杉田玄白既開批判中醫(yī)之頭，與之同時代的山脅東洋等名醫(yī)便進一步對古醫(yī)書中有關人體內臟說產生了懷疑，他們通過對尸體的解剖，深入證明了傳統(tǒng)中醫(yī)書中的許多錯誤，并由此得出了“實證第一”的結論。

山脅東洋認為：“理先而物后則上智者亦無所得，試物以載言雖下愚者亦可濟世?！睆氐讻_破了傳統(tǒng)中醫(yī)純思辨的陰陽五行論的束縛，為日本醫(yī)學界輸入了實證精神。

杉田玄白、山脅東洋手持手術刀，以解剖學理論向中醫(yī)發(fā)起攻擊：  

中醫(yī)既不究心于諸物之體，復不欲剖乎死人之身，一聆此說競發(fā)為慘夫，不知臟腑而治生人于死亡之地，不以為忍欲，識臟腑而借死身為生人之益，反以為慘，其持論不亦誤乎。且死人之身幾如蟬蛻，得殮者蟲蟻所營，暴體者犬鴉所食即得窀穸之安，亦屬腐爛之物，如解尸而以為慘，則剖心之戮凌遲之律、大辟之刑，中國不廢，與其棄擲坑窞，何如設立醫(yī)館，將此等重罪之死身交于其中，剖而視之，作醫(yī)術之證據(jù)。俾蒙目而射者，得開其目，迷途而行者，得返其途，治敗壞之鐘表者，修其外面而且得其內藏，則無用之腐體作大益于生人，不遠勝于棄尸也哉。

日本的醫(yī)學發(fā)展，也可以說是有兩個明顯的段落。第一是漢方醫(yī)時期。第二是西洋方醫(yī)時期。日本的中醫(yī)與西醫(yī)之爭，也經歷了漫長的大半個世紀。雖然一開始中醫(yī)占得上風，但最后競爭的結果，是“西學東漸”，西風壓倒了東風。　

凡新學派勃興之時，舊學派的反抗勢不能免，日本蘭方醫(yī)與漢方醫(yī)之間，屢次發(fā)生沖突，傳統(tǒng)漢學醫(yī)要求當局嚴禁西洋方醫(yī)，1849年，當時執(zhí)政者阿都伊勢守偏向中醫(yī)，發(fā)布《蘭方醫(yī)禁止令》。此令一出，勝利完全歸于舊派，一時蘭方醫(yī)大為窘迫。

然而，西醫(yī)大顯身手的時候馬上來了。1858年，日本霍亂流行，幕府將軍德川家定亦患此病，眾醫(yī)束手，堀田正篤等力排眾議，提議用西法治療，得閣老間野下總守之贊同，幕府于七月三日急遽發(fā)布《蘭方醫(yī)解禁令》，伊東玄樸等為將軍治病，并新任竹內玄同等西醫(yī)數(shù)人為官醫(yī)，唯此后蘭方醫(yī)遂得再起，各藩亦相繼解除禁令，西醫(yī)大起，壓倒中醫(yī)。

明治八年，日本政府發(fā)布醫(yī)師開業(yè)規(guī)則，提倡新派醫(yī)學，規(guī)則上面雖然不曾明白禁止?jié)h方醫(yī)，但嚴行限制，只準舊有者繼續(xù)行醫(yī)，不能新添，而且考試科目也漸加嚴，所以明治十六年以后漢方醫(yī)可以說是無復活路。

以荷蘭醫(yī)學，排斥傳統(tǒng)中醫(yī)，開“洋才”先河——日本知識界在思想和行動上開始出現(xiàn)脫離“漢才”的趨向，1775年，杉田玄白繼譯刊《解體新書》后，又著《狂醫(yī)之言》、《蘭學事始》，初步否定了古來流行的“中國中心論”，形成了“西洋文明中心觀”。

他說：“地者，一大球，萬國分布，所居皆中，任何一國皆可為中土，支那亦東海一隅之小國也?！?/p>

在他的文化世界觀念里，中國已經不再是文明的中心，崇拜“漢才”的天平已逐漸向“洋才”傾斜。

十八世紀中葉，日本這種以“西醫(yī)壓倒中醫(yī)”為開端的對“漢才”的懷疑和批判，延續(xù)到十九世紀中葉鴉片戰(zhàn)爭。這場中英之戰(zhàn)，驗出堅守“漢才”的清國“含金總量”，戰(zhàn)爭的結果，漢才完敗于洋才，日本舉國震驚，天朝的形象開始崩潰。那種松動終于變成震動，排斥漢才也終于由醫(yī)學到政治，從局部到全面。