羅瑞卿在毛澤東身邊工作十幾年，這種長期相處中點(diǎn)滴積累起來的密切關(guān)系，為工于心計的林彪所不能及。林彪認(rèn)為羅瑞卿越過他辦事，“晾”了他。盡管羅瑞卿曾多次給林彪?yún)R報與解釋，但還是不能避免林彪的猜忌和不滿。有一次，他對羅瑞卿說：“我們的威信不夠吧？因?yàn)槲覀儾皇悄喜鹆x的領(lǐng)導(dǎo)人?！边@個“我們”當(dāng)然不包括羅瑞卿，話中酸溜溜的味道，明顯針對曾任南昌起義總指揮的賀龍而發(fā)，也有他擔(dān)心失勢于毛澤東的試探。

林彪對羅瑞卿的猜忌和不滿，在1964年全軍大比武的練兵運(yùn)動中發(fā)展得更加嚴(yán)重了。羅瑞卿主持的全軍大比武搞得轟轟烈烈，毛澤東和其他黨和國家領(lǐng)導(dǎo)人觀摩了幾個軍區(qū)的比武匯報表演，給予高度評價，推動了全軍的練兵熱潮。大比武是賀龍、葉劍英領(lǐng)導(dǎo)與支持的，客觀上對林彪的空頭政治是個否定。林彪感到被冷落了。他在一張卡片上記下了對羅瑞卿的惱火，“大捧別人，大跟別人，回京后根本不見面?！屗鼋^”，“當(dāng)作又一彭黃也”。

林彪對付大比武的武器是“突出政治”。1964年底，林彪接連發(fā)表兩次講話，批評大比武沖擊了政治。1964年12月29日，林彪緊急召見總政領(lǐng)導(dǎo)人，提出“‘四個第一’不落實(shí)的問題”，并說這是“帶有全軍性的問題”。他強(qiáng)調(diào)指出，軍事訓(xùn)練“不應(yīng)沖擊政治，相反，政治可以沖擊一切”。中央軍委把林彪的講話整理成《林彪同志關(guān)于當(dāng)前部隊工作的指示》，毛澤東批示，“完全同意，照此執(zhí)行”。文件下發(fā)全軍，大比武停止。

羅瑞卿并非反對突出政治，只是作為實(shí)際工作者，他反對的是落實(shí)不到實(shí)際工作中去的空頭政治。他接受不了林彪對大比武的指責(zé)，認(rèn)為“1964年軍事訓(xùn)練工作是建國以來最好的一年”。針對林彪“政治可以沖擊一切”，他說，“這里是指必要的，不能亂沖一氣?！贬槍α直搿皦阂粔很娛掠?xùn)練”，他說，“不要一下偏到這邊，一下又偏到那邊”。針對林彪的“突出政治”，他說，“如果單純把政治搞好，別的都不好，垮下來，這種政治恐怕不能算政治好，是空頭政治，哪有這種政治！”林彪對羅瑞卿的這些話大為不滿，給他扣上反林和反對突出政治的帽子。

林彪對羅瑞卿猜忌的還有接班人的問題。1964年毛澤東提出培養(yǎng)接班人的問題，要求領(lǐng)導(dǎo)干部“每個人都要準(zhǔn)備接班人，還要有三線接班人”。羅瑞卿在就軍隊貫徹執(zhí)行干部新老交替工作向林彪?yún)R報時，講到有些老干部應(yīng)當(dāng)主動“讓賢”。林彪認(rèn)定是要他讓賢、讓權(quán)，對羅恨之入骨，決意要把羅瑞卿搞掉。

1965年，林彪顯得格外焦躁。他批評羅瑞卿通氣不夠，并就通氣作了五條規(guī)定。羅瑞卿按規(guī)定去匯報工作時，林彪常常以有病為由，推托不見。若羅有時直接去了，林彪又說對他搞突然襲擊。若羅一段時間不去，林彪則說是封鎖他。羅如果在請示完毛澤東或其他軍委副主席再給林匯報，林彪就不滿地說：“既然請示過了，何必再問我？”若真拿一些問題請示他，林彪又說：“這點(diǎn)小事也來找我，不是存心折磨我這個病人嗎？”這是對羅瑞卿施加壓力，想使羅就范。

林彪還經(jīng)常說些莫明其妙的話。一次他曾對羅瑞卿說：“你們可以放心呀，我林彪就是犯了錯誤，也不會連累你們，連我的妻子兒女也不會連累?！边@似乎表露出林彪對自己權(quán)力地位的擔(dān)心與由此產(chǎn)生的緊張不安。

林彪對羅瑞卿壓服無效，越發(fā)感到羅瑞卿對他的權(quán)力地位構(gòu)成了威脅，遂采取了惡毒的誣告手段來打倒羅瑞卿。葉群在中間起了火上澆油的極惡劣作用。

1965年5月，林彪手里就有了海軍政治部主任張秀川等寫的“揭發(fā)”羅瑞卿的材料。11月27日，林彪給李作鵬打電話，要李作鵬寫一個近年來海軍兩種思想斗爭的情況，要求在四個問題上寫明羅瑞卿的態(tài)度。李作鵬立即召集海軍副司令員王宏坤和張秀川合作寫了七千多字的材料，誣蔑羅瑞卿對海軍“懷有巨大的陰謀”，“有不可告人的目的”。