盟軍總司令部以逮捕戰(zhàn)爭(zhēng)狂人東條英機(jī)為開(kāi)端，先后將對(duì)發(fā)動(dòng)太平洋戰(zhàn)爭(zhēng)負(fù)有責(zé)任的東條內(nèi)閣的閣僚岸信介等39人全部逮捕。其中厚生省大臣小泉清彥于9月13日剖腹自殺。文部省大臣橋田邦彥服毒身亡。 此外還有陸軍大將山下奉文、陸軍中將本田雅晴作為菲律賓的戰(zhàn)犯，被押上軍事法庭判處死刑。

由于戰(zhàn)犯自殺之事不斷發(fā)生，盟軍總司令部決定改變方式，不直接插手，而是通過(guò)日本政府進(jìn)行逮捕。

盟軍總部對(duì)戰(zhàn)犯的追究是毫不留情的。11月19日，原陸軍大臣荒木貞夫大將、原首相小磯國(guó)昭、原陸軍大將松井石根、原外務(wù)大臣松岡洋右、原郵電大臣久原房之助等11人被捕；12月1日，皇族梨本宮守正、原首相平沼騏一郎、廣田宏毅、大藏大臣池田成彬、評(píng)論家大川周明、德富豬一郎、原國(guó)務(wù)大臣緒方竹虎、下村宏、《讀賣新聞》社長(zhǎng)正力松太郎等59人被捕。

全部高級(jí)戰(zhàn)犯與多數(shù)被俘軍官、士兵一同收容在巢鴨監(jiān)獄。大戰(zhàn)犯一人獨(dú)居一室，其他戰(zhàn)犯二至六人同居一室。室內(nèi)衛(wèi)生由戰(zhàn)犯自己打掃，看上去倒也干凈整齊。

戰(zhàn)犯?jìng)兊纳畈坏豢?，而且安排得頗為舒適。他們的伙食，也是那些由于長(zhǎng)期的戰(zhàn)爭(zhēng)而導(dǎo)致物質(zhì)極度匱乏的日本百姓所無(wú)法享受到的。

每天早晨6時(shí)，美軍看守便拎著大串的鑰匙，稀哩嘩啦地開(kāi)門， 一面用生硬的日語(yǔ)催促戰(zhàn)犯起床：

“喂，東條英機(jī)，起來(lái)！”

“哎，土肥原賢二，起來(lái)！”

……

戰(zhàn)犯?jìng)兤鸫埠螅仁鞘?、入廁、打掃衛(wèi)生，然后在院內(nèi)做體操。做操時(shí)，有的只是敷衍了事，有的則又認(rèn)真又賣力。賀屋興宜和橋本欣五郎就是“體操迷”，哨音與響，他們總是最先跑到院子里。他們起床時(shí)懶洋洋的，一做完體操就來(lái)了精神。最怕做操的是前外相重光葵，因?yàn)樗挥幸粭l腿是真的，丟了手杖便站立不穩(wěn)。

做完操之后是開(kāi)飯。一日三餐，無(wú)論大將還是中尉、小隊(duì)長(zhǎng)，一律拿著自己的餐具在走廊里排隊(duì)，等候美國(guó)憲兵分配飯菜。軍界森嚴(yán)的等級(jí)制度，在這里已不復(fù)存在，大小戰(zhàn)犯頗有“同甘共苦”的味道。

早餐有粥、日本醬湯、煮雞蛋，以及葡萄干、糖棗等。每星期還有一次西餐，吃的是法國(guó)面包與咖啡牛奶，水果則是天天都有供應(yīng)。