廣惠司者，回回人隸焉。（《山居新語》）

《元史·百官志》又云：

大都（北京），上都（多倫）回回藥物院二，秩從五品，掌回回藥事。至元二十九年（1292）始置。至治二年（1322）撥隸廣惠司，定置達魯花赤一員，大使二員，副使一員。

《元史·百官志》還云：

御藥院秩從五品，掌授各路鄉(xiāng)貢、諸蕃進獻珍貴藥品，修造湯煎。

這條資料所說的“諸蕃進獻珍貴藥品”，當然包括回回藥物在內。說明御藥院里也制回回藥物?；鼗蒯t(yī)藥在朝廷比重甚大，機構正規(guī)龐大。

阿拉伯醫(yī)藥文化與中國傳統(tǒng)醫(yī)藥文化交融的結果，產生了三部著名的醫(yī)藥著作。

《飲膳正要》，作者忽思慧，他取蒙古族、漢族、回族食療和營養(yǎng)保健經驗撰寫成此書，其中部分反映了回族醫(yī)藥狀況。例如所載馬思答吉湯、木瓜湯、雞頭粉血湯大抵是穆斯林方，內用回回豆子、羊肉等，以及咱夫蘭（番紅花）、回回蔥、八檐仁、必思答、回回青、回回小油，均是回回食品或藥品。

《回回藥方》，三十六卷，現北京國立圖書館收藏，僅存四卷的殘本。此書是按百科全書式的體裁寫成的。此書或為元末回回醫(yī)生所撰，此醫(yī)生可能供職于回回藥物院。書內皆阿拉伯方、回回所習用醫(yī)藥?！痘鼗厮幏健穬热菔中路f、豐富，是輸入中國之后的阿拉伯醫(yī)學的代表作，是回回醫(yī)理與方法的集大成者。學術界的一種看法是《回回藥方》與幾種最有影響的阿拉伯古代醫(yī)書，如拉齊的《醫(yī)學集成》、麥朱西的《醫(yī)術全書》、伊本·西那的《醫(yī)典》、秘書監(jiān)司天臺所藏《忒畢醫(yī)經十三部》等有淵源關系?！痘鼗厮幏健方o中國文化融入了一種新的特質，向我們介紹了阿拉伯的哲學思想，它傳播一種與中國傳統(tǒng)中醫(yī)學風格迥異的完整的醫(yī)學體系，給中國介紹了一種其時代最先進的醫(yī)學成就，極大地豐富了中醫(yī)的本草學，為解決中阿文化交流史中的存疑提供了詳細的考證材料。

《瑞竹堂經驗方》，回族醫(yī)學家沙圖穆蘇撰。元泰定三年（1326）之前已流行，明中葉亡佚。今本從日本仿明刻重校本來，已修入《四庫全書》。

吳澄在《瑞竹堂經驗方》序中云：旴江郡侯，蒞官余暇，注意于醫(yī)藥方書之事，遇有得必藏之，積久彌富，題曰《瑞竹堂經驗方》，侯名薩德彌實，瑞竹堂者，往時侯插竹為樊，竹再生根，遂生竹葉，人以為瑞，而侯以匾其堂云。此書五卷，卷一講調補、勞傷、遺濁，每方均以香藥為主，多波斯舶來之品；卷二講喘嗽、痰飲、濕氣、諸痛、補益、腳氣、疝淋、泄、蠱；卷三講眼、耳、鼻、唇、齒、面、髭發(fā)，幾乎90%方中有香藥或舶來品；卷四講女、幼科；卷五講瘡科，也有50%以上用香藥、海上方?？梢娀蒯t(yī)喜用香藥、海方。書中有治疥瘡熱毒“一浴散”：“入浴堂內先令汗出便沐浴，將疥抓破，用前藥搽之，再入堂內洗，如此搽洗三次，然后出浴，更不須再搽藥?！边@是將用藥與穆斯林衛(wèi)生沐浴相結合。此書之經驗方多所新創(chuàng)，或為外來之經驗，如木瓜虎骨丸、秘傳隔紙膏、潛針丸、刷牙藥、鐵刷湯等，用藥之奇，別出心裁。如木瓜虎骨酒已成為中醫(yī)傳統(tǒng)藥酒。

元代，回回醫(yī)生被稱作“回回醫(yī)人”、“回回醫(yī)官”，他們深入各地民間行醫(yī)為計，治病救人，他們能治愈諸種疑難雜癥，其高超的醫(yī)術令中國人稱奇。陶宗儀撰寫的《南村輟耕錄》記載：元大都(北京)“有一小兒頭疼不可忍，有回回醫(yī)官，用刀劃開額上，取一小蟹，堅硬為石，尚能活動，頃焉方死，疼也遄止”。