南軍的火器部隊(duì)，繼白溝河之戰(zhàn)后，又一次因逆風(fēng)而失敗。而利用風(fēng)向擊敗敵人似乎已經(jīng)成為了燕軍的專利，他們總是一而再、再而三地利用這招來(lái)打擊敵人，過不了多久，又在同年閏三月進(jìn)軍滹沱河與南軍吳杰部作戰(zhàn)時(shí)，再次乘大風(fēng)揚(yáng)起之機(jī)而進(jìn)攻獲勝。

當(dāng)時(shí)兩軍相遇于藁城，南軍這次不再依賴那些只有正面堅(jiān)固，而兩翼及背后虛弱的橫陣，因?yàn)槟切╆囃粚?duì)手用迂回行軍的方式從虛弱處突破，他們吸取了教訓(xùn)，在戰(zhàn)場(chǎng)上布下了一個(gè)方陣。所謂方陣，是將精兵利器平均分布于四面的陣。方陣似乎沒有虛弱的側(cè)后，每一面都是堅(jiān)固的正面。

但是這個(gè)方陣在未交戰(zhàn)之前卻遭到了朱棣的嘲諷，他認(rèn)為方陣四面受敵，豈能致勝？這樣的陣只要一隅被突破，其它的三面必然解體！話雖然說(shuō)得漂亮，可是能否真的破陣那只有天知道了。

上天幫了朱棣的忙，又一次括起了東北風(fēng)，燕軍搶先在東北方向布陣，而南軍的方陣則擺在西南的逆風(fēng)方向。

朱棣在進(jìn)攻時(shí)廣布疑兵牽制南軍方陣的三面，而集中主力攻擊方陣的東北隅，他率數(shù)百騎搶先突入，配合主力順著東北風(fēng)破陣，斬首六萬(wàn)余具，再奏凱歌。

燕軍與南軍反復(fù)拉鋸，戰(zhàn)火也從北方蔓延到南方。1402年（建文四年），朱棣以破釜沉舟的氣慨，毅然率主力長(zhǎng)途奔襲，南下攻占揚(yáng)州，從瓜州渡過長(zhǎng)江，經(jīng)鎮(zhèn)江包圍了京城南京，南京守將李景隆大開城門而降，燕軍入城，建文帝從此活生生地從人間消失，下落不明。

朱棣進(jìn)京，殺掉了被稱之為“奸臣”的齊泰、黃子澄、方孝孺等人，便正式稱帝，改年號(hào)為“永樂”，史稱明成祖（又叫明太宗）。他即位之后，表面繼續(xù)擁護(hù)父親朱元璋定下的分封諸王制度，暗中卻不斷削弱諸王的軍事力量，例如陸續(xù)將分封在各個(gè)戰(zhàn)略要地的藩王們遷入內(nèi)地，削弱諸王參與軍事行動(dòng)的權(quán)力等等，目的是盡量杜絕諸王反抗中央政府事件的發(fā)生。然而，只要分封制度仍然存在，就必然存在藩王伺機(jī)背叛的隱患。