這一方法可以普遍地應(yīng)用到一切主題之上，無(wú)論它們之間有什么差異：

我們一定不要以為某種知識(shí)比另一種知識(shí)更加晦暗不明，因?yàn)橐磺兄R(shí)都具有同樣徹底的性質(zhì)，都只是由自明之物的聯(lián)合構(gòu)成的。

笛卡兒的方法的普遍性在他出版于1637年的《談?wù)劮椒ā分械玫搅藦?qiáng)調(diào)：

只要我們不把假的當(dāng)成真的加以接受，并且一直遵守由此推彼的必然次序，就不會(huì)有什么東西遙遠(yuǎn)得我們根本無(wú)法達(dá)到，隱蔽得我們根本發(fā)現(xiàn)不了。

因此，在笛卡兒看來(lái)，一切知識(shí)都在于自明的直覺(jué)和必然的演繹。我們要把復(fù)雜的晦暗不明之物分解為簡(jiǎn)單自明之物，然后以有序的方式把產(chǎn)生的個(gè)體結(jié)合在一起。為了進(jìn)行認(rèn)識(shí)，我們必須把“簡(jiǎn)單性質(zhì)”、直覺(jué)對(duì)象隔離開(kāi)來(lái)，“以堅(jiān)定的心靈分別對(duì)它們加以審查”。然后，我們?cè)僖匝堇[之鏈把它們結(jié)合在一起。為了創(chuàng)立其他對(duì)象，這些簡(jiǎn)單性質(zhì)要結(jié)合起來(lái)，而整個(gè)人類知識(shí)就在于對(duì)這種結(jié)合方式的清楚知覺(jué)。

笛卡兒式的理性分析，還有一個(gè)更深的形而上學(xué)維度。在闡明獲得確定知識(shí)的過(guò)程中，笛卡兒認(rèn)為他所揭示的，是所有科學(xué)的統(tǒng)一性、知識(shí)的統(tǒng)一性。在他看來(lái)，這與思想自身的秩序、與認(rèn)識(shí)著的心靈的結(jié)構(gòu)完全相同。而且，這一思想秩序顯然被認(rèn)為反映了事物的秩序。在《原則》中，直覺(jué)與作為它們的對(duì)象相關(guān)物的簡(jiǎn)單性質(zhì)之間沒(méi)有缺口。在后來(lái)的《第一哲學(xué)沉思集》（1641）中，可能的徹底懷疑在觀念與物質(zhì)世界之間、在心靈結(jié)構(gòu)與它意欲認(rèn)識(shí)的實(shí)在結(jié)構(gòu)之間打開(kāi)了一個(gè)缺口。不過(guò)，借助于一個(gè)誠(chéng)實(shí)可靠的上帝，這一缺口得到閉合。一個(gè)個(gè)體心靈通過(guò)對(duì)思想性質(zhì)的反省，最終獲得上帝賦予和保證的普遍理性，從而獲得實(shí)在本身的結(jié)構(gòu)，因?yàn)楦鶕?jù)笛卡兒的理性主義，它與心靈的結(jié)構(gòu)等同。

理性與實(shí)在之間的這種同構(gòu)，因其建基于一個(gè)誠(chéng)實(shí)可靠的上帝，從而給了理性一種準(zhǔn)神性的品質(zhì)。理性是上帝灌注給人的神圣火光。這是把人的理性能力當(dāng)作神性的反映那一觀念在十七世紀(jì)的樣式，根據(jù)這種觀念，人是根據(jù)上帝的形象被造出來(lái)的。

笛卡兒的理性分析的另一個(gè)特征在這里至為關(guān)鍵，那就是它把他那心靈與物質(zhì)之間的對(duì)立聯(lián)結(jié)了起來(lái)。笛卡兒方法的基本單位是分離的、鋒利的和自足的心靈項(xiàng)目。這一點(diǎn)在他后來(lái)的著作中甚至變得更加明確。知識(shí)的工具是清楚的、邊界分明的心靈狀態(tài)，彼此之間完全分離：