jìn)犯遼東，副總兵解生等人戰(zhàn)敗死去。
冬十月初一，貴州皮林苗叛亂，總兵官陳瞞率兵討伐。初六，云南稅監(jiān)楊榮開采阿瓦、孟密寶井。十二月二十六日，朱翊鈞駕臨午門，察看播州戰(zhàn)俘。
這一年，兩畿各省災(zāi)傷頻繁，民饑盜起，內(nèi)外群臣上奏請(qǐng)求將礦稅監(jiān)官免職，朱翊鈞全不采納。大西洋人利瑪竇進(jìn)獻(xiàn)地方特產(chǎn)。
萬歷二十九年(1601)春正月十三日，詔告天下：由于平定了播州，免除四川、貴州、湖廣、云南加派的田租賦稅，同時(shí)免除官民牽連之罪。當(dāng)月，皮林苗賊被平定。二月初五，賑濟(jì)大同、宣府饑荒。三月十七日，賜封張以誠等人以進(jìn)士及第和其他不同的出身。當(dāng)月，武昌發(fā)生民變，殺掉稅監(jiān)陳奉隨從六人，焚毀巡撫公署。
夏四月十八日，召回陳奉，派守備承天的中官杜茂替代。五月，蘇州民變，殺掉織造中官孫隆隨從數(shù)人。六月，京師已一年未降雨，直到當(dāng)月初九才開始下雨。山東、山西、河南普遍大旱。二十二日，法官奏請(qǐng)熱審，朱翊鈞未予答復(fù)。這年夏天，賑濟(jì)畿內(nèi)饑荒。
秋九月初八，黃河在開封、歸德決堤。十三日，趙志皋死去。十九日，賑濟(jì)貴州饑荒。二十四日，原禮部尚書沈鯉、朱賡同時(shí)兼任東閣大學(xué)士，參與機(jī)要事務(wù)。
冬十月十五日，冊(cè)立皇長(zhǎng)子朱常洛為皇太子，冊(cè)封其他各位皇子常洵為福王、常浩為瑞王、常潤為惠王、常瀛為桂王。并下詔大赦天下。二十八日，加上慈圣皇太后尊號(hào)。十二月初八，詔令恢復(fù)朵顏馬市。
萬歷三十年(1602)春正月二十六日，以四方災(zāi)害頻繁為由令群臣修身反省。二月十六日，朱翊鈞身體不適，召大學(xué)士沈一貫至啟祥宮，詔諭免除礦稅，停止織造，釋放囚犯，恢復(fù)進(jìn)諫的各位大臣職務(wù)。次日，病愈，擱置前詔。二十一日，重建乾清、坤寧二宮。閏月初三，恢復(fù)河套各部貢市。十五日，河州黃河干涸。三月二十二日，騰越民變，殺掉稅監(jiān)所委派的官員。
夏四月初十，賑濟(jì)順天、永平饑荒。五月十四日，法官奏請(qǐng)熱審，未允許。
秋七月二十二日，邊餉匱乏，命從嚴(yán)從快催交拖欠賦稅。當(dāng)月，緬賊攻陷蠻莫宣撫司，宣撫司思正跑回騰越，賊兵追至，官吏殺掉思正進(jìn)獻(xiàn)賊兵，才得解圍。
冬十月初十，賑濟(jì)江北災(zāi)害。二十八日，中止行刑。這一年有琉球、哈密前來朝貢。
萬歷三十一年(1603)春三月初二，吏部奏告天下郡守闕員，沒作答復(fù)。當(dāng)月，播州余賊吳洪等人作亂，有關(guān)官吏討伐并予以平定。
夏四月初一，日食。五月初一，閣臣奏請(qǐng)熱審，未予回復(fù)。二十三日，京師地震。鳳陽天降大雨和冰雹，砸毀皇陵殿脊梁。當(dāng)年夏天，黃河在蘇家莊決堤，淹沒江北豐、沛、魚臺(tái)、單縣。
秋九月十一日，江北發(fā)生盜賊。
冬十月初二，中止行刑。十四日，睢州賊楊思敬作亂，被有司討伐擒獲。十一月十二日，得到一本妖書，傳說皇帝要改立太子，詔令到處嚴(yán)加搜索。十二月初五，朱翊鈞召見皇太子于啟祥宮，賜給皇太子手令給予安慰。
萬歷三十二年(1604)春二月二十一日，閣臣奏請(qǐng)補(bǔ)充司、道、郡、守及派遣巡視各地的御史，未予答復(fù)。三月十四日，建成乾清宮。十五日，賜封楊守勤等人以進(jìn)士及第和其他不同的出身。
夏四月初一，日食。當(dāng)月，完成疏通氵加河的工程。五月二十三日，雷火焚燒了長(zhǎng)陵明樓。六月初七，以長(zhǎng)陵發(fā)生災(zāi)害為由，命補(bǔ)闕官撫恤帶刑在獄囚犯。二十日，昌平發(fā)生水災(zāi)，毀壞長(zhǎng)、泰、康、昭四陵石梁。
秋七月初一，京師大雨，毀壞一些城墻。十二日，賑濟(jì)遭受水災(zāi)之居民。八月二十三日，群臣跪伏文華門，上疏請(qǐng)求提倡修舉實(shí)政，降旨督促。二十八日，完成黃河分水工程。九月初一，賑濟(jì)畿南六府饑荒。閏月二十四日，武昌宗人蘊(yùn)軫等人作亂，殺掉巡撫都御史趙可懷。
冬十月初八，開始對(duì)平定播州的官兵論功。這一年有琉球、烏斯藏前來朝貢。
萬歷三十三年(1605)春正月，重新修復(fù)京師外城。初五，銀定、歹成進(jìn)犯鎮(zhèn)番，總兵官達(dá)云將其擊敗。
夏四月初七，蘊(yùn)軫等被殺。五月二十四日，鳳陽遭受大風(fēng)大雨，毀壞陵殿神座。二十八日，雷擊圜丘望燈高桿。六月初二，以雷擊為由令群臣修身反省。
秋八月二十八日，中止行刑。九月二十四日，昭和殿發(fā)生火災(zāi)。二十六日，京師地震。
冬十一月十一日，免除淮陽遭災(zāi)地區(qū)的田租。十二月初二，詔令天下各地停止開礦。又將稅務(wù)事宜交還有司，將每年收入的一半交至內(nèi)府，另一半交至戶、工二部。初六，免去河南遭災(zāi)地區(qū)的田租。十五日，以皇長(zhǎng)孫出生為由而詔令大赦天下。開宗室科舉入仕之先例。停止開采廣東珠池和云南寶井。
萬歷三十四年(1606)春二月十一日，加上皇太后徽號(hào)。十二日，大學(xué)士沈鯉、朱賡奏請(qǐng)皇帝補(bǔ)齊六部主要官員，未得到答復(fù)。三月十一日，云南百姓殺死稅監(jiān)楊榮，焚燒其尸體。三十日，真定、順德、廣平、大名等地遭災(zāi)，朝廷分別給予減免賦稅和賑濟(jì)。
夏四月二十五日，完成朱旺口黃河疏通工程。五月初六，河套部進(jìn)犯延綏，官軍將其擊潰。六月初六，緬甸攻陷木邦。同月，畿內(nèi)蝗災(zāi)大起。
秋七月十六日，沈一貫、沈鯉辭官。九月二十九日，朱翊鈞要陜西邊防嚴(yán)加防患。
冬十月初一，中止行刑。十一月初四，朵顏來犯，總兵官姜顯謨領(lǐng)兵將敵擊退。十二月十八日，南京妖賊劉天緒謀反，事情敗露伏誅。這一年，有安南、琉球前來朝貢。蒙古喀爾喀各部歸順大清。
萬歷三十五年(1607)春正月初七，給事中翁憲祥進(jìn)言：撫、按官員解任后應(yīng)該隨時(shí)候命，不應(yīng)聽其自流。未得到批復(fù)。二月初五，安南賊人武德成進(jìn)犯云南，總兵官沐睿又將敵擊退。三月十八日，賜封黃士俊等人為進(jìn)士及第以及其他不同的出身。
夏四月初六，銀定、歹成進(jìn)犯涼州，副總兵柴國柱將其擊退。二十日，順義王扌奢力克死去。五月二十七日，原禮部尚書于慎行及禮部侍郎李廷機(jī)、南京吏部侍郎葉向高一同擔(dān)任禮部尚書兼任東閣大學(xué)士，參與機(jī)要事務(wù)。六月，湖廣及徽、寧、太平、嚴(yán)州發(fā)生水災(zāi)。閏月二十日，恢復(fù)河套各部的貢市。
秋七月初十，京師連年陰雨。刑部奏請(qǐng)皇帝批發(fā)關(guān)于熱審的奏章，未予答復(fù)。八月初六，賑濟(jì)畿內(nèi)饑荒。九月初四，中止行刑。
冬十月十四日，山東大旱，饑荒嚴(yán)重，朝廷分別給予賑濟(jì)。十一月二十五日，于慎行死去。十二月，金沙江蠻阿克反叛，攻陷武定，圍攻云南，攻占嵩明、祿豐。安南賊兵進(jìn)犯欽州。這一年，琉球前來朝貢。
萬歷三十六年(1608)春正月，河南、江北發(fā)生饑荒。二月十一日，京師地震。
夏六月二十五日，南畿發(fā)生大水。
秋七月十三日，京師地震。郴州礦賊大起。八月初九，懲治云南失事有罪之臣，巡撫都御史陳用賓、總兵官沐睿又被逮捕入獄，論為死罪。二十七日，賑南畿和嘉興、湖州饑荒。九月初十，四川巡撫都御史喬璧星在東川擒獲阿克，賊寇被平定。
冬十一月三十日，朱賡死去。十二月初五，再次賑濟(jì)南畿，免除其稅糧。這一年，有琉球前來朝貢。
萬歷三十七年(1609)春三月初十，拱兔攻陷大勝堡，游擊于守志在小凌河被戰(zhàn)敗。二十九日，大學(xué)士葉向高奏請(qǐng)皇帝公布群臣互相攻擊的奏文，以論斷是非、整肅人心，未予答復(fù)。
夏四月，倭賊侵犯溫州。
秋九月二十五日，左都御史詹沂封印私自離去。二十九日，中止行刑。當(dāng)年秋季，福建、浙江、江西發(fā)生大水災(zāi)。湖廣、四川、河南、陜西、山西大旱，畿內(nèi)、山東、徐州大鬧蝗災(zāi)。
冬十二月二十二日，朝廷將畿內(nèi)、山東諸省所收稅收的三分之一用作賑濟(jì)饑民費(fèi)用。這一年，日本侵入琉球，抓住其國王尚寧。哈密入朝進(jìn)貢。
萬歷三十八年(1610)春三月十七日，賜封韓敬等人為進(jìn)士及第以及其他不同的出身。
夏四月初二，正陽門樓遭火災(zāi)。十六日，以旱災(zāi)異常為由，要群臣完成自己份內(nèi)職責(zé)，不準(zhǔn)互相攻擊。二十六日，賑濟(jì)畿內(nèi)、山東、山西、河南、陜西、福建、四川饑民。五月，河南賊人陳自管等人作亂，被官吏擒獲。
冬十月辛丑日，中止行刑。十一月初一，有日食。二十七日，以缺乏軍餉為由，要廷臣陳述充倉足庫之策，而且不得從宮內(nèi)撥出金帛。這一年，烏斯藏入朝進(jìn)貢。
萬歷三十九年(1611)春二月庚子日，河套部敵軍進(jìn)犯甘州的紅崖、青湖，被官軍擊退。
夏四月，京師大旱。十九日，怡神殿發(fā)生火災(zāi)。二十七日，設(shè)置邊鎮(zhèn)常平倉。五月初三，御史徐兆魁上奏皇帝，指責(zé)東林講學(xué)諸人暗中支持制定不同的禮典、制度，致使諸臣互相攻擊。廣西、廣東發(fā)生大水災(zāi)。六月，從徐州到北京普遍發(fā)生大水災(zāi)。當(dāng)年夏天，停止熱審。
冬十月初一，戶部尚書趙世卿上書離去。十八日，中止行刑。內(nèi)閣大臣請(qǐng)求釋放輕罪犯人，未予答復(fù)。這一年，暹羅前來朝貢。
萬歷四十年(1612)春二月十九日，吏部尚書孫丕揚(yáng)上書自去官職回鄉(xiāng)。三月十二日，賑濟(jì)京師流民。
夏四月初二，南京各道御史進(jìn)言：“官衙空缺，各方面事務(wù)廢墮，皇上深居宮中二十余年，未接見過大臣，天下將有失去的危險(xiǎn)?！比匀晃从璐饛?fù)。五月初一，日食。
秋八月，黃河在徐州決口。九月十九日，李廷機(jī)自動(dòng)離職。
冬十月二十四日，中止行刑。這一年，琉球中山王尚寧派人奏請(qǐng)歸附。
萬歷四十一年(1613)春正月初二，詔諭朝鮮練兵以防止倭寇。三月十五日，賜封周延儒等人為進(jìn)士及第以及其他不同出身。
夏五月十二日，朱翊鈞詔諭吏部都察院“：幾年來議論紛紛，混淆視聽，朝廷寬容不予追查，致使攻擊誣陷愈來愈甚，朝廷大臣猶疑畏懼，都想辭官回鄉(xiāng)，嚴(yán)重?fù)p害了國體。自今以后，仍有結(jié)黨亂政者，定罪絕不饒恕?！绷鲁醢?，卜失兔世襲順義王封號(hào)。
秋七月初八，兵部尚書掌管都察院事務(wù)的孫瑋辭職回鄉(xiāng)。九月十七日，吏部左侍郎方從哲、原吏部左侍郎吳道南和禮部尚書兼任東閣大學(xué)士，參與機(jī)要事務(wù)。二十五日，吏部尚書趙煥自動(dòng)離職。當(dāng)年，兩畿、山東、江西、河南、廣西、湖廣、遼東發(fā)生水災(zāi)。烏斯藏前來朝貢。
萬歷四十二年(1614)春正月十二日，總兵官劉纟廷率兵討伐建昌叛蠻，將其平定。二月初九，慈圣皇太后駕崩。二十七日，賑濟(jì)畿內(nèi)饑荒。三月二十四日，福王來到都城。
夏四月初四，以皇太后遺命為由大赦天下。六月十三日，安葬孝定皇后。
秋八月十四日，禮部右侍郎孫慎行上疏自動(dòng)去職。二十三日，葉向高辭官。這一年有安南、土魯番前來朝貢。
萬歷四十三年(1615)春正月十八日，完成了徐州黃河決口的筑堤工程。三月初一，有日食。
夏五月初四，薊州一男子張差手持木棒闖入慈慶宮，打傷守門的侍衛(wèi)，被抓進(jìn)監(jiān)獄。十二日，刑部提牢主事王之肕弄清其情況，這就是后來所說的木廷擊案。二十五日，對(duì)皇城門禁嚴(yán)加戒備。二十九日，在慈慶宮召見廷臣。御史劉光復(fù)被抓進(jìn)監(jiān)獄。三十日，張差伏誅。六月初三，由于久旱不雨，朱翊鈞命群臣修身反省。
秋七月初四，賑濟(jì)畿內(nèi)饑荒。二十九日，中止行刑。閏八月初六，重建三殿。十三日，山東大旱，朱翊鈞下詔將稅銀留下進(jìn)行賑濟(jì)。二十三日，河套諸部進(jìn)犯延綏，官軍戰(zhàn)敗，副將孫弘謨被抓獲。
冬十月十八日，京師地震。十一月初六，賑濟(jì)京師饑民。
萬歷四十四年(1616)春三月初一，有日食。十五日，賜封錢士升等人進(jìn)士及第以及其他不同出身。當(dāng)年春天，畿內(nèi)、山東、河南、淮、徐發(fā)生大饑荒，朝廷分別給以賑濟(jì)和減免田賦。
夏四月十九日，河南出現(xiàn)盜賊，朝廷命官吏進(jìn)行安撫和圍剿。六月初三，河套各部落進(jìn)犯延綏，總兵官杜文煥將其擊退。二十九日，黃河在祥符朱家口決堤，淹沒陳、杞、睢、柘各州縣。
秋七月二十八日，河套部落首領(lǐng)吉能率兵進(jìn)犯高家堡，參將王國興戰(zhàn)敗。當(dāng)月，陜西大旱，江西、廣東發(fā)生水災(zāi)，河南、淮、揚(yáng)、常、鎮(zhèn)大鬧蝗災(zāi)，山東盜賊大起。
冬十月初十，中止行刑。十一月初二，隆德殿發(fā)生火災(zāi)。
萬歷四十五年(1617)春二月二十三日，由于前一年冬季無雪，入春以后又沒有下雨，朱翊鈞要群臣修身反省。三月初六，鎮(zhèn)撫司缺乏官吏，獄中很多囚犯因關(guān)押太久而死亡，大學(xué)士方從哲據(jù)此上奏，未得到答復(fù)。初十，賑濟(jì)江西饑荒。
夏五月十三日，久旱不雨，朱翊鈞又命群臣修身反省。六月初三，畿南大鬧饑荒，當(dāng)?shù)毓倮粽?qǐng)求賑濟(jì)，未得到及時(shí)答復(fù)。當(dāng)月，閣臣法官奏請(qǐng)熱審，未得答復(fù)。
秋七月初一，日食。初五，吳道南因丁服父母喪事離職。這一年，兩畿、河南、山東、山西、陜西、江西、湖廣、福建、廣東遭災(zāi)。暹羅、烏斯藏曾來朝進(jìn)貢。
萬歷四十六年(1618)春二月十五日，賑濟(jì)廣東饑荒。
夏四月十五日，大清軍隊(duì)攻克撫順，千總王命印戰(zhàn)死。二十日，總兵官張承胤領(lǐng)兵救援撫順，也全軍覆沒。閏月初二，楊鎬擔(dān)任兵部左侍郎兼右僉都御史，經(jīng)略遼東。六月二十六日，京師地震。這年夏天，官吏奏請(qǐng)熱審，未得到答復(fù)。
秋七月二十日，大清軍隊(duì)攻占清河堡，守將鄒儲(chǔ)賢、張旆戰(zhàn)死。八月十六日，朝廷將軍餉海運(yùn)到遼東。二十四日，乃蠻等七部落請(qǐng)求與朝廷相通。二十五日中止行刑。九月初七，守遼軍隊(duì)缺乏糧餉，有關(guān)官員奏請(qǐng)撥用各省稅銀，未得到及時(shí)答復(fù)。二十六日，加派天下田賦。三十日，京師發(fā)生地震。
冬十一月初九，因?yàn)?zāi)異頻繁而令群臣修身反省。十二月初二，河套部落首領(lǐng)猛克什力前來投降。這一年有土魯番、天方、撒馬兒罕、魯迷、哈密、烏斯藏前來朝貢。
萬歷四十七年(1619)春二月十一日，經(jīng)略楊鎬在遼陽誓師，總兵官李如柏、杜松、劉纟廷、馬林分道出塞。三月初一，杜松在吉林崖遭遇大清軍隊(duì)，戰(zhàn)死。初二，馬林在飛芬山戰(zhàn)敗，兵備僉事潘宗顏戰(zhàn)死。初七，劉纟廷率軍深入阿布達(dá)里岡，戰(zhàn)死。十八日，賜莊際昌等人為進(jìn)士及第以及其他不同出身。
夏四月二十日，盔甲廠發(fā)生火災(zāi)。六月十六日，大清軍隊(duì)攻克開原，馬林全軍覆沒。二十二日，大理寺丞熊廷弼擔(dān)任兵部右侍郎兼右僉都御史，經(jīng)略遼東。二十三日，朝廷大臣聚于文華門，奏請(qǐng)皇帝批復(fù)奏章以及增派援軍和分發(fā)糧餉，未得到答復(fù)。
秋八月初五，山東蝗災(zāi)。十三日，逮捕楊鎬。九月初一，中止行刑。初九，百官跪伏于宮殿階下，奏請(qǐng)朱翊鈞上朝處理政事，未得到答復(fù)。
冬十月初八，賑濟(jì)京師饑民。十二月，又加派全國田租賦稅。二十二日，鎮(zhèn)江、寬奠、云爰陽新募援兵被擊潰。這一年有暹羅前來朝貢。
萬歷四十八年(1620)春正月二十一日，朝鮮請(qǐng)求救援。三月十二日，再次加派全國田租賦稅。
夏四月初六，皇后王氏死去。十一日，朱翊鈞病發(fā)，在弘德殿召見方從哲。
秋七月十七日，朱翊鈞病情加重，在弘德殿召見英國公張惟賢，大學(xué)士方從哲，尚書周嘉謨、李汝華、黃嘉善、張問達(dá)、黃克纘，侍郎孫如游，勉勵(lì)各位大臣勤政敬職。二十一日，死去，時(shí)年五十八歲。遺詔停止一切榷稅和新增織造等。九月初十，追加尊敬謚號(hào)，廟號(hào)神宗，安葬于定陵。
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