皇帝、后妃雖號稱“龍體”、“鳳身”，卻免不了“圣躬違和”、“鳳體欠安”。因此，供奉御藥的方式，也因保養(yǎng)“龍鳳之軀”的需要和病情的輕重緩急有所不同。

據(jù)清朝太醫(yī)院檔案記載：宮廷要求同仁堂每三個月進貨一次，這是“定時供奉”。所進藥材，必須是產(chǎn)地地道、挑選干凈的頂級藥材。丸散膏丹等成藥，必須按宮廷的處方工藝制造，要求質(zhì)效兼優(yōu)。

第二種供奉方式是“票傳交進”，每逢宮內(nèi)有特殊需要，如皇帝要出巡或游獵，御藥房會“票傳”同仁堂。同仁堂必須按照御藥房的要求，在指定時間內(nèi)備足所需藥品，送往御藥房或指定地點。清代檔案中就記載了乾隆四十八年（１７８３）秋季，乾隆赴熱河圍獵，需要帶咀片丸散等“隨圍藥物”。由于御藥房藥品不全，便“票傳”同仁堂，限期送到。傳票內(nèi)有細藥牛黃、冰片、麝香、朱砂、雄黃、犀角面等七種；有普通地道藥材二十七種，如茯苓、甘草、菊花、當歸、枳殼等。還有中成藥三十四種，如仙藥茶、藿香正氣丸、六味地黃丸、虎骨木瓜丸、麥味地黃丸等。傳票上每種藥的量都不是很大，如牛黃、冰片、麝香、朱砂、雄黃等，都是五錢，茯苓、蘇葉等普通藥材也都在一到兩斤之間，說明這些藥只是供皇帝等地位極高、極顯貴的人使用的。有意思的是，傳票中居然還有“西紙二刀、筆二支、墨一錠”，估計是供書寫病案或藥方之用。

在同仁堂將所有藥材全部交齊，一切辦備后形成的粘單上，有“存案可也”的批語，說明同仁堂已經(jīng)圓滿完成了任務，可以存案歸檔了。

“康乾盛世”之后，大清王朝逐漸走入了內(nèi)憂外患的衰落時期。道光二十一年（１８４１）正月，英國軍隊侵襲廣東沿海，沙角、大角炮臺陷落。正月初八，清政府對英宣戰(zhàn)。二月初五，虎門失陷，廣州門戶洞開。八月二十一日，英軍艦船攻破福建廈門，占據(jù)鼓浪嶼，然后又北進浙江。此時，道光皇帝卻躲在圓明園因心體疲憊、焦慮萬分，正急需同仁堂送去的藥品為他鎮(zhèn)驚安神，消除煩悶。從七月到九月，同仁堂按御藥房的要求，向圓明園藥房供給茯苓、當歸等藥材一百七十多味，共二百多斤。同仁堂的藥能治道光皇帝的病，道光皇帝卻拿不出對付外國入侵的良策。第二年，他簽下了中國歷史上第一個喪權辱國的不平等條約——《南京條約》。

供奉御藥的另一種方式，叫作“遴選藥味”。史有記載，同治九年（1870）十一月八日，同仁堂來了兩位御藥房的官員，一位是掌稿筆帖式廷璜，另一位是副庫掌德祥。他們對其他藥物都不感興趣，只看鹿茸。大查柜就叫伙計把上好鹿茸都拿來，請兩位官員挑選。不想他們看過后，竟埋怨起來：“你們這差是怎么當?shù)?？平日里就要你們備齊各種藥味，尤其是參茸之類的名貴藥材，說不定宮里什么時候就要?，F(xiàn)在，我們要的東西連你們同仁堂都沒有，辜負了兩宮皇太后和皇上對你們的恩澤，也害得我們沒法子交差了?！?/p>

大查柜一時摸不著頭腦，只好說：“不知宮里需要什么樣的鹿茸，我們可以去找。”

此言一出，兩位官員更生氣了：“到哪兒去找？誰不知道四月和七月才是鋸茸的時候，這會兒是十一月，哪里去找？欺侮我們不懂行是不是？”