隨著時光流逝，明政府日漸昏聵，加上北部邊關(guān)地區(qū)外患解除，一些朝堂精英開始受到貶黜，典型代表就是楊一清。楊一清從弘治十五年到正德元年的四年中，在弘治皇帝、兵部尚書劉大夏的支持下將陜西茶馬業(yè)搞得風風火火。例如，牧場由之前的6.6888萬頃增加到12.8473萬頃；馬匹由0.228萬匹增加到1.10871萬匹。通過茶馬貿(mào)易購入馬匹1.9077萬匹，在他離任之際，僅河州、西寧、洮州三個茶馬司還有存茶45萬多斤，陜西靈州池鹽的稅額由1.4337斤提高到5.9萬斤。

為此，正德元年（1506年）劉大夏奏請將陜西三鎮(zhèn)的所有軍務(wù)皆歸楊一清節(jié)制。然而，三年后的正德四年，楊一清在老上司劉大夏被捕入獄之后，因再次得罪劉瑾而入獄。雖經(jīng)大學士李東陽救助才免于一死，但自此陜西馬政陷入衰落。雖然隆慶年間的總督王崇古也是一位治世名臣，但幾經(jīng)努力馬匹仍不到8000匹。

茶葉走私在明初朱元璋時期就已經(jīng)出現(xiàn)過。例如在茶馬貿(mào)易中，明政府發(fā)現(xiàn)有些無良商人以假茶欺詐、以次充好坑害少數(shù)民族同胞，極為震怒。

朱元璋的本意就是利用茶葉貿(mào)易籠絡(luò)少數(shù)民族同胞，而某些商人卻為了自己的利益將他們推向了明政府的對手一邊。起初，明政府要求商人“以德經(jīng)商”，并頒布了相應(yīng)的法規(guī)。

少數(shù)民族處于相對落后狀態(tài)，他們對度量衡沒有認知。明政府認識到這一點后，正德十年終止了以蓖中馬進行貿(mào)易。蓖大則官虧，小則商家虧損，因此每1000斤定330蓖，以6斤4兩為準，其內(nèi)茶3斤，蓖繩3斤。因為少數(shù)民族不懂度量衡，明政府還制定了標準的茶包裝規(guī)格，統(tǒng)一包裝。

后見其效果不明顯，明朝的皇帝們才開始使用嚴刑酷法。為了巨額利潤，走私者也確實敢于踐踏一切。例如，有些商人賄賂官員以使自己在與少數(shù)民族發(fā)生貿(mào)易爭議中處于有利地位。為了牟利，他們還假扮少數(shù)民族人用劣馬換官茶。一些邊關(guān)將領(lǐng)、地方官員還將劣茶販賣給少數(shù)民族群眾。

因此，西部邊區(qū)百姓對茶馬貿(mào)易產(chǎn)生了極大抵觸情緒，北元殘余勢力開始借機尋求聯(lián)手。為了國防安全，明政府開始大規(guī)模地禁茶，除了四川、陜西的茶可以進行茶馬貿(mào)易外，其他產(chǎn)區(qū)的茶葉不準進行茶馬貿(mào)易。

其他產(chǎn)茶區(qū)的茶農(nóng)、茶商則開始以低價走私茶葉。少數(shù)民族各部落地區(qū)因為獲得了低價茶葉，自然不會積極進行官營茶馬貿(mào)易。因此，明政府換來的馬都是一些“瘦損”之馬，而且數(shù)量越來越少，即使有些地方政府將每匹馬提高到962斤茶葉都難以換到好馬。