王選的苦悶始于1957年。這一年，大量中國最優(yōu)秀的知識分子被冠以“右派”的帽子，離開了他們熟悉的工作和生活，被發(fā)配各處，其中就有王選班里幾個最優(yōu)秀的同學(xué)。一年后，王選的父親王守其也遭此厄運。這讓王選倍感迷茫。

1958年，王選大學(xué)畢業(yè)了。何去何從？一個“右派”的兒子又有什么樣的自主權(quán)？就在這個節(jié)點上，中國計算機事業(yè)的飛速進步，終于把王選留在了北京，留在了北大。

新任命的中科院計算所籌委會主任華羅庚在全國各處尋覓，他正在急切地物色人才。與此同時，一批中國一流高校的數(shù)學(xué)系、電機系等相關(guān)學(xué)科的三年級學(xué)生在北京集合，中國第一屆計算機訓(xùn)練班開課，如此超常規(guī)的培訓(xùn)模式，表明了中國政府對計算機技術(shù)的高度重視。

在此前一年，中國政府向蘇聯(lián)訂購了M-3計算機和БЭСМ計算機圖紙資料，計算機的研制工作迅即展開。1958年8月1日，中國第一臺數(shù)字電子計算機——103機誕生，平均運算速度為每秒30次。經(jīng)改進配置了磁心存儲器，計算機的運算速度提高到每秒1800次。不久，104機的研制也告開始，這將是中國第一臺大型通用數(shù)字電子計算機，平均每秒運算一萬次，接近當(dāng)時英國、日本計算機的水平。這是國慶十周年的獻禮之作。在這個時候，計算機人才是多么寶貴。

王選就這樣留在了北京大學(xué)，他當(dāng)了一名助教，并立刻展示了他在計算機研究領(lǐng)域的才華。他成為了北大紅旗機研制的生力軍，正值三年自然災(zāi)害，吃不飽飯的王選一天天在透支自己的生命。

“1959—1961年研制紅旗機，玩命到不顧身體，經(jīng)常連續(xù)工作一天一夜，最緊張的時候40個小時不睡覺。有時錯過了吃飯時間，和同事一起到飯館，點了菜還沒上來，我已經(jīng)趴在桌子上睡著了。熬完通宵回到宿舍，坐在床上還沒解衣服，坐著就睡著了，等口水掉下來，醒了，再脫衣服躺下。如果同事有什么問題找我，都有這個經(jīng)驗，說你去叫醒王選，光叫他不行，一定要在旁邊看著他穿好全部衣服，才能離開，否則他很可能又睡著了……”

1961年，王選作出了他成年后的第二次抉擇：從硬件轉(zhuǎn)向軟件，但不放棄硬件，而是從事軟、硬件相結(jié)合的研究。

“1961年我從北大數(shù)字系計算機數(shù)學(xué)專業(yè)畢業(yè)已三年，一直在硬件第一線上跌爬滾打。當(dāng)時一些新的計算機給我的印象很深，于是我就老問自己，你為什么總是停留在欣賞別人成果上，自己怎么沒有創(chuàng)新？后來我才明白我不懂的是應(yīng)用，是軟件（當(dāng)時software這個詞還沒有出現(xiàn)，應(yīng)用當(dāng)時很大程度上就是軟件）。1961年我作出了一生中最重要的一個決定：從硬件轉(zhuǎn)向軟件，從事軟、硬件相結(jié)合的研究。我跨這一步時當(dāng)時在中國是第一個，在美國也不多。一旦有了軟、硬件兩個領(lǐng)域的基礎(chǔ)以后，忽然就有一種豁然開朗的感覺。所以我非常理解控制論的發(fā)明者維諾的這句話：在已經(jīng)建立起來的學(xué)科之間的無人空白區(qū)上去耕耘，最能取得豐盛的成果。”