值得一提的是，北約并沒有進(jìn)行正式宣戰(zhàn)，不過，這是二戰(zhàn)結(jié)束之后所有戰(zhàn)爭的共性。戰(zhàn)爭于1999年6月11日結(jié)束，當(dāng)天，南聯(lián)盟領(lǐng)導(dǎo)米洛舍維奇接受聯(lián)合國第1244號決議。

美國、英國和多數(shù)其他北約國家，都反對以獲得聯(lián)合國的批準(zhǔn)作為軍事打擊的前提，它們認(rèn)為這將瓦解北約的權(quán)威。而且，它們認(rèn)為俄羅斯和中國會行使否決權(quán)，這就會導(dǎo)致北約無法實(shí)現(xiàn)自己的戰(zhàn)略目標(biāo)。但是，法國和一些其他成員國都主張，盟軍的行動應(yīng)該獲得聯(lián)合國的批準(zhǔn)。

2001年發(fā)生的“9?11事件”，使北約在歷史上第一次調(diào)用《北約憲章》的第五條，即“對一個成員國的進(jìn)攻視同對所有成員國的進(jìn)攻”。2001年10月4日，此條款被認(rèn)定符合條件。

北約進(jìn)行了8個部署以回應(yīng)恐怖襲擊，包括“鷹援行動”（OperationEagleAssist）以及“積極奮進(jìn)行動”。前者始于2001年10月4日，是在地中海進(jìn)行的海軍行動，意在阻止恐怖分子或者大規(guī)模破壞性的活動，并提升地中海商業(yè)航路的安全。

剛開始的時候，北約顯示了其團(tuán)結(jié)的一面，但是，在一年多之后，北約面臨了一場危機(jī)。2003年2月10日，法國和比利時否決默許程序，反對對土耳其采取保護(hù)措施，以防與伊拉克發(fā)生戰(zhàn)爭。德國沒有動用此權(quán)利，但支持法國和比利時的否決。

在阿富汗的問題上，北約剛開始也顯示了團(tuán)結(jié)。2003年4月16日，在德國與荷蘭的要求之下，北約同意指揮在阿富汗的國際安全援助部隊(duì)，并獲得19個北約國家的一致批準(zhǔn)。指揮權(quán)的移交發(fā)生在8月11日，這標(biāo)志著北約歷史上第一次在北大西洋地區(qū)之外執(zhí)行使命。