孫應(yīng)奎，字文宿，洛陽人。正德十六年(1521)中進(jìn)士。授官章丘知縣。

　　嘉靖四年(1525)孫應(yīng)奎被調(diào)進(jìn)朝廷任兵科給事中，上疏奏言說：“只有忠厚剛直、純潔堅(jiān)定的人才能擔(dān)當(dāng)輔臣之大任。今朝大學(xué)士楊一清雖然練達(dá)國體，但向來善于變通，難以獨(dú)挑此擔(dān)。張璁學(xué)識淵博但性情偏激，缺點(diǎn)在于自以為是，特別看重功名，對他應(yīng)當(dāng)抑制其缺點(diǎn)而用之。至于桂萼，他以梟雄桀驁的資質(zhì)，作威作福，私納財(cái)賄，阻攔壓抑氣節(jié)之士，結(jié)黨營私，勢侵六官，盛氣壓制言路，天下莫不怨憤。請求皇帝鑒別三臣的賢與不賢，以決定用與不用?！彼囊鈭D是特別袒護(hù)張璁。皇帝根據(jù)他的奏言，好言挽留楊一清，告誡曉諭張璁、桂萼。既而孫應(yīng)奎與同僚王準(zhǔn)、陸燦彈劾張璁、桂萼，張、桂被罷相職，王準(zhǔn)、陸燦也被貶謫到邊遠(yuǎn)地區(qū)，因?qū)O應(yīng)奎是首次抗言而沒有問他的罪。不久，孫應(yīng)奎又彈劾吏部尚書方獻(xiàn)夫，皇帝很聽信孫應(yīng)奎的話。方獻(xiàn)夫得到汪钅宏的援助，才使得孫應(yīng)奎的提議被駁下。孫應(yīng)奎再遷為戶科左給事中。行人薛侃的建言與圣旨相忤，被下廷審訊，供詞牽連到張璁。孫應(yīng)奎和同官曹汴請讓張璁回避，并且上疏陳述情況?；实鄞笈?，將孫應(yīng)奎下詔獄，不久又釋放復(fù)職。

　　十一年(1532)考核天下百官，王準(zhǔn)被貶為富民典史。孫應(yīng)奎勸說汪钅宏為張璁、桂萼調(diào)和，誣王準(zhǔn)辦事不謹(jǐn)，因而王準(zhǔn)被罷黜。孫應(yīng)奎請求恢復(fù)王準(zhǔn)的官職，責(zé)罰汪钅宏，讓勾結(jié)同黨的人引以為戒。吏部尚書王瓊也說王準(zhǔn)應(yīng)當(dāng)被廢貶，于是孫應(yīng)奎被貶為高平縣丞。幾次職務(wù)更動后為湖廣副使，監(jiān)督采伐皇家用木，因?yàn)槭軤坷塾直淮毒星?。不久釋放回原處。歷任右副都御史，巡撫順天。后被召回掌理都察院事，遷戶部侍郎，升為尚書。

　　自俺答侵犯京師后，軍書交錯征收兵餉。于是孫應(yīng)奎建議加派征收。除北方諸府及廣西、貴州外，其他地方根據(jù)土地貧富，驟然增征銀兩一百五十萬兩有余，而蘇州一府就征收八萬五千。御史郭仁是吳地人，到孫應(yīng)奎處請求減征，孫應(yīng)奎沒有聽從。郭仁于是上奏章彈劾孫應(yīng)奎，孫應(yīng)奎上疏為自己辯護(hù)?；实壅J(rèn)為郭仁不應(yīng)當(dāng)私自委托，便將他調(diào)出朝廷。既而國家資產(chǎn)不足以開支，孫應(yīng)奎說“：今年收入兩百萬，而諸邊費(fèi)用需要六百余萬，一切取財(cái)?shù)霓k法都已用盡。請皇上下令諸曹所隸屬的官吏、儒士、廚役、校卒，都應(yīng)除去其冗余人員。而戶部支出、收入、盈余減省的數(shù)目，也綜合其大綱，列出簿籍進(jìn)上，使各職司部門府都知為國家珍惜財(cái)產(chǎn)。”得到皇上批準(zhǔn)。

　　三十一年(1552)正月，皇上命令孫應(yīng)奎逐條列上京都與邊關(guān)備用糧草的數(shù)目。孫應(yīng)奎說：“自我進(jìn)入京都到現(xiàn)在，收入合計(jì)除正稅、加賦、余鹽五百余萬兩銀子外，其他地方搜括的又有四百余萬兩。支出方面，除諸邊年例二百八十萬兩外，新增加二百四十五萬兩有余，修整邊關(guān)振興經(jīng)濟(jì)又要用八百余萬兩?！被噬弦?yàn)楹馁M(fèi)這樣多，懷疑有侵犯假冒，分別派遣科道官前往諸邊關(guān)核實(shí)。給事中徐公遴指控孫應(yīng)奎工作草率而又自以為是，于是將孫應(yīng)奎改派為南京工部尚書，以方鈍代孫應(yīng)奎之職。諸邊餉銀越發(fā)增多。方鈍想不出什么妙計(jì)，請求皇上命諸臣逐條列上理財(cái)?shù)挠?jì)策。議定執(zhí)行二十九事，愈發(fā)吝嗇得有傷大體。孫應(yīng)奎又調(diào)到戶部，辭職后歸還故里，死去。

　　孫應(yīng)奎作為諫官，多次觸犯權(quán)貴，他以高風(fēng)亮節(jié)來勉勵自己。晚年為戶部主管會計(jì)官員，一切為茍且求安打算，名聲大不如前。