其實，在豬灣事件上，肯尼迪對中情局大有意見，中情局對肯尼迪更有意見，而且非常大。在豬灣事件后的調(diào)查中，中情局被問到任務(wù)為什么會失敗的時候，有人在暗地里大罵肯尼迪是個雜種。它故意把自己當(dāng)時的預(yù)測——據(jù)中情局當(dāng)時估計，只要古巴旅一登陸，就會有2500名參加者，2萬名同情者，至少有占古巴人口總數(shù)25%的人給予各種形式的支持——給隱瞞，而是責(zé)怪豬灣行動期間，肯尼迪總統(tǒng)在中情局的強烈要求下居然不出軍隊?？芍星榫滞耍夏岬显缭谪i灣行動前就公開說過，美國軍隊將不會參加對古巴的入侵。但肯尼迪當(dāng)時只是這么一說，并不是真的見死不救。至少中情局是這樣認(rèn)為的，可肯尼迪后來發(fā)現(xiàn)如果出動軍隊將是一個嚴(yán)重的錯誤，所以，他真的如中情局所說的那樣見死不救了。

中情局對肯尼迪的這一行為非常懊惱，一位中情局官員這樣寫道：自1949年共產(chǎn)黨在中國掌權(quán)以來，沒有哪件事像豬灣慘敗對美國及其盟友產(chǎn)生過這樣大的影響。由此之后，歐洲有了柏林墻，導(dǎo)彈危機(jī)發(fā)生，游擊戰(zhàn)遍及拉丁美洲和非洲——仿佛打開了潘多拉的匣子。

這就是中情局的觀點，因為肯尼迪不對他們施以援手，所以，豬灣失敗的責(zé)任應(yīng)該由肯尼迪來負(fù)，而這之后發(fā)生的所有危機(jī)的責(zé)任也該由肯尼迪來背。

中情局儼然就像個怨婦，而肯尼迪就是那個拋棄它的男人。但是，中情局又不是一個善良的怨婦，它一面咒罵肯尼迪，一面卻仍舊在對古巴進(jìn)行秘密行動。對卡斯特羅的暗殺，對古巴連續(xù)發(fā)動小規(guī)模的騷擾性襲擊，前面談到的要把卡斯特羅的胡子拿到美國也是中情局的計劃之一。1962年10月，中情局在沒有得到任何授權(quán)的情況下向古巴派出了3支突擊隊。知道這一情況的司法部長羅伯特·肯尼迪大發(fā)雷霆，恨不得吃了中情局?？夏岬峡偨y(tǒng)立即做出反應(yīng)，要求中情局立即停止對古巴的秘密行動，但中情局置若罔聞。羅伯特·肯尼迪后來居然動用聯(lián)邦調(diào)查局的力量去襲擊中情局在美國偏僻地點的古巴流亡分子訓(xùn)練隊，這更讓中情局與肯尼迪的仇恨大大增加。其實，雖然中情局經(jīng)過十年的發(fā)展已經(jīng)有了足夠與白宮抗衡的實力，但它畢竟是美國政治的一部分，肯尼迪想要搞掉它，也不是一件難事。關(guān)鍵就在于，負(fù)責(zé)處理中情局的羅伯特·肯尼迪太忙了，作為司法部長，他有很多事情要忙，只能分出一點精力來對付中情局。而中情局多年以來的秘密行動幾乎很少通過總統(tǒng)，這種習(xí)慣一旦成為自然，他們的膽子大起來，就會使用各種秘密方式來采取行動。所以，肯尼迪沒有讓得力的人直接控制他們，再加上他在那段時間主要把精力放在了連任上，所以，事情就很難得到解決了。