由于第一次合同中有些問題沒有列入，中美在1944年秋天又補充簽訂了第二次合同。除了正式規(guī)定美國為軍統(tǒng)訓(xùn)練新式特務(wù)分子及供應(yīng)有關(guān)器材外，并答應(yīng)由軍統(tǒng)選派大特務(wù)40名分兩批赴美留學(xué)，為軍統(tǒng)培養(yǎng)出一批高級骨干分子。除來往旅費及制裝費由軍統(tǒng)負(fù)擔(dān)外，所有在美國受訓(xùn)時費用由美方供給，每人一萬美元。

在第二次合同中，規(guī)定美方供應(yīng)的武器、交通工具等在數(shù)量上均有增加。僅十輪卡車便增加到2000輛和全部維修設(shè)備，中小吉普增到120多輛，其他醫(yī)藥、電訊制造器材等也有所增加。而抗日戰(zhàn)爭結(jié)束后，“好心腸”的山姆大叔仍怕特務(wù)部隊屠殺中國人民的武器不夠用，又從沖繩等地送來3000噸各式武器給軍統(tǒng)，并海運至秦皇島。后來因戴笠死去，內(nèi)部爭權(quán)奪利，對這件事未即處理。蔣介石知道后，便全部撥交前往東北的新六軍軍長廖耀湘接收了。這批武器雖未送到軍統(tǒng)手中，卻同樣達到了以中國人用美國武器殺中國人的目的。美帝這一陰謀，實現(xiàn)得可謂是天衣無縫，梅樂斯也因此在幾年間由一個中校連續(xù)被提升到了準(zhǔn)將。

美帝對梅樂斯與戴笠的合作越來越重視，除了美國總統(tǒng)代表赫爾利到中美所視察過外，美帝第七艦隊司令柯克上將也前往視察，對該所工作極為滿意。戴笠更興高采烈，特意隆重設(shè)宴招待這位海軍上將，國民黨一些高級將領(lǐng)如程潛、張治中以及周至柔等都被邀作陪。由于梅爾斯在中國取得很大成績，美帝的其他特務(wù)機關(guān)便非常眼紅。杜諾萬到重慶時，曾與梅樂斯商談要他把一些有關(guān)情報分別供應(yīng)給陸軍方面和在華美軍高級將領(lǐng)。但是梅樂斯不同意，結(jié)果被杜諾萬把他扣留在美駐華大使館一天多，才放他出來。由于梅樂斯一向氣量狹小，受了這一打擊，竟弄得神經(jīng)失常，1945年春回美國醫(yī)治了幾個月，直到“二戰(zhàn)”快勝利時才病愈返回重慶。戴笠去世后，他也送去了挽聯(lián)和花圈，并親自到場表示哀悼。

如果說戴笠和梅樂斯的感情還是出于私人情誼，那么他對美國太平洋第七艦隊司令柯克的關(guān)系則更多的是借以利用。1946年初，戴笠還邀請柯克到北平一游，這是戴笠與柯克的最后一次見面。當(dāng)時柯克即將退休歸國，以美國海軍耆宿的地位，仍然不失為海軍界的紅人。