第一次世界大戰(zhàn)的殘酷殺戮還在繼續(xù)，數以百萬計的人在東線、西線和海上陣亡。愛因斯坦堅持不懈地為他的和平主義理想奔走呼號。德國則依舊沉湎于民族主義的迷夢中尚未清醒。這一迷夢四十年前由完成德國統一的首相奧托·馮·俾斯麥發(fā)起，一直到第二次世界大戰(zhàn)后才真正終結。當德國皇帝威廉二世1888年就位時，他滿懷擴張的野心，他很快解除了年老而政治上非常精明的俾斯麥的職務。德國人因此有了一位很想恢復往日征服者雄風的雄心勃勃的領導者，實際上威廉二世的能力有限，尚不足以帶領德國人走向復興之路。

由于長期的民族主義的熏陶，大部分德國人，不管是開明的還是保守的，在戰(zhàn)爭剛開始時都很支持戰(zhàn)爭。國家的領導者魯莽地強加戰(zhàn)爭于他的人民，支持戰(zhàn)爭的信念還是如此廣泛在德國社會中存在，人們深信戰(zhàn)爭是為所有德國的好處而發(fā)動的。然而，當戰(zhàn)爭進行到后來，大部分人又轉而支持議和，從而或許希望能夠避免失去任何土地。這時候，德國政府并不想讓自己在本國人民面前看上去是個失敗者，同時也害怕會爆發(fā)支持自由化政策的革命，所以硬著頭皮繼續(xù)這場戰(zhàn)爭。戰(zhàn)爭的發(fā)展讓開明者分成好幾個派別，其中許多人反對任何形式的戰(zhàn)爭，從此在人民當中種下了矛盾對立的種子。更糟糕是，德國經濟因為戰(zhàn)爭受到巨大影響。政府已沒有足夠的槍支和軍火儲備，因此必須要雇傭化學家，如愛因斯坦的朋友弗利茲·哈伯，依靠他們的專業(yè)知識制造更多的裝備、軍火，同時也尋找由于戰(zhàn)火變得稀缺的各種物資的替代品。物資匱乏已成了當時普遍存在的狀況，主要原因是壯年男性大批參戰(zhàn)造成的勞動力不足，這種匱乏在1916年導致了一場騷亂。

戰(zhàn)爭期間，愛因斯坦設法寫信給居住在中立國瑞士的孩子們，告訴他們當戰(zhàn)爭結束，和平來臨的時候會回去看他們。他試圖增進與漢斯的感情，告訴不要太擔心學校的功課：“不要太在意考試的分數。只要確定你自己的功課能夠跟得上，沒有必要再讀一年同樣的課程，實在沒有必要在所有課程上都獲得高分。”他還建議漢斯關于學習鋼琴的事，讓他多彈奏自己喜歡的曲子，即使老師沒有布置也值得一試。他寫道：“只有你感興趣的事才能從中學到更多東西，在做自己喜歡的事時你甚至會為之廢寢忘食，我就常常因為太專注于工作而忘了吃飯。”但他也表現出了父親嚴格的一面，他指出漢斯在德文文法和拼寫上的錯誤，對孩子回信中的錯誤拼寫一點都不輕易放過，他說：“你的來信中還是有這么多書寫錯誤，你必須小心不要再在這方面犯錯誤了，因為把單詞拼寫錯了會給人很糟糕的印象?！弊詈笏€告誡孩子們應該每天堅持刷牙。

1917年初，由于長期工作和家庭的壓力，愛因斯坦患上了嚴重的腸胃病，短短的兩個月時間體重減輕了56磅。這個腸胃病時好時壞折磨了他整整四年。愛爾莎很樂意照顧愛因斯坦。實際上，兩人住得很近，愛因斯坦就住在愛爾莎所在的四層公寓的對面，兩人交往非常方便，照顧起來并不麻煩。不過禍不單行，這年12月，他又因為腹膜潰瘍再次臥病在床好幾個月。病到重時，他甚至虛弱得無法向各種物理學雜志提交論文，只能求同事到他家取他的論文，代為轉交約稿單位。

在瑞士蘇黎世，米列娃過得也并不順心，她的健康狀況在惡化。她變得更加憂郁，由于腿部的傷痛，經常臥床不起，成為醫(yī)院的?？?，所以有時照顧孩子們對她來說有點力不從心。幸運的是，愛因斯坦的朋友海因里?！べ澑駹柡兔仔獱枴へ愃鞒３椭樟蟽蓚€孩子。他們認為米列娃身心的問題都是愛因斯坦對她不好造成的，不過愛因斯坦只承認他負部分責任。從家庭的好朋友處得知，當時米列娃還是希望兩人能夠和解，但愛因斯坦已完全把心思放在愛爾莎身上，拒絕了她的要求。他意識到若想讓米列娃此時同意協議離婚不太可能，便把離婚的事擱置起來。愛因斯坦也曾設想把漢斯帶到柏林自己身邊，又擔心米列娃的反對。他把自己一半多的工資都寄給米列娃和孩子們，還有年邁的罹患胃癌的母親保利娜。他一度很擔心錢能否夠用，因為德國馬克在戰(zhàn)爭中對瑞士貨幣大幅貶值。不過，雖然在德國許多人正忍饑挨餓，在城市里好一點的食品非常缺乏，愛因斯坦還是能夠從南部農村的親戚那里獲得一些食品，而海因里?！べ澑駹杽t從瑞士給他寄來十分緊缺的日常用品。這些對他來說彌足珍貴，因為他的腸胃病特別要注意堅持恰當的飲食。由于這些來自朋友和親人的幫助，愛因斯坦的病情還算沒有惡化，能夠支撐著繼續(xù)他的科學研究工作。

至1917年10月份，愛因斯坦到柏林已三年半了，德國依然深陷于戰(zhàn)爭，德國威廉皇帝物理學研究院終于建成開張，愛因斯坦被任命為這個研究院的首任負責人。這個研究所的任務是促進德國的物理和天文學研究。就在赴任前幾個月，愛因斯坦的病剛變得有所好轉，能夠離開病床參加一些專業(yè)會議，而且很快就能在柏林大學教授一些課程了。根據當初的協議，他并不必須去教課，一切全憑他的興之所至。

1917年，德國開始向美國船只發(fā)起攻擊，因為美國人向敵對的協約國運送大量的戰(zhàn)備物資，美國從此也被拖入歐洲戰(zhàn)事。協約國軍隊由于美國的參戰(zhàn)如虎添翼，參戰(zhàn)兵力增加到超過兩百萬人。到1918年，德國人對戰(zhàn)爭已越來越感到厭煩，因此對政府施加越來越大的壓力，要求趕緊結束戰(zhàn)爭。當年，德國軍隊在東線對俄國取得一些勝利，但在西線遭受重大打擊，很多德國軍人已感覺到戰(zhàn)爭很快就要結束了。他們開始與交戰(zhàn)的英法等國展開和平談判，并最終達成一個停戰(zhàn)協定。作為戰(zhàn)勝國的英、法、美等國組成的協約國堅持要求，只有當德國承諾不再擴展壯大其武裝力量，并放下武器撤回原來的國界的情況下，他們才能同意休戰(zhàn)。戰(zhàn)敗的德國政府非常不情愿地接受了這些苛刻的條款，威廉二世皇帝在柏林被迫退位，第一次世界大戰(zhàn)在1918年11月份終于落下帷幕，留下的卻是交戰(zhàn)雙方數以百萬計的士兵陣亡，更多人留下了終生的傷殘和心靈的創(chuàng)傷。