蒙蒂賽洛的隱士杰斐遜的晚年是在蒙蒂賽洛莊園度過的，親自經(jīng)營(yíng)他的農(nóng)場(chǎng)，進(jìn)行農(nóng)作方面的試驗(yàn)和改良。作為一個(gè)思想家和教育家，他終日與書籍為伴，也研究自然科學(xué)，偶爾還搞點(diǎn)發(fā)明創(chuàng)造。但他并未與世隔絕，通過大量的信件，他與各界友人保持著密切的聯(lián)系，經(jīng)常接待各方賓朋。經(jīng)過通信，他恢復(fù)了與約翰·亞當(dāng)斯中斷多年的友誼，兩人在書信中談古論今，回首往事，成為他晚年的一件樂事。

杰斐遜始終認(rèn)為，書籍是人類的良師益友。當(dāng)他得知國(guó)會(huì)圖書館在第二次獨(dú)立戰(zhàn)爭(zhēng)中被燒毀時(shí)痛心疾首，遂決定把自己的藏書獻(xiàn)給政府。杰斐遜寶貴的藏書在重建國(guó)會(huì)圖書館時(shí)起了重要的作用。

杰斐遜還以極大的熱情關(guān)注教育事業(yè)的發(fā)展。在多年研究的基礎(chǔ)上，他制定了一套極為系統(tǒng)的教育制度，該制度充分體現(xiàn)了杰斐遜的教育理念和民主主義思想，對(duì)美國(guó)的教育體制和教育事業(yè)的發(fā)展產(chǎn)生了深遠(yuǎn)的影響。

1816年開始，他著手創(chuàng)辦弗吉尼亞大學(xué)，從籌措經(jīng)費(fèi)、繪制藍(lán)圖，到制訂教學(xué)計(jì)劃、聘請(qǐng)學(xué)者，他事必躬親，并擔(dān)任了首任校長(zhǎng)。這座被杰斐遜視為他一生中最重要的創(chuàng)建學(xué)校之一，如今已成為美國(guó)著名的高等學(xué)府，為國(guó)家輸送了大量高級(jí)專門人才。

在晚年，蒙蒂賽洛似乎成了一塊圣地，不斷有人從各個(gè)地方前來拜訪這位年邁的先賢，其中有他的朋友、老同事、政府官員、國(guó)會(huì)議員和外國(guó)友人等，也有不少是拿著介紹信來的陌生人。杰斐遜很喜歡這種會(huì)見，并熱情地款待四方賓朋，這種慷慨的待客活動(dòng)消耗掉了大量的資源和錢財(cái)，杰斐遜的經(jīng)濟(jì)收入不斷下降。但是，他的好客精神似乎從未減弱。

杰斐遜非常重視對(duì)子孫后代的教育，不僅為他們提供良好的學(xué)習(xí)環(huán)境，用自己的道德觀念教導(dǎo)他們，還經(jīng)常與孩子們同樂，周詳?shù)剡^問他們的飲食起居。

1826年6月，杰斐遜的病情日益沉重。7月4日 美國(guó)獨(dú)立五十周年紀(jì)念日，他的老朋友約翰·亞當(dāng)斯在新英格蘭辭世，彌留之際仍在喃喃呼喚： 托馬斯·杰斐遜還活著。 其實(shí)，杰斐遜已早他幾小時(shí)在蒙蒂賽洛的家中靜靜地長(zhǎng)眠了。

杰斐遜安葬在蒙蒂賽洛的家族墓地中 他的身旁便是愛妻瑪莎的香冢，墓碑上銘刻著他生前擬好的簡(jiǎn)短碑文：

托馬斯·杰斐遜之墓

美國(guó)《獨(dú)立宣言》的起草人

弗吉尼亞宗教自由法案的作者

弗吉尼亞大學(xué)的創(chuàng)建人