跟此人密切相關(guān)的另外一件重要的事是基洛夫被刺這件案子。不管是不是斯大林主謀，但是直接參與這件案子的的確是亞戈達(dá)本人。

1934年10月15日，也就是謀殺基洛夫之前的一個(gè)半月，尼古拉耶夫在紅霞大街上的基洛夫家旁邊被拘捕。此人被捕之后，內(nèi)務(wù)人民委員部列寧格勒局政府保衛(wèi)處處長(zhǎng)訊問并搜查了他。但是，讓人不能理解的是尼古拉耶夫又被放了，要知道在那個(gè)時(shí)候時(shí)局很緊張，任何一個(gè)可疑的人都是危險(xiǎn)的，尼古拉耶夫被抓起來又被釋放本身就非?？梢?，況且抓住他的時(shí)候，他手中還有槍。內(nèi)務(wù)人民委員部此時(shí)正是亞戈達(dá)管理，因此尼古拉耶夫第一次被抓然后釋放是經(jīng)過亞戈達(dá)本人點(diǎn)頭的。尼古拉耶夫本人的確有點(diǎn)神經(jīng)質(zhì)，正是由于他的神經(jīng)質(zhì)，所以被亞戈達(dá)利用這種可能也是存在的。

但是這樣一個(gè)精神有問題的人被選中作為謀殺基洛夫的人選，顯然有不合理的地方。尼古拉耶夫本人跟基洛夫到底有什么關(guān)系呢？據(jù)一些文獻(xiàn)資料表明，尼古拉耶夫有一位漂亮的妻子，而基洛夫本人又很有魅力，所以尼古拉耶夫極有可能是聽到了一些難聽的話，比如基洛夫可能跟他妻子有染之類的。但是這些只是后來人的猜測(cè)，如果基洛夫遇刺這件事情有更深的背景，那么這些被渲染得有聲有色的資料有可能是捏造的。

基洛夫事發(fā)之后，亞戈達(dá)很快介入到這件案子中，他下令要搜捕隱藏的白衛(wèi)軍分子。但是斯大林已經(jīng)作出了另外的決定，并命令亞戈達(dá)不要浪費(fèi)時(shí)間。斯大林說：“要不然我打你耳光。”他經(jīng)常這樣與國(guó)家安全機(jī)關(guān)領(lǐng)導(dǎo)人講話，動(dòng)不動(dòng)就說“我打你耳光”。 亞戈達(dá)當(dāng)然知道這句話的含義，他很快向斯大林匯報(bào)了調(diào)查結(jié)果，他的調(diào)查結(jié)果顯示基洛夫被刺殺是由托洛茨基及其反對(duì)派策劃的。

斯大林支持這一結(jié)果，因?yàn)檫@樣有利于他清除異己，于是斯大林開始了他的“大清洗”?；宸蛩篮笫?，斯大林寫了一篇名為“殘暴殺害基洛夫同志事件”的信給政治局委員們。這對(duì)于亞戈達(dá)所領(lǐng)導(dǎo)的組織來說，他們的指導(dǎo)思想是，加快審理涉嫌參與恐怖活動(dòng)的案件，不接受有關(guān)此類案件的赦免請(qǐng)求書，立即處決被判處極刑的人。這樣一來國(guó)家安全機(jī)關(guān)的工作流程也簡(jiǎn)化了，說白了，這個(gè)時(shí)候可以說是想抓誰就抓誰，想殺誰就殺誰，恐怖的氣氛已經(jīng)來了。

起初特別會(huì)議有權(quán)不經(jīng)審判就把被認(rèn)定有社會(huì)危害的人流放5年或送勞改營(yíng)5年，把外國(guó)公民驅(qū)逐出境。到1937年，特別會(huì)議獲得了把被控屬于托洛茨基右翼組織、間諜和破壞活動(dòng)組織、恐怖主義組織的人以及被判極刑者的家庭成員送勞改營(yíng)8年的權(quán)力。從1941年11月17日起，特別會(huì)議已經(jīng)可以作出直至死刑的任何判決。他們的權(quán)力越來越大，手段也越來越殘忍。