石美瑜無(wú)法回答聽(tīng)眾席上眾人的責(zé)問(wèn)，當(dāng)即宣布退庭，與律師等人躲進(jìn)庭長(zhǎng)室。憤怒的記者們不顧憲兵的阻攔，擁進(jìn)庭長(zhǎng)室，紛紛向法庭提出抗議。然而事已定局，記者們的抗議只是徒勞。

岡村寧次事先曾聽(tīng)傳言，國(guó)民黨軍方以外有不少人主張判處無(wú)期徒刑，石美瑜曾擬判有期徒刑七年，他思想上已有服刑的準(zhǔn)備，不料結(jié)果竟判無(wú)罪，令他深感意外。他要求向庭長(zhǎng)致謝，但被拒絕會(huì)見(jiàn)。

這時(shí)，一位法庭副官對(duì)他低語(yǔ)：

“哎，先生還是乘此混亂之際，從后門(mén)走脫為妙?！?

岡村寧次這才恍然大悟，急忙與陪他來(lái)法庭的松岡從后門(mén)溜出，徒步返回寓所。

28日傍晚，軍事法庭一位副官來(lái)到岡村寧次“保外就醫(yī)”的寓所，通知他于次日早晨6時(shí)30分之前到戰(zhàn)犯監(jiān)獄集合，與獄中的戰(zhàn)犯同乘美國(guó)輪船回國(guó)。

原來(lái)，國(guó)民黨政府為使岡村寧次能搭乘美輪回國(guó)，特提前宣判。

30日上午10時(shí)，美輪從上海吳淞港起航。船駛出中國(guó)領(lǐng)海之后。東京廣播電臺(tái)就報(bào)道：

“在華全體日本戰(zhàn)犯正在返回日本途中?！?

與此同時(shí)，中國(guó)國(guó)內(nèi)因?qū)鍖幋伪卉娛路ㄍバ袩o(wú)罪一事陡起風(fēng)波。延安中共新華社發(fā)表文章，向國(guó)民黨政府提出抗議，遣責(zé)對(duì)岡村寧次的判決。并要求引渡岡村，以此作為維持國(guó)內(nèi)和平的條件之一。

當(dāng)時(shí)蔣介石已宣布下野。李宗仁代總統(tǒng)為爭(zhēng)取和平，下令重新逮捕岡村寧次。但上海警備司令湯恩伯卻將命令押壓不發(fā)。軍事法庭庭長(zhǎng)石美瑜考慮自己對(duì)此事負(fù)有直接責(zé)任，乘飛機(jī)到南京請(qǐng)示對(duì)策。李宗仁得知岡村寧次已乘船回國(guó)，便命令國(guó)民黨駐日本代表團(tuán)團(tuán)長(zhǎng)商震待船到日本后，將岡村寧次重新扣押。商震接到命令，前往駐日盟軍總司令部提出重新逮捕岡村的要求，被美軍方面拒絕。

當(dāng)天中午，盟軍總司令麥克阿瑟命令厚生省打破嚴(yán)禁懸掛日本國(guó)旗的禁令，破例在日本東京國(guó)立醫(yī)院懸掛國(guó)旗，向?qū)鍖幋伪硎疚縿?，并派肯尼中校前往醫(yī)院慰問(wèn)岡村寧次。

盟軍最高統(tǒng)帥與國(guó)民黨政府對(duì)岡村寧次施以如此特殊優(yōu)厚的待遇，令岡村本人大惑不解。直到翌年，蔣介石聘他為臺(tái)灣“革命實(shí)踐研究院”高級(jí)教官后，他才明白蔣公諸人的用心。