中華民國成立后，京師大學(xué)堂改稱北京大學(xué)，但離開現(xiàn)代化的大學(xué)標(biāo)準(zhǔn)，差得很遠。據(jù)蔡元培先生晚年回顧：北京大學(xué)的名稱，是從民國元年起的；民元以前，名為京師大學(xué)堂，包有師范館、仕學(xué)館等。尤其北京大學(xué)的學(xué)生，是從京師大學(xué)堂“老爺式”學(xué)生嬗繼下來。初辦時學(xué)生稱為老爺，而監(jiān)督及教員都被稱為中堂或大人。他們的目的，不但在畢業(yè)，而尤注重在畢業(yè)以后的出路。所以專門研究學(xué)術(shù)的教員，他們不見得歡迎，要是點名時認真一點，考試時嚴格一點，他們就借個話頭反對他，雖罷課也在所不惜。若是一位在政府里有地位的人來兼課，雖時時請假，他們還是歡迎得很，因為畢業(yè)后有闊教師作靠山。這種科舉時代遺留下來的劣根性，是于學(xué)習(xí)上很有妨礙的。辛亥革命前，京師大學(xué)堂辦了10余年，幾經(jīng)周折，并沒有培養(yǎng)出多少人才。外國人視之為“蒙養(yǎng)學(xué)堂”，連滿清朝廷都自認其水平太低。辛亥革命后，學(xué)校的名稱改了，但本質(zhì)尚未變化，由于北洋軍閥統(tǒng)治時期不良風(fēng)氣的影響，北京大學(xué)的名聲臭到了極點，幾乎不可救藥。

首先是封建衙門習(xí)氣仍重。京師大學(xué)堂時期，北大就是為了培養(yǎng)封建官僚，因而官場習(xí)氣在學(xué)生和教師中蔓延，學(xué)堂像衙門。民國初年的北京大學(xué)，仍然是衙門氣十足，沒有多少學(xué)術(shù)氣氛，有的教師不學(xué)無術(shù)，進大學(xué)教書只不過為做官準(zhǔn)備；有的教師干脆就是清末舊官僚或北洋政府的官僚，學(xué)問不大，派頭卻不小。如沈尹默記述的，他初入北大任教時，有一預(yù)科教地理的桂蔚丞老先生，每上課時，均有一聽差挾一地圖、捧一壺茶和一只水煙袋跟隨上講堂，置之于講臺上，然后退出，下課照送如儀。這位老先生還經(jīng)常在上課時對學(xué)生留一手，教科書、參考書和講義對學(xué)生是保密的，絲毫不允被借閱。教學(xué)內(nèi)容陳舊，因循守舊，沿襲了清末大學(xué)堂風(fēng)氣。

學(xué)生讀書也以求功名利祿為目的，仍然是“書中自有千金祿，書中自有顏如玉，書中自有黃金屋”的思想。1905年以后雖然取消了科舉，但一般學(xué)生認為學(xué)校畢業(yè)相當(dāng)于科舉的舉人、進士資格，以畢業(yè)后做官為目標(biāo)。由于學(xué)生有做官發(fā)財思想，學(xué)生從預(yù)科畢業(yè)后，多入法科，入文科者甚少，入理科者更少。因為最終目的總是做官，不如入法科，學(xué)一點政治、法律，比較吃香。

據(jù)統(tǒng)計，1917年底，北大法科的本科和預(yù)科在校學(xué)生841人，文科學(xué)生418人，理科學(xué)生422人，工科學(xué)生只有80人。讀法科的學(xué)生是文、理科的總和，是工科的十倍半。以至于北京大學(xué)為招收文科學(xué)生不得不降格以求，報考文科可以不要預(yù)科畢業(yè)文憑，只要有同等學(xué)歷即可。

學(xué)風(fēng)不正，師生滿腦子當(dāng)官發(fā)財思想。學(xué)生中官僚、富豪子弟不少，很多學(xué)生花錢一年要上千銀圓，有的甚至一年要花5000銀圓。一些有錢的學(xué)生，在學(xué)校里帶聽差、吃花酒、打麻將、捧名角，對讀書毫無興趣。當(dāng)時北京大學(xué)還流行一種壞風(fēng)氣：嫖娼。無聊師生，吃過晚飯后就坐洋車直奔“八大胡同”和平門外韓家潭一帶妓院集中的地方。以至當(dāng)時民間流傳說：“兩院一堂”是八大胡同最好的主顧-- “兩院”指當(dāng)時國會參議院和眾議院，“一堂”指京師大學(xué)堂，北大此時雖已經(jīng)改名，社會上仍有許多人習(xí)慣稱之為“大學(xué)堂”-- 這句俗話是指：民國初年去逛八大胡同的，以國會議員和北大師生為多。

為畢業(yè)以后做官，許多學(xué)生在校期間拉幫結(jié)伙，往來應(yīng)酬。當(dāng)時在北大還流行“結(jié)十兄弟”，即10個氣味相投的學(xué)生結(jié)拜做兄弟，畢業(yè)后大家鉆營做官，誰的官大，其他9人就到他手下當(dāng)科長、當(dāng)秘書，撈個一官半職，“有福同享”。如果是向軍閥或大官僚買官，那么花費的鉆營費由10人分攤。如此烏煙瘴氣，哪里像什么“最高學(xué)府”？中西合辦的山西大學(xué)堂是怎樣創(chuàng)立的

在20世紀初轟轟烈烈席卷華北地區(qū)的義和團運動中，山西情況格外特殊。當(dāng)時山西巡撫毓賢執(zhí)行了慈禧太后“殺絕洋人”的密電，對外國傳教士和教民極端仇視，所以山西省教案特別殘酷嚴重。

當(dāng)時，在省會太原“以保護教徒”為名，將外國傳教士和中國教徒骨干人員集中管制。

1900年（光緒二十六年）7月9日，山西巡撫毓賢將集中在一起的41名傳教士和17名中國教徒以及英國教師畢翰道一家7口人，押解到巡撫衙門署西轅門前全部處死。此后，全省多處發(fā)生了焚燒教堂、殺戮傳教士和教徒的事件。

八國聯(lián)軍侵占北京后，即兵分四路，進逼山西。1901年春，八國聯(lián)軍先后攻陷山西龍泉關(guān)、平型關(guān)、娘子關(guān)、固關(guān)等地，威脅太原，形成了“聯(lián)軍壓境，全省岌岌”的嚴重局面。

這時，在太原的天主教會向新任山西巡撫前任山西巡撫毓賢后來被清政府處死。岑春煊提出許多賠償要求，并占領(lǐng)了令德堂書院作為教堂和住宅。岑春煊迫于無奈，接受山西洋務(wù)局督辦沈敦和的建議，電請英國耶穌教浸禮會傳教士李提摩太，來太原協(xié)商解決山西教案問題。以賠款創(chuàng)辦中西大學(xué)堂

英國人李提摩太，曾先后在山東、山西、上海等地傳教達20余年，是當(dāng)時國際上有名的“中國通”。大英帝國以所謂“庚子賠款”，勒索山西人民白銀50萬兩，李提摩太作為英方接受賠款的代表，于1901年（光緒二十七年）3月26日由上海赴京，經(jīng)與英美等國公使協(xié)商，并和耶穌教各會代表葉守真、文阿德共同擬定《上李傅相辦理山西教案章程七條》面交李鴻章。

其中第三條提出：“共罰山西全省白銀五十萬兩，每年交銀五萬兩，以十年為期。但此款不歸西人，亦不歸教民，專門開導(dǎo)晉省人民知識，設(shè)立學(xué)堂，教育有用之學(xué)，使官紳庶子學(xué)習(xí)，不再受惑。選中西有學(xué)問者各一人總管其事?！?/p>

李鴻章照準(zhǔn)后，發(fā)出電報，令山西巡撫岑春煊照此迅速辦理。

耶穌教會推選出郭崇禮、史密斯、文阿德、葉守真等八位代表，于7月9日到達太原，與岑春煊商談實施辦法。因岑春煊對罰款、校內(nèi)傳教等持有異議，故一時未能議妥。

駐在上海市的李提摩太，幾次發(fā)電報到太原去催促。于是岑春煊派洋務(wù)局提調(diào)周之驤赴上海市與李提摩太面談，但仍堅持幾個條件：不稱“罰款”，不許在校內(nèi)傳教，學(xué)校與教堂不發(fā)生關(guān)系，外籍教師不得干預(yù)學(xué)校行政等。

經(jīng)過反復(fù)談判，1901年10月，終于在上海市議定了在山西太原“創(chuàng)辦中西大學(xué)堂”的合同八條。山西大學(xué)堂與中西大學(xué)堂合并

正在跟李提摩太商談設(shè)立“中西大學(xué)堂”的同時，山西遵照清政府各省設(shè)大學(xué)堂的上諭，于光緒二十八年（1902）初，奏準(zhǔn)在原“令德堂”的基礎(chǔ)上創(chuàng)辦了“山西大學(xué)堂”。委派山西候補道姚文棟為山西大學(xué)堂首任督辦，高燮曾為總教習(xí)，谷如墉為副教習(xí)，選文瀛湖南貢院為臨時校址，接收令德堂和晉陽書院的師生，籌備開學(xué)。

1902年3月，當(dāng)李提摩太偕同他聘請的中西大學(xué)堂總教習(xí)敦崇禮、分教習(xí)新常富等從上海抵達山西太原后，發(fā)現(xiàn)“山西大學(xué)堂”業(yè)已搶先創(chuàng)辦，便多次建議將山西大學(xué)堂與中西大學(xué)堂合并辦理。若合并后可分兩部：一部專教中學(xué)指中國學(xué)問。，由中方負責(zé)；另一部教西學(xué)（指西方學(xué)問），由李提摩太負責(zé)，并把上述建議擬好報岑春煊考慮。岑春煊權(quán)衡再三，不敢擅定，后奏請清政府批準(zhǔn)，方達成關(guān)于中西大學(xué)堂并入山西大學(xué)堂的協(xié)議，并于5月在《京報》發(fā)布“山西大學(xué)堂成立”的消息，以便擴大對外影響。

中西大學(xué)堂并入山西大學(xué)堂后，原先設(shè)立的山西大學(xué)堂改為“中學(xué)專齋”，經(jīng)費與“西學(xué)專齋”相當(dāng)，每年從省庫學(xué)堂白銀5萬兩中支付。這時，原任督辦姚文棟辭職，委任沈效和接替。兩齋各設(shè)總理一人，中學(xué)專齋為谷如墉，西學(xué)專齋為李提摩太。兩齋總理以下，設(shè)總教習(xí)、副總教習(xí)和分教習(xí)，中學(xué)專齋另設(shè)提調(diào)和堂舍監(jiān)督，總管兩齋后勤事務(wù)。山西大學(xué)堂的校址，校本部、中學(xué)專齋及兩齋學(xué)生食宿均在貢院；西學(xué)專齋另借皇華館學(xué)臺衙門西院的皇華別墅作為臨時校址。

1902年5月8日（光緒二十八年六月二十六日）中西合辦的山西大學(xué)堂正式開學(xué)，西學(xué)專齋開始上課，巡撫岑春煊和省城重要官紳出席了開學(xué)典禮。同年，山西大學(xué)堂在上海成立了譯書院。

1903年，根據(jù)清政府頒布的《奏定學(xué)堂章程》須設(shè)有三科方能稱為大學(xué)堂的規(guī)定，其他各省都遵章將學(xué)堂改為高等學(xué)堂，全國僅有京師大學(xué)堂、北洋大學(xué)堂、山西大學(xué)堂正式稱為“大學(xué)堂”。清末山西大學(xué)堂的發(fā)展

1903年，山西大學(xué)堂在太原侯家巷購置地皮 200畝。1904年秋，校舍落成，山西大學(xué)堂全部遷入（今太原師范?？茖W(xué)校校址）。

山西大學(xué)堂的學(xué)科設(shè)置，基本上是根據(jù)《欽定學(xué)堂章程》和《奏定學(xué)堂章程》新的規(guī)定逐步完善和建立起來的。初辦時，中、西兩齋招收學(xué)生各200名，每人每月發(fā)給白銀4兩，但在教學(xué)內(nèi)容和教學(xué)方法上，卻有較大差別，充分體現(xiàn)了中學(xué)和西學(xué)的不同。

辦學(xué)之初，中齋只設(shè)中等科，西齋只設(shè)預(yù)科。自1906年先后設(shè)立高等科和本科。

中學(xué)專齋開設(shè)的課程有經(jīng)、史、政、藝四科。谷如墉講授《戰(zhàn)國策》，高燮曾講授《近思錄》，賈耕講授《禹貢》，田應(yīng)璜講授《明史》，成年增講授算學(xué)。

1904年，中齋又增設(shè)了外文（英、日、法、俄文）、代數(shù)、幾何、物理、化學(xué)、博物、歷史、地理、國文、圖畫、音樂和體操。

西學(xué)專齋開設(shè)的課程有：文學(xué)、物理、工學(xué)、礦學(xué)、格致、法律、西洋史、世界史、體操、數(shù)學(xué)、英文、圖畫。

中齋教習(xí)張友桐編寫的《中國通史》內(nèi)容充實；傅岳芬編寫的《西洋史講義》簡明扼要；西齋格致博士和化學(xué)教習(xí)新常富編寫的《無機化學(xué)講義》譯成中文后，頗受歡迎。

這些教科書風(fēng)行一時，銷路很廣，對開展中外文化交流，促進我國文化教育事業(yè)的發(fā)展，傳播西方先進的科學(xué)技術(shù)知識和資產(chǎn)階級民主主義思想，都有較大的作用。

當(dāng)初畢業(yè)考試仍然沿用科舉形式，分別給以貢生、舉人、進士等出身資格的獎勵，這些都延續(xù)了封建教育制度的實質(zhì)。