此時(shí)周恩來(lái)正好親臨前線(xiàn)，了解到惠州守軍工事堅(jiān)固，明暗火力點(diǎn)甚多，組成了嚴(yán)密的火網(wǎng)，我攻城部隊(duì)不僅火力分散，而且進(jìn)行四面包圍，使城內(nèi)守軍不拼死守城則無(wú)出路；陳明仁等拼死沖殺，只能徒增傷亡。他接到陳明仁的報(bào)告，認(rèn)為所述甚為有理，于是建議蔣介石，立即改變5點(diǎn)鐘攻城的計(jì)劃。蔣介石這才命令停止攻城，連夜召開(kāi)軍事會(huì)議。蔣介石同意周恩來(lái)的分析和建議，將攻擊東門(mén)浮橋和惠陽(yáng)縣的部隊(duì)撤出，集中炮火轟擊北門(mén)和西門(mén)的敵軍重要火力點(diǎn)。陳誠(chéng)指揮的炮兵連，用人將野炮扛到北門(mén)外，直接瞄準(zhǔn)，逼近射擊，掩護(hù)陳明仁等攻城部隊(duì)。周恩來(lái)還率領(lǐng)政工人員深入前線(xiàn)做政治思想鼓動(dòng)工作，使陳明仁等于14日下午4時(shí)，攻克惠州城。戰(zhàn)役結(jié)束第三天，蔣介石和周恩來(lái)，以及何應(yīng)欽、蘇聯(lián)顧問(wèn)鮑羅廷等參加慶功會(huì)，由蔣介石親發(fā)號(hào)令，吹三番號(hào)向首先登上城樓的陳明仁、陳賡等敬禮。陳明仁因戰(zhàn)功卓著，一年之內(nèi)，由少尉排長(zhǎng)晉升為中校營(yíng)長(zhǎng)。

陳明仁每回憶起這段往事，總忘不了周恩來(lái)對(duì)他的保護(hù)：“如不是周恩來(lái)認(rèn)為我的報(bào)告有理，勸告蔣介石糾正錯(cuò)誤的打法，并提出了正確的作戰(zhàn)方案，我陳明仁早已死在惠州城下了！”

抗戰(zhàn)中，陳明仁多次立功，升任中將軍長(zhǎng)。他前期一帆風(fēng)順，養(yǎng)成了剛愎自用的性格，得罪過(guò)不少人。蔣介石發(fā)動(dòng)全面內(nèi)戰(zhàn)，令他率部開(kāi)赴東北。1946年4月在進(jìn)攻四平街戰(zhàn)斗中，其八十七師大部在金山堡、大洼地區(qū)被解放軍殲滅。1947年5月，在增援懷德的途中，在大黑林子地區(qū)，其八十八師和九十一師被殲，陳率七十一軍殘部退守四平。四平是東北的交通樞紐之一，是國(guó)民黨的戰(zhàn)略要點(diǎn)，工事堅(jiān)固，防御體系完備。蔣介石下令死守該城。陳明仁忠實(shí)地執(zhí)行了蔣介石的命令，據(jù)守四平街。解放軍雖然很快突破了陳明仁軍部的核心陣地，活捉了警衛(wèi)團(tuán)長(zhǎng)、陳明仁的胞弟陳明信，解放了五分之三的四平，后因國(guó)民黨援軍趕到，解放軍只好撤了四平之圍。

陳明仁據(jù)守四平有功，一時(shí)成為英雄。蔣介石升任他為兵團(tuán)司令，授予青天白日勛章，要他到各地傳授經(jīng)驗(yàn)。陳明仁的軍功武運(yùn)達(dá)到登峰造極的程度。然而載譽(yù)成名的陳明仁很快招來(lái)了其他派系的忌恨。四平戰(zhàn)后，陳誠(chéng)曾組織一批人到四平現(xiàn)場(chǎng)參觀，其中也有美國(guó)軍官。當(dāng)美國(guó)人發(fā)現(xiàn)用整包美援面粉壘砌工事時(shí)，極為不滿(mǎn)，當(dāng)即向陳誠(chéng)提出抗議。對(duì)陳明仁素?zé)o好感的陳誠(chéng)，添油加醋地向蔣介石告了“御狀”，并建議蔣介石將陳明仁撤職查辦。蔣介石聽(tīng)從了陳誠(chéng)的話(huà)，但他還是給他的學(xué)生留了點(diǎn)面子：撤了陳明仁的兵團(tuán)司令職務(wù)，調(diào)為總統(tǒng)府中將參軍的閑差。