阿拉伯民族復(fù)興主義者瓦哈比教派在阿拉伯半島的反抗，有助于阿里控制下的埃及進一步控制阿拉伯半島。瓦哈比教派興起于17、18世紀之交，創(chuàng)始人瓦哈比致力于神學(xué)和法學(xué)的研究，在巴格達接受了正規(guī)的伊斯蘭教教育，尊奉伊斯蘭著名教法學(xué)者艾哈邁德·伊本·罕百里的教義，立志改革伊斯蘭教中的弊端，在穆斯林中提倡生活的純潔性。他遭到鄉(xiāng)鄰們的排斥，被驅(qū)逐出境，后在一阿拉伯人酋長支持下建立了一塊奉行瓦哈比教義的統(tǒng)治區(qū)。瓦哈比及其后代被尊為這一地區(qū)的穆夫提（宗教領(lǐng)袖）。瓦哈比派的勢力后來發(fā)展到阿拉伯半島北部，占領(lǐng)了什葉派圣地卡爾巴拉、先知之城麥加以及麥地那。在麥地那定居的大批土耳其人被驅(qū)逐出境，整個漢志都落入瓦哈比派手中。阿里奉素丹之命同瓦哈比派作戰(zhàn)，經(jīng)過長達8 年的戰(zhàn)爭，于1818年打敗瓦哈比人，將瓦哈比派政權(quán)領(lǐng)袖處決，阿拉伯半島重新被土耳其人（實際上是埃及人）所控制。瓦哈比派的反抗并沒有結(jié)束，第一次世界大戰(zhàn)期間又發(fā)展起來，奠定了今日沙特阿拉伯的統(tǒng)治基礎(chǔ)。

素丹馬茂德不能容忍阿里勢力在埃及和敘利亞、阿拉伯地區(qū)的發(fā)展，但他多次策劃對阿里進行戰(zhàn)爭都被歐洲列強通過外交干預(yù)加以阻止。素丹還想冊封阿里為埃及的世襲統(tǒng)治者和敘利亞沿海省終身總督，以換得阿里放棄敘利亞內(nèi)地，遭到了阿里拒絕。素丹對阿里的強行進攻也遭到慘敗。

馬茂德去世后，新繼位的素丹為了改變土耳其人在歐洲的形象，開始進行憲政改革。雖然這種改革只是徒具其表，但畢竟暫時換取了歐洲人的輿論支持。于是，歐洲開始“幫助”土耳其人解決埃及問題。事實上，歐洲列強不希望在東方有一個強大的土耳其，也不希望在紅海地區(qū)看到一個強大的埃及—敘利亞聯(lián)合體，這將成為西方人通向印度之間的障礙。于是，在英國首相帕默斯頓勛爵的倡議下，英法俄奧四大國舉行了倫敦會議，締結(jié)了所謂“四國同盟”（1840年），決定四大國將盡力“保證土耳其的完整”，在必要時用武力強迫阿里放棄敘利亞。當素丹政府試圖進行又一次談判失敗后，素丹宣布阿里為國家的敵人，取消了他的各項職務(wù)和地位。同盟國的地中海艦隊，加上帝國政府的巡洋艦和運輸船在敘利亞海岸集結(jié)，向埃及發(fā)動了進攻。在黎巴嫩馬龍派①的支持下，盟軍圍困了貝魯特。埃及駐貝魯特的司令官蘇萊曼在給養(yǎng)用盡之后突圍，埃及軍隊完全失去了斗志。盟軍指揮查理斯·內(nèi)皮士爵士攻陷了阿克要塞；其后，盟軍艦隊出現(xiàn)在亞歷山大港，強迫阿里接受一項條約。根據(jù)條約，阿里答應(yīng)交還土耳其帝國艦隊并從敘利亞撤退。作為交換條件，這位海軍上將答應(yīng)保證阿里在埃及的世襲統(tǒng)治。這樣，阿里實際上在各大國控制下取得了在埃及實行統(tǒng)治的合法性，埃及實現(xiàn)了對奧斯曼帝國的真正分離。

埃及問題基本解決后，整頓敘利亞的困難任務(wù)落到了帝國政府肩上。由于歷史的原因，黎巴嫩的教派問題成為西方列強“關(guān)注”的熱點。在歐洲大國的壓力下，素丹同意黎巴嫩的伊斯蘭德魯茲派和基督教馬龍派分而治之。1842年，黎巴嫩被分成兩個行政區(qū)，分別由德魯茲派和馬龍派選出其代理人，稱為攝政。在兩種人雜居的地區(qū)，兩攝政各任命一個副手。由于各大國仍要德魯茲人賠償1842年戰(zhàn)亂造成的破壞，1845年內(nèi)戰(zhàn)重新爆發(fā)。帝國政府將雙方都解除了武裝，在兩個攝政之外另設(shè)一個有行政和司法權(quán)、由各階層居民代表組成的委員會。但西方列強并不滿足，他們繼續(xù)利用宗教和民族問題，進一步涉足奧斯曼事務(wù)。

首先是耶路撒冷問題，這是猶太教、基督教和伊斯蘭教共同尊為圣地的古老城市，有眾多的宗教派別。六個歷史悠久的基督教派別，即羅馬天主教（拉丁教派）、希臘教派（東正教）、亞美尼亞教派（聶斯脫利教）、敘利亞教派、哥普特教派（埃及一性派）和阿比西尼亞教派（一性教派），長期共存于土耳其地方政府的統(tǒng)治下。其中后三個教派因其勢力弱而求助于亞美尼亞教派的保護，亞美尼亞教派因其在東方金融界的實力而成為奧斯曼帝國所不能缺少的臂助。而希臘正教派在奧斯曼帝國內(nèi)數(shù)量上占優(yōu)勢（約1000萬人），加之受到俄國保護，其勢力大于其他教派。拉丁教派的神父大多是西班牙人和意大利人，享受著外交豁免權(quán)，并受到法國外交部的保護。各基督教派共同占有一所圣墓教堂，經(jīng)常為使用教堂問題而發(fā)生沖突斗毆，而且每每求助于當?shù)啬滤沽终畞聿脹Q，復(fù)活節(jié)期間常須有一個土耳其衛(wèi)兵在教堂中維持秩序。