第二科為情報科，負責搜集情報，掌握敵情，對敵方的偵控機構(gòu)進行反間諜工作。

陳賡為科長。那時，陳賡化名王庸，人稱“王先生”。

第三科為行動科，負責打擊對中共中央機關(guān)構(gòu)成威脅的叛徒、特務(wù)，負責中共中央機關(guān)的安全工作。實際上就是原先的“紅隊”。以顧順章為科長。

第四科為交通科，主要任務(wù)是保障上海及全國各地秘密交通網(wǎng)的正常運行，也負責中共中央的地下無線電臺的報務(wù)工作?？崎L為李強。

其中，第二科建立后，便開展反間諜工作。在1928年，楊登瀛便成了第一個中共特工。楊登瀛，又名鮑君甫，他是陳立夫的親信，是國民黨中央駐上海的特派員。他為中共提供了大量機密情報。

緊接著，在1929年底，第二科又派出三員干將，潛入國民黨高級特務(wù)機關(guān)。這三名干將便是李克農(nóng)、錢壯飛和胡底。內(nèi)中，錢壯飛擔任了國民黨中央組織部黨務(wù)調(diào)查科主任徐恩曾的機要秘書。

在顧順章叛變的千鈞一發(fā)的關(guān)頭，正是錢壯飛發(fā)揮了重要作用，才使中共避免了重大損失。

顧順章叛變后，中共急令錢壯飛以及李克農(nóng)、胡底，還有陳賡，立即撤離上海。主管情報工作的周恩來著手重整特別委員會。

周恩來點將，調(diào)來陳云主持特別委員會。在新的特別委員會會議上，周恩來宣布，由陳云、康生、潘漢年三人領(lǐng)導(dǎo)，陳云負總責，康生為副。

周恩來還宣布：

陳云兼一科科長，直接領(lǐng)導(dǎo)總務(wù)、財務(wù)、交通等工作；