順治三年(1646)八月，清朝大軍攻取汀州，逮捕唐王朱聿鍵。于是兩廣總督丁魁楚、廣西巡撫瞿式耜、巡按王化澄與舊臣呂大器等共推朱由榔為監(jiān)國(guó)。其母妃王氏推辭道：“我兒不能勝任，你們還是另選能承擔(dān)此任的人吧?！倍】葢B(tài)度更加堅(jiān)決，便合謀將朱由榔迎于梧州。十月十四日，朱由榔在肇慶稱監(jiān)國(guó)，授丁魁楚、呂大器、瞿式耜為大學(xué)士，并分別授予其他人官職。這一月，大軍攻取贛州，內(nèi)侍王坤倉(cāng)促之間尊奉朱由榔逃往梧州，瞿式耜等盡力相爭(zhēng)，才回到肇慶。十一月，唐王之弟朱聿钅粵自閩經(jīng)海路到粵。當(dāng)時(shí)閩舊臣蘇觀生撤兵奔往廣州，與布政使顧元鏡、總兵官林察等謀立朱聿钅粵，偽號(hào)紹武，與朱由榔相抗衡。這一月朱由榔也自立于肇慶，偽號(hào)永歷，并派遣兵部侍郎林佳鼎前去討伐朱聿钅粵。恰逢大軍由福建出發(fā)攻取廣州，逮捕朱聿钅粵，蘇觀生自縊而死，祭酒梁朝鐘、太仆卿霍子衡等全部死去，肇慶大為震驚，王坤又尊奉朱由榔逃至梧州。

　　第二年二月，朱由榔由平樂、潯州逃往桂林。丁魁楚拋棄朱由榔，逃往岑溪，投降大軍。不久，平樂失守，朱由榔十分恐慌。正逢武岡總兵官劉承胤率軍到達(dá)全州，王坤請(qǐng)求奔赴全州。瞿式耜極力勸諫，朱由榔不予采納。于是朱由榔命瞿式耜及總兵焦璉留守桂林，封陳邦傳為思恩侯，駐昭平，然后自己則投靠劉承胤軍中。三月，朱由榔封劉承胤為安國(guó)公，錦衣衛(wèi)指揮馬吉翔等為伯。劉承胤挾持朱由榔返回武岡，改名奉天府，政事均由他決定。

　　這時(shí)，長(zhǎng)沙、衡、永均已失守，湖廣總督何騰蛟與侍郎嚴(yán)起恒逃往白牙市。六月，朱由榔派遣官員前去將何騰蛟召來，暗中命他除掉劉承胤，但因劉承胤勢(shì)力很大，何騰蛟重返白牙市。大軍由寶慶直趨武岡，馬吉翔等挾持朱由榔逃往靖州，劉承胤則舉城投降。朱由榔又逃奔柳州，經(jīng)過古泥，總兵官侯性、太監(jiān)龐天壽率水師前來迎接。當(dāng)時(shí)正逢天雨、饑餓，而侯性對(duì)食宿準(zhǔn)備十分充分。九月，土舍覃鳴珂作亂，在城中大肆搶掠，弓箭射到朱由榔的船上。在此之前，大軍直趨桂林，焦璉拼力拒守，廣州又出現(xiàn)緊急情況，大軍往東而去，桂林才稍微安定下來。不久，湖南十三鎮(zhèn)將郝永忠、盧鼎等都奔赴桂林，何騰蛟也到達(dá)，與瞿式耜商議給諸將劃分地域，讓他們各自防守。當(dāng)時(shí)焦璉已收復(fù)陽(yáng)朔、平樂，陳邦傳收復(fù)潯州，然后合兵收復(fù)梧州，廣西全省略定。十二月，朱由榔返回桂林。

　　五年二月，大軍到達(dá)靈川，郝永忠在興安潰敗，逃回桂林，挾持朱由榔逃往柳州。大軍進(jìn)攻桂林，瞿式耜、何騰蛟拼力抵抗。當(dāng)時(shí)南昌金聲桓等反叛，投降朱由榔。八月，朱由榔到達(dá)肇慶。六年春，大軍攻下湘潭，何騰蛟死難。第二年，朱由榔逃至梧州。這年十二月，大軍進(jìn)入桂林，瞿式耜及總督張同敞死難。朱由榔獲悉，十分害怕，從梧州逃奔南寧。當(dāng)時(shí)孫可望已占據(jù)滇、黔，受封為秦王。八年三月，孫可望派兵前去保衛(wèi)，殺死嚴(yán)起恒等人。

　　九年二月，孫可望將朱由榔迎入安隆所，改為安龍府。隨著時(shí)間的推移，朱由榔感到日益困窘緊迫，他獲悉李定國(guó)與孫可望之間有隔閡，便派使者密召李定國(guó)，率軍來迎。馬吉翔是孫可望的黨羽，偵探得知此事，大學(xué)士吳貞毓以下十余人均被處死。此事詳見《吳貞毓傳》。二年后，李定國(guó)在新會(huì)戰(zhàn)敗，將要由安陸進(jìn)入滇。孫可望十分擔(dān)心，催促朱由榔移往貴陽(yáng)靠近自己。朱由榔卻故意延遲動(dòng)身。李定國(guó)到后，于是尊奉朱由榔由安南衛(wèi)奔往云南，住在孫可望的官署中，朱由榔封李定國(guó)為晉王。孫可望因?yàn)槠迌哼€留在滇，未敢有所行動(dòng)。第二年，朱由榔將其妻兒送回黔，孫可望于是與李定國(guó)戰(zhàn)于三岔。孫可望的部將白文選獨(dú)自騎馬投奔李定國(guó)軍。孫可望戰(zhàn)敗，攜妻帶兒奔赴長(zhǎng)沙投降了大軍。

　　十五年三月，大軍兵分三路進(jìn)入云南。李定國(guó)扼守雞公背，截?cái)噘F州通道，其他將領(lǐng)防守七星關(guān)，在生界立營(yíng)扎寨，牽制蜀軍。大軍兵出遵義，由水西攻取烏撒，守將棄關(guān)而逃，李定國(guó)連敗于安陸，朱由榔逃往永昌。第二年正月三日，大軍進(jìn)入云南，朱由榔逃往騰越。李定國(guó)敗于潞江，又逃至南甸。二十六日，抵達(dá)囊木河，此地屬于緬甸境內(nèi)。緬甸人勒令隨從官員舍棄所有兵器，才開關(guān)放人，朱由榔一行到達(dá)蠻莫。二月，緬甸人派出四船前來迎接，隨從官員自己找船，隨行者六百四十余人，由陸路行走的有已故岷王之子以下九百余人，約定在緬甸會(huì)合。十八日到達(dá)井亙。黔國(guó)公沐天波等企圖尊奉朱由榔逃往戶、獵二河，沒能成功。五月四日，緬甸人又派船前來迎接。第二天，從井亙出發(fā)，行走三日，到達(dá)阿瓦。阿瓦是緬甸酋長(zhǎng)所居之城。又過了五日，到達(dá)赭..。而走陸路的人全被緬甸人掠去為奴，這些人大多自殺。唯有岷王之子等八十余人流入暹羅。緬甸人在赭..建造一草屋讓朱由榔居住，并派兵予以防范。

　　十七年，李定國(guó)、白文選與緬甸人交戰(zhàn)，索要其主，連敗緬兵，緬甸始終不肯交出朱由榔。十八年五月，緬甸酋長(zhǎng)之弟莽猛白代立為酋，哄騙朱由榔的隨從官員渡河來訂立盟約。他們到達(dá)之后，緬人卻出兵圍攻，殺死沐天波、馬吉翔、王維恭、魏豹等四十二人，詳情見《任國(guó)璽傳》。僅朱由榔與其官屬二十五人幸存。十二月，大軍兵臨緬境，白文選自木邦投降，李定國(guó)逃往景線，緬人將朱由榔父子送至軍前。第二年四月，朱由榔死于云南。六月，李定國(guó)死，其子李嗣興等投降。