1900年閏八月,孫中山發(fā)動對清廷的第二次打擊,即庚子惠州之役。鄭士良發(fā)難于惠州,屢挫清軍,旋以外援不繼潰退,此事早在這年的春天就在策劃了。自從五年前的廣州起義失敗,孫中山和鄭士良等人,便在策劃新的反清武裝起義。孫中山派鄭士良前往廣東惠州聯(lián)絡(luò)會黨發(fā)動起義,又派史堅如到廣州策動,他自已則從日本到香港,準(zhǔn)備潛入內(nèi)地領(lǐng)導(dǎo)起義。但香港殖民當(dāng)局不準(zhǔn)他登岸,只好又折回日本轉(zhuǎn)渡臺灣,打算再從臺灣潛入內(nèi)地。到了農(nóng)歷六月份,孫中山在新加坡,本欲聯(lián)絡(luò)康有為一起起義,反被康氏陷害,于是聯(lián)絡(luò)又流產(chǎn)了。孫中山先生于是回到香港,在商議之時,日本志士建議乘夜晚從九龍上岸,火速進入內(nèi)地,以神風(fēng)突擊之勢襲擊廣州。中山先生不同意此項策劃,以為不過飛蛾撲火。到了公歷10月8日,孫中山派日本志士山田良政赴海陸豐發(fā)動起義。八月十三日(1900年10月6日),鄭士良在惠州三洲田(今深圳鹽田區(qū)的三洲田)率三合會眾六百多人起義,以黃福為元帥,鄭士良、何松為參謀,黃耀庭、廖慶發(fā)、林海山為先鋒,分兩路出發(fā)。東路從馬巒村、金龜洞出禾崗,打新圩,直撲鎮(zhèn)隆,在佛子坳伏擊清軍取得大捷;西路從橫崗出沙灣攻打蘭花廟,大獲全勝,進一步攻打深圳、南頭受阻。東路義軍在永湖、崩岡圩連戰(zhàn)皆捷,勢如破竹,22日乘勝進入三多祝,在白沙扎營,隊伍迅速發(fā)展到兩萬人,其中不少是富有革命傳統(tǒng)的當(dāng)?shù)乜图胰?,聲勢浩大。后因形勢急劇變化,原擬突擊至廈門時獲得接濟的計劃無法實現(xiàn),后援不繼,陷入困境,孫中山電令鄭士良可自決進止,義軍不得不解散,剩下千余洋槍手分水陸兩路返回三洲田,至11月7日無奈解散。
此次起義半月內(nèi)都很順利,到了下旬,因糧食武器失去后援,被迫解散。從打擊的力度來看如果糧餉充足,則事情很可能大有可為。起義軍進擊途中,孫中山先生曾緊急致函日本友人,談到武器的問題有謂:“若今得洋銃萬桿,野炮十門,則取廣州如反掌之易耳?!绷x軍解散后,鄭士良率部分人馬退回香港,山田政良被清軍捕獲,旋即殺害。孫中山先生稱之為“外國義士為中國共和犧牲者之第一人”。
這次起義雖然失利,但對民間的觀念大有影響。先是輿論對革命者稱為亂臣賊子,大逆不道,多所咒罵;這次起義途中與民交流甚多,深得民心,所以失敗后民間對此事大為嘆惋,但恨其事不成。