捷克民眾立即積極響應(yīng)，工業(yè)企業(yè)的生產(chǎn)效率大幅度降低。1941年6月到9月間，捷克軍火企業(yè)產(chǎn)量平均降低18%，有些工廠下降了35%。抵抗組織的破壞活動(dòng)也變得異?；钴S，捷克政府通信線路被剪斷， 鐵軌被拆毀，8月間一個(gè)油庫(kù)被破壞而發(fā)生爆炸，燒掉10萬公升汽油。

捷克局勢(shì)的惡化使希特勒非常擔(dān)心，于是決定替換捷克總督。希特勒決定派一個(gè)鐵腕人物到捷克恢復(fù)秩序，海德里希立刻請(qǐng)纓。

1941年9月27日，海德里希抵達(dá)布拉格。當(dāng)天晚上，海德里希就宣布在捷克主要城市實(shí)行戒嚴(yán)，開始著手打擊捷克地下抵抗運(yùn)動(dòng)。海德里希的鐵腕治國(guó)一視同仁，打擊對(duì)象并不限于抵抗組織，還包括民憤極大的不法奸商，而且并不因當(dāng)事人的社會(huì)地位、財(cái)富或民族而區(qū)別對(duì)待，這種“鐵面無私”頗得人心。1941年9月底，德裔化學(xué)家梅徹爾因向捷克流亡政府提供情報(bào)而被槍決。11月，德裔工廠主亞當(dāng)兄弟以“破壞經(jīng)濟(jì)秩序”的罪名被處以絞刑。

戒嚴(yán)持續(xù)了三個(gè)月，其間一共有404人被判處死刑，其中包括前捷克軍隊(duì)的6名將軍和10名上校，另外有5000多人被送進(jìn)集中營(yíng)。被槍決的404人里面，169人屬于經(jīng)濟(jì)罪犯，主要是那些投機(jī)倒把分子。海德里希的秘密警察效率極高，幾個(gè)星期內(nèi)捷克地下抵抗運(yùn)動(dòng)幾乎被破壞殆盡，僅捷共還有零星活動(dòng)。這種被后來史學(xué)家稱為“恐怖統(tǒng)治”的統(tǒng)治方式，其實(shí)具有極強(qiáng)的隱蔽性。因?yàn)樽ゲ缎袆?dòng)基本上都在夜間悄無聲息地進(jìn)行，白天各大城市依然歌舞升平，并不是戰(zhàn)后捷克官方歷史描述的那種警笛長(zhǎng)鳴，蓋世太保橫沖直撞的景象。

所以，不得不佩服這個(gè)殺人如麻的魔頭翻云覆雨的手腕。他將軟硬兼施耍得出神入化，恐怖統(tǒng)治的另一面則是懷柔政策。

10月初，海德里希命令重新統(tǒng)計(jì)全國(guó)的谷物和牲畜數(shù)量，結(jié)果查出大批非法囤積的食品和肉類，而沒收的食品直接送到各個(gè)工廠的食堂去。海德里希在捷克工廠企業(yè)推行食堂制度，政府保證食堂的食品供應(yīng)，以改善工人的營(yíng)養(yǎng)水平，工人在這里就餐不用花費(fèi)食物票證。

海德里希還努力將捷克的食品配給標(biāo)準(zhǔn)提高到德國(guó)本土的水平，捷克兩百萬工人的油脂定量提高到每月420克，核心軍工廠的工人則達(dá)到每月 1040克。在社會(huì)福利方面，海德里希在捷克施行德國(guó)本土的福利標(biāo)準(zhǔn)，大幅度提高捷克人的養(yǎng)老金和醫(yī)療保險(xiǎn)。1942年4月1日起實(shí)行的新福利制度，老年病殘養(yǎng)老金增加20%，遺孀福利增加三分之一，孤兒福利增加75%。全民失業(yè)保險(xiǎn)制度的實(shí)施則是捷克史無前例的。