皇家田莊的宦官們見征稅大有甜頭，便紛紛私設(shè)征稅點。為此，1502年明中央政府明令禁止此惡行。

同時，征稅時暗中索取、罰款、強迫捐獻(xiàn)等事情也屢禁不止。

還有嚴(yán)苛的懲罰偷逃稅的措施，例如：稅收清單上的商品有一件沒有繳納稅款的話，清單上的所有商品都要雙倍繳納。而且征稅的隨意性也很大，稅如何征、哪些該減免完全由征稅官員做主。

此外，重復(fù)征收嚴(yán)重，例如從河西務(wù)到北京這一河段上就有三個收稅站。

明中央政府和皇帝本身為了某項事務(wù)，也往往強行向商家無端征稅，美其名曰“捐獻(xiàn)”。例如1465年都察院右僉都御史吳琛就建議對通州、徐州的船只征收“濟漕”費，也就是要求商家無償幫助官家的漕運。理由就是為了國防建設(shè)，“國”好了他們自然就好了。

明政府既然如此大規(guī)模、大幅度地征稅，那么，稅收成績肯定很好了。然而，從數(shù)字上看，商業(yè)稅并不多，例如1488年，全國的貨物稅和通行稅總計4600萬貫鈔。該年鈔和銀子的比價是1貫折合0.003兩，因此，折銀為13.8萬兩。

1544年，全國的貨物稅和通行稅總計5200萬貫鈔。該年鈔和銀子的比價是1貫折合0.005兩，因此，折銀為26萬兩。

然而，萬不可被假象迷惑。真實的稅收則遠(yuǎn)不止26萬兩。因為上述征稅的弊端，真正進(jìn)入中央財政的稅收不及真實稅收的十分之一。據(jù)黃仁宇先生估計，每年光在京杭大運河上運輸?shù)拿薏純r值就高達(dá)50萬兩。而棉布只是十種大宗商品中的一種而已，況且棉布與木材、食鹽、糧食等相比，其每年運送的數(shù)量要低得多。因此，全年實際上的商品貨物價值，估計1000萬兩是沒有問題的。那么，保守估計，每年僅貨物稅就可以征收33萬兩，比全國的商業(yè)稅收還要多，即使我們承認(rèn)十分之一這個數(shù)字，那么，其余十分之九的稅又跑到了誰的口袋里去了？

除了前面提到的政府（各級、各種權(quán)勢人物）的稅收盤剝外，商人中的官僚商人、與官員聯(lián)合的巨商富賈和走私者的偷稅行為，都是造成稅收不能進(jìn)入政府口袋的原因。

更為嚴(yán)重的是，走私經(jīng)濟下許多商人的財富在短時間內(nèi)膨脹，不但使稅收出現(xiàn)問題，更使“官斗不過吏，吏受制于商”這種現(xiàn)象成為常態(tài)。因為，官一般是外派的，而吏則是當(dāng)?shù)厝耍僖窍胱鍪轮荒芸坷?，而吏的收入則需要搜刮民脂民膏，這樣商人就在某種程度上成了吏的“老板”。到后來，商人甚至到了影響地方政局的地步，而這又加強了“白銀帝國”的負(fù)面因素，從而使晚明亡于商人的證據(jù)更加充分了。