要查，蔣介石碰到的第一個困難是，孔祥熙不在國內(nèi)。1944年6月，孔祥熙被派赴美，出席國際貨幣基金世界銀行會議。他患有膀胱結(jié)石病，會后即留在美國治病。1945年4月10日，蔣介石致電在紐約的孔祥熙，指出在停售美金公債后，仍有1100萬余債券在繼續(xù)交易，應(yīng)予追繳，電稱：“擬查美金公債剩余部分有壹千壹百余萬元，預(yù)定戶在停售受，付價給券，不合手續(xù)，應(yīng)即將此壹千壹百余萬元之債券，飭令該行經(jīng)管人員負(fù)責(zé)，全數(shù)追繳歸還國庫，不得貽誤，并將追繳之確數(shù)呈報?！?4月11日，孔祥熙復(fù)電稱：“此事當(dāng)時經(jīng)過實情為何，弟不詳悉，已將鈞電轉(zhuǎn)主管局長迅剋遵辦，并嚴(yán)令責(zé)成負(fù)責(zé)，追繳齊全。俟弟病稍愈，即當(dāng)回國親自處理?！保ㄑ胄邪l(fā)行美金公債舞弊案抄件，1945年4月，臺北國史館館藏檔案）說“不詳悉”，不是不清楚，也不是很清楚，可進可退；至于“迅剋遵辦”，“嚴(yán)令責(zé)成”等語，都是老于官場的說法。

通過追查，蔣介石已經(jīng)初步掌握案情，但是，孔祥熙不回國，調(diào)查難以深入。4月14日，蔣介石日記云：“美金公債舞弊案已有頭緒，須待庸之病痊回國也。”接到孔的復(fù)電后， 蔣介石很失望，4月30日日記又云：“接庸之電，令人煩悶，痛苦不知所止?！薄爸醒脬y行問題甚難解決也”。中央銀行長期掌控在孔祥熙手中，其勢力盤根錯節(jié)，蔣介石已經(jīng)感到，美金公債舞弊案和中央銀行的問題比較棘手。

后來，蔣介石逐漸發(fā)現(xiàn)，有大量債券去向不明，曾經(jīng)在《日記》“雜錄”欄中記下了一組數(shù)字：“美金公債案；甲、各省市售出四千三百萬元。乙、國庫局交業(yè)務(wù)局五千四百萬。丙、預(yù)售戶有收據(jù)者只四千二百萬。丁、尚差數(shù)一千六百六十余萬元?！边@1660余萬美金公債的差額就是蔣介石要追查的地方。5月22日，蔣介石因中央銀行業(yè)務(wù)局的黃金舞弊案發(fā)現(xiàn)重大嫌疑，電召孔祥熙速回。