在輿論的煽動下，各省都督、紳商代表也紛紛致電南京臨時政府，對定都南京表示異議。就連一貫主張建都武昌的黎元洪，這時也改口支持北京定都，“以免釀成大患”。而南方革命軍中的許多將領如浙軍司令朱瑞、粵軍司令姚雨平、第一軍團長柏文蔚等也紛紛發(fā)表通電，主張臨時政府建在北京為妥。

孫中山接到電報后，心里倒是樂意袁世凱辭職不干，但他不能自作主張，于是便將袁世凱的電報交與臨時參議院討論。臨時參議院的議員們對定都南京一事也無甚決心，或許是他們認為孫中山的想法太天真，或者急于維系來之不易的和平，結果對于定都一事遲遲不能定案，最后只好用投票的方式來決定。

投票的結果出人意料，參議院以二十票的壓倒多數(shù)否決孫中山的主張（北京二十票，南京五票，武昌兩票，天津一票），而參與投票的議員大多數(shù)為同盟會員。孫中山得知這個結果后極為憤怒，據《胡漢民自傳》中稱，“先生（指孫）召克強（即黃興）至總統(tǒng)府，讓之?？藦娨嘀^黨中不應有異議。先生遂召集院中同志黃復生、李伯申、鄧家彥等為評言其得失，則皆唯唯。依參議院法，須政府再交議院，始能推翻原案。鄧、黃等以是請。克強遽曰：‘政府決不為此委曲之手續(xù)，議院自動的翻案，盡于今日；否則吾將以憲兵入院，縛所有同盟會會員去?！侨者m祭明孝陵，遂請先生上馬出府。余稱病不從行，而就府中草文書，交院再議；一面飛白先生”。

在黃興聲稱要率憲兵隊進參議院把所有同盟會籍的議員們綁縛起來及老會員吳玉章等人的疏通下，臨時參議院再次投票，最終以十九票對十七票的結果通過了以南京作為臨時政府地點的決議。不過，從這事可以看出，革命黨內部意見也不甚統(tǒng)一，在孫中山提出必須實現(xiàn)定都南京等三個條件的同一天（2月13日），革命黨人自辦的《民立報》發(fā)表了《建都私議》的社論，提出八大理由來論證首都宜建于北京。而在談到遷都問題時，廣西同盟會員馬君武懷疑宋教仁倒向袁世凱，出賣革命，于是對宋教仁“言語討伐”，爭執(zhí)中，宋教仁怒而打了馬君武一耳光，馬君武奮起還擊，重傷宋教仁左眼，也算是一段革命逸史。（胡漢民在《自傳》中云：“宋以是質馬，而亟批其左頰，馬還擊，傷宋目。宋入病院，旬日始愈?！保?/p>

袁世凱“退歸田園”的威脅并沒有動搖孫中山要袁世凱南下就職的決心，為促使袁世凱盡快到南京就職，孫中山派出以蔡元培為團長，劉冠雄、鈕永建、宋教仁、王正廷、汪精衛(wèi)等人為成員的專使團前往北京，迎接袁世凱南下。等專使團到北京后，袁世凱倒是給予了盛情招待，但對于南下就職一事則模棱兩可，只以“竭誠盡力，早日南行”相搪塞。

不料在專使團到達北京的第二天晚上（2月29日），城北突然傳來數(shù)聲炮響，隨即便是人喊馬嘶，大火熊熊，街道上突然冒出成群的大兵。這群人一路上呼呼喝喝，沿途縱火搶劫，有些亂兵還沖到專使團的住處，嚇得蔡元培等人慌忙逃到六國飯店避難，情狀極為狼狽。

第二天查明，發(fā)生兵變的是曹錕統(tǒng)制的北洋第三鎮(zhèn)，他們原本駐扎在北京城外，不知何故突然沖進城內，跑到東城和前門一帶大肆哄搶，一路焚燒，還跑到專使團所住的煤渣胡同胡鬧。到下半夜，兵變繼續(xù)擴大，西城、北城也發(fā)生騷亂，當?shù)氐耐练寺勶L而動，趁火打劫，而部分巡警也加入了搶劫的行列。等到清晨，被砸被搶的店鋪、錢莊、民居已經有數(shù)千家，還有幾百間房屋被焚燒，似乎是為了掩蓋搶劫的痕跡。

這次兵變，是不是袁世凱一手導演，目前還沒有確鑿證據。不過，坊間倒有個傳聞，說是袁世凱的長子袁克定曾找?guī)讉€北洋軍的將領商議，說如果家父南下就職的話，到時直隸都督就要由別人接手，屆時北洋軍恐怕要被裁撤一部分，對大家很是不利；要想不讓家父南下，首先是要把南方專使團給趕跑。曹錕等人聽后，大為惱火，便說：“這事也不難辦，只要我們讓弟兄們趁夜把專使團的住處圍一圍，放兩槍，把他們嚇跑就是?！痹硕ㄕf：“只要你們一鬧，到時就算專使團不跑，東交民巷的外交團也會出來抗議，屆時家父就走不成了。”