3月18日，周恩來向毛澤東、林彪等寫了一封信，連同聶榮臻的報告一同送毛澤東。

周恩來又寫信給李富春、李先念、余秋里、谷牧并葉劍英：主席指示，繼國防工業(yè)軍管之后可對工交財貿(mào)各部，凡癱瘓陷入無政府狀況者，也可實行軍管。請你們明日上午集體一議。

在對各省、市、自治區(qū)和中央各部委實行軍管的同時，周恩來還考慮對全國一些重要的、事關國計民生的大型廠礦企業(yè)實行軍管。

3月初，周恩來指示北京衛(wèi)戍區(qū)起草了一個關于對廠礦企業(yè)實行軍事管制的布告。

布告指出：北京衛(wèi)戍司令部奉國務院、中央軍委命令，對廠礦實行軍事管制，以促進無產(chǎn)階級革命派大聯(lián)合，籌備組成“三結合”的領導機構，搞好本單位的文化大革命和生產(chǎn)工作。廠礦全體人員必須堅守崗位，遵守紀律，努力工作，服從指揮。一切長期在外串聯(lián)的人員限一周內(nèi)回廠。否則將予必要的紀律處分，直至開除。

這一布告本來是只限于北京地區(qū)的廠礦企業(yè)，因為是北京衛(wèi)戍司令部執(zhí)行的。但周恩來把這一布告推向全國。

3月14日，周恩來在審閱此布告時，將“奉國務院和中央軍委命令”改為“根據(jù)毛主席的指示”。次日，周恩來將此布告送毛澤東批閱。并注明：這一文件經(jīng)北京衛(wèi)戍區(qū)起草，并在今晚釣魚臺碰頭會上修改通過?，F(xiàn)送上請予審閱，并請主席批準。在批準后，并擬發(fā)全國參考。

3月16日，毛澤東批示：照辦。

同日，周恩來親自草擬了以中共中央名義向全國轉發(fā)這一布告的批語：各級黨委，各軍區(qū)、軍分區(qū)黨委，各省、市、自治區(qū)革命委員會：現(xiàn)將中國人民解放軍北京衛(wèi)戍司令部起草并經(jīng)中央批準的對需要實行軍事管制的廠礦的布告，轉發(fā)你們參照執(zhí)行。

對于那些搞打、砸、搶，搞無政府主義的造反派來說，軍管無疑是對他們的一道“緊箍咒”。因此，軍管常常受到來自各方面的沖擊，特別是當解放軍受到?jīng)_擊時更是如此。

為了維護軍管的威信，周恩來與沖擊、破壞軍管的行為作了不懈的斗爭。

4月15日，周恩來在與廣州各群眾組織代表座談時，一造反派代表公然指責軍管是“陰謀”。

周恩來當即站起來嚴厲地批評說：軍管是毛主席根據(jù)各方面的情況親自決定的，是我經(jīng)手辦的這件事。你這樣說，就是把矛頭直接指向黨中央，我不能不激動，不能不站出來維護毛主席和黨中央的決定。你要承認這句話是講錯了。軍管是完全正確的。

6月24日，周恩來接見參加全國生產(chǎn)供銷會議的各省市軍管會代表團負責人時說：我們無論如何要堅持軍管有效，不管哪一派，都要遵守軍管規(guī)定，不能允許派別組織的權力比軍管會的權力還大。

11月28日，駐合肥市的12軍軍長李德生報告：一群人大鬧軍管會半個多月，沖砸軍部，打傷軍首長。部隊反復勸說都無效。怎么辦？

周恩來當即指示：以電話告李軍長，先進行政治工作；不聽，宣布“九五”命令，進行分化，要他們交出禍首兇手；再不聽，待其直接行兇，當場將兇手逮捕。

對脅從者曉以大義，宣布一律不究，但如再犯，仍將當場逮捕兇手禍首。

12月10日，李德生又報告：安徽蕪湖“三籌處”所屬4個群眾組織拒絕交出武器，搞打、砸、搶、抄，12月以來三次沖擊部隊，搶走大批槍支彈藥，搶占軍管會大樓，使軍管會無法辦公。

周恩來電復李德生：以安徽省軍管會的名義向這4個組織打、砸、搶、抄的小集團提出書面警告，要他們按照中央“九五”命令，立即停止這種非法行為，將武器封存上交。如仍不聽勸告，繼續(xù)犯法，軍管會將執(zhí)行中央命令，依法處理。

12月14日，周恩來接見江蘇造反派代表時，嚴厲批評對軍管會的沖擊，說：不能把軍管制度沖掉。兩派都要服從軍管會。軍管的威信無論如何一定要樹立起來。