強盛的尼子家內(nèi)部也包含著隱憂，那就是“新宮黨”的強勢。

尼子經(jīng)久有三子，長子政久死于軍中，三子塩冶興久因為謀反而死，剩下的只有次子國久。尼子經(jīng)久死后，尼子晴久一直由叔父國久輔佐。尼子國久的府邸位于月山富田城北麓的新宮谷，“新宮黨”因此而得名。新宮黨的成員還包括在吉田郡山城死去的尼子久幸、國久的嫡子尼子誠久、嫡孫尼子氏久、孫子尼子勝久等一大批尼子家族成員。值得一提的是：在塩冶興久死后，尼子國久就接收了他的領地，新宮黨的直轄地甚至超過了尼子家的家督。新宮黨不但是一支尼子家內(nèi)部的宗族軍事集團，還是一支地方豪族實力派，他們個個趾高氣揚，不可一世。尼子國久也自恃武勇，絲毫不把侄子晴久放在眼里。

因此，新宮黨的存在對家督尼子晴久來說是一個嚴重的威脅，不過，在和大內(nèi)家爭奪的戰(zhàn)爭中，他還需要依靠新宮黨的那群家族人才為他開疆辟土。當尼子家略有小成以后，尼子晴久為了收回權力，就必須拿新宮黨開刀了。

天文二十三年（1554），尼子晴久進行了一次“大清洗”，時為新宮黨的黨首尼子國久被殺，享年63歲，其黨羽誠久、敬久、吉久等一律成為犧牲品。尼子勝久和氏久被迫出奔。新宮黨勢力的肅清使尼子家的領主直轄地大大擴展。毛利家的軍記顯示：這次清洗是毛利元就的反間之計，現(xiàn)在看來恐怕是毛利家的記錄為顯示其家督的功績而夸大其詞。事實上，新宮黨的存在已經(jīng)使尼子晴久時刻感到鋒芒在背，大有不除不快之想法。所以，這一次的清洗恐怕更多的是因為尼子晴久為了整肅領地、收回權力。此后，尼子家就可以直接控制出云的砂鐵產(chǎn)地，也可以介入出云最大的經(jīng)濟來源--塩冶的水運行業(yè)，對于尼子家的經(jīng)濟而言是一大利好消息。

不過清洗新宮黨也直接削弱了尼子家的實力。新宮黨原本是尼子家攻城略地的主要力量，現(xiàn)在失去了這一主要力量也意味著自殘肢體。弘治三年（1557），大內(nèi)家滅亡，大內(nèi)的領地大部分落入毛利元就手中，與尼子家有宿怨的毛利元就很快就調(diào)過頭來攻打尼子家。雙方首先爭奪的焦點在石見國。石見國有一座著名的石見銀山，石見銀山是戰(zhàn)國時代至江戶幕府前期最大的銀礦山。天文二年（1533），隨著從海外引進鍛冶銀的灰吹法，石見銀山的生產(chǎn)效率有了進一步提高，可以說，石見銀山是中國地區(qū)的一大財源，當初大內(nèi)氏和尼子氏也在這一地區(qū)反復爭奪。弘治二年（1556），尼子家趁大內(nèi)氏走向滅亡之機，出兵占領了石見銀山，并任命本城常光為把守石見銀山的山吹城主。毛利元就當然也意識到了這個銀山戰(zhàn)略地位十分重要，永祿二年（1559），毛利元就出兵攻打山吹城，但是卻被城將本城常光挫敗，未能成功。

永祿三年（1560），尼子晴久因急病在月山富田死亡，尼子家的政治生命也進入了尾聲。

尼子晴久死于尼子與毛利爭奪的敏感時刻，于是家臣秘不發(fā)喪，將他秘密安葬在月山富田城中，同時立尼子義久為家督。但是，尼子家內(nèi)部的變故仍然為毛利元就所得知。永祿五年（1562），毛利元就成功策反了山吹城主本城常光，獲得了石見銀山的支配權，接著就攻克了石見和出云邊境的刺賀巖山城，出云國的防線被突破。

圍繞月山富田城，尼子家構筑了一道被稱為“尼子十旗”的防御線，由白鹿、神西、高瀨、大西、三刀屋、熊野、牛尾、三沢、馬木、赤穴十座支城組成。城主為當?shù)氐暮雷?。出云邊境被突破導致出云西部將直接面臨毛利的侵犯。永祿六年（1563），白鹿、熊野兩城相繼陷落。永祿七年（1564），隨著伯耆國江美城的陷落，尼子家糧道已斷。第二年，毛利元就的軍隊已經(jīng)打到了月山富田城下，城中缺糧，士氣漸漸低落。而此時，尼子義久又中了毛利元就的離間之計，他聽信大與三衛(wèi)門的讒言，殺死了重臣宇山久兼，這一冤案導致家臣更為失望，于是，尼子家陷入了大崩盤的境地。永祿九年（1567）十一月，尼子義久開城投降，被送往安藝幽禁，尼子家滅亡。