另外戴笠還要軍統(tǒng)局堅(jiān)決貫徹他提出的“裁弱留強(qiáng)，里外三百”意圖的同時(shí)，在內(nèi)部體制上減少指揮層次，下令撤消所有區(qū)一級(jí)的組織，恢復(fù)在省范圍內(nèi)以省站為最高指揮機(jī)關(guān)。原來(lái)歸屬區(qū)一級(jí)指揮的特務(wù)人員，在絕對(duì)保密的情況下全部轉(zhuǎn)入地下，不再以公開機(jī)關(guān)和任何名義作掩護(hù)。在此基礎(chǔ)上，戴笠迅速清理整頓軍統(tǒng)內(nèi)部的貪污受賄問(wèn)題，以免被蔣介石和政敵抓住口實(shí)。他指示毛人鳳成立一個(gè)財(cái)產(chǎn)清理委員會(huì)，自己也迅速到各地去清理財(cái)產(chǎn)。

蔣介石收到這份計(jì)劃的時(shí)候，心中還有一些疑問(wèn)。因?yàn)樗幌嘈糯黧視?huì)這么干脆地做出對(duì)他力量如此不利的削減。所以他表面上對(duì)戴笠的決定表示肯定，但是私底下卻派人繼續(xù)調(diào)查。這一查卻發(fā)現(xiàn)了諸多的疑點(diǎn)。

首先戴笠雖然削減了軍統(tǒng)局內(nèi)部的軍事部門，卻掌握了軍令部第二廳，把軍事情報(bào)、軍事稽查業(yè)務(wù)以及軍隊(duì)中各級(jí)諜報(bào)參謀方面的力量都撥歸進(jìn)去，全部抓到手中，成立軍事特工方面的獨(dú)立系統(tǒng)。

其次戴笠掌握了內(nèi)政部警政司，并將警政司擴(kuò)編為內(nèi)政部的警察總署，把軍統(tǒng)局原先主管的特工警察力量劃撥過(guò)去，形成警察行政業(yè)務(wù)與警察特工業(yè)務(wù)一把抓。

戴笠另外改編了忠義救國(guó)軍和軍統(tǒng)局的特務(wù)團(tuán)，再加上軍委會(huì)的別動(dòng)軍、交通警備司令部所屬的各團(tuán)、交通巡警總隊(duì)和軍統(tǒng)局掌握的部分國(guó)民黨稅警部隊(duì)，把約10萬(wàn)人組建成了交通警察總局。

盡管戴笠削減了各內(nèi)外勤機(jī)構(gòu)，但是他并沒有解散削減下來(lái)的人員，而是把這些人安插到各個(gè)司法行政部門，形成軍統(tǒng)化整為零后的基本力量。同時(shí)也成立了一個(gè)調(diào)查室，安頓下軍統(tǒng)局主腦部分的主腦部分。

最讓蔣介石氣憤的是戴笠竟然默許軍統(tǒng)內(nèi)部成立一個(gè)叫“警壇社”的秘密組織。而該組織成立的目的甚至是明確地表示要爭(zhēng)奪全國(guó)的警察大權(quán)。經(jīng)過(guò)這幾步計(jì)劃，軍統(tǒng)力量沒有被削弱，反而比原來(lái)還要更加強(qiáng)大。

這個(gè)消息傳到了蔣介石耳中，他沉默了很久，最后憤憤不平地說(shuō)：“這個(gè)戴科長(zhǎng)鬧昏頭了，他得明白他自己的位置。”