1911年10月10日，武昌起義成功。不想這場發(fā)生在湖北的革命，給了陳獨秀和他的新夫人一次回到安慶的機會。同時，他們這一段寧靜、愉快的日子也結束了。上有天堂，下有蘇杭。直到很久以后，陳獨秀才意識到，在杭州的日子，是他一生不能再有的美好時光。

安徽獨立過程一波三折。后來，安徽旅滬人士向同盟會推薦了孫毓筠任安徽都督。孫毓筠比陳獨秀大十歲，喜歡抽大煙。上任后，孫毓筠發(fā)給在杭州教書的陳獨秀一份電報，請他赴皖做都督府秘書長。數(shù)年前，陳獨秀淮上旅行，曾拜訪過孫毓筠。他不久前寫《存歿六絕句》還提到孫毓筠。接到電報，陳獨秀喜從天降，立即打點行囊起程。12月，他們?nèi)〉郎虾；匕矐c。在上海，有數(shù)名軍官在酒家聚談戰(zhàn)事，一旁勸酒的蘇州女郎說：“不要戰(zhàn)，腦袋要緊?！边@句話，哄傳上海各報。陳獨秀看了報紙哈哈大笑，對高君曼說，這句話，可以代表江蘇人的溫和性質(zhì)。

和丈夫回安慶，高君曼既歡喜，又擔憂。歡喜的是，丈夫幫都督做事，有臉面；擔心的是，她和姐姐及陳獨秀家人鬧了不愉快，回去又見白眼，而且她此時已有身孕，萬一和姐姐鬧了不痛快，豈不連累孩子？為了避免姐妹鬧矛盾，陳獨秀回安慶住在宣家花園（安慶六中附近，都督府所在地），這里到大南門培德巷陳家大院，走路要二十多分鐘。

14歲的延年、9歲的喬年見父親和姨媽住到了外面，心里不舒服，但年齡小，說不上話。見母親整天掉眼淚，兄弟倆和父親的隔閡更大了。潘贊化也覺察到了陳獨秀父子關系淡漠。但他覺得，陳仲甫奔走革命，公而忘私，并不是仲甫天生沒有人情味。

陳松年后來說：

父親在民初任安徽省都督府秘書長時就是住在宣家花園的。我妹妹子美、弟弟鶴年都是在這里出生的。到反袁失敗，父親避離安慶，又在南京東廠街（秀山公園旁邊）蓋了兩座草房，大約十余間，置地數(shù)十畝，作為高君曼和兩個弟妹的居住點，以后一直沒有回安慶過，我弟弟讀書也是在揚州中學?！?/p>

1912年1月初，陳獨秀走馬上任。當時和陳獨秀同在都督秘書科的有鄧藝孫、洪海闿、江津本、李德膏（李光炯）、盧光浩、馬汝簡、呂嘉德、李中一、龍炳等人，他們中多數(shù)是陳獨秀的老朋友。陳獨秀嫂子張氏的弟弟張嘯岑從前和吳越同在保定學堂讀書，這會也在秘書科管理文書。

陳獨秀性急，有嗣父陳昔凡遺風，恨不得一日干三日的事，常和科里同事發(fā)生口角。這些人到孫毓筠面前說三道四，使陳獨秀與孫毓筠也鬧了矛盾。一日，宣布開會后，孫毓筠和往常一樣，閉目養(yǎng)神，由著陳獨秀滔滔不絕地說，問到一句，孫“哼”一聲，不問則不鳴。孫毓筠認為，宣統(tǒng)已宣布退位，中華民國臨時政府成立了，革命已經(jīng)勝利，可以松一口氣了，他不喜歡陳獨秀的急性格。孫中山后來和陳獨秀談話，把這種松一口氣的態(tài)度狠狠地批評了一頓。