百般無奈之下，連蔣介石自己也在日記中寫道，“很想能扭轉(zhuǎn)危局，但環(huán)境如此惡劣，包袱又太重，自然是非常艱苦”，“念大勢憂心如焚，幾乎不知人生有何意義矣，悒郁悶損莫可言狀”。

但是為了穩(wěn)定軍心，蔣介石還是表達(dá)出強硬立場，強調(diào)自己雖然已下野，但仍是“革命領(lǐng)袖”，對革命軍隊擁有無上權(quán)力，與是否是總統(tǒng)無關(guān)，他也“決不放棄革命領(lǐng)袖之職責(zé)與權(quán)力，無論軍政，必盡我監(jiān)督與指導(dǎo)之職責(zé)，任何人亦不能加以違抗也”。

不過蔣介石之前對陳誠若有似無的不信賴，似乎在抵臺后出現(xiàn)轉(zhuǎn)機(jī)，當(dāng)時蔣經(jīng)國重申，對陳誠治臺不表樂觀，認(rèn)為臺灣危機(jī)四伏，不早日改進(jìn)恐將發(fā)生動亂，“陳誠先生恐難負(fù)治臺之重任”，因此建議以俞大猷取代陳誠。不過蔣介石并未多做回應(yīng)，反而在返回臺北召開東南軍事會議后，委托陳誠接任東南軍事長官職務(wù)。

此外，此時為調(diào)解李宗仁與蔣介石的矛盾，挽救國民黨在廣州岌岌可危的局勢，于右任、閻錫山、吳鐵城、朱家驊、陳立夫五人銜命來臺，前往高雄等地請示蔣介石意見，這番大陣仗迎駕才讓蔣介石在臺灣駐留的消息曝了光。不過蔣介石對此并未立即回應(yīng)，因為如何處理美國政府的負(fù)面態(tài)度，才是蔣介石真正的燙手山芋。

美方早已打算棄蔣，改與中共發(fā)展正式關(guān)系，主張臺灣地位未定或聯(lián)合國托管者也不在少數(shù)；人在西子灣的蔣介石可說如風(fēng)中殘燭，一日數(shù)驚，據(jù)說在西子灣停留的這幾天中，還接到宋美齡兩封來信，都在警告他留意美方可能強占臺灣。極度憂慮的蔣介石除特地在6 月17 日召見王世杰，商議臺灣處境與美方態(tài)度，更在6 月18 日日記寫道：“余必死守臺灣，確保領(lǐng)土，盡我國民天職”。

但當(dāng)時兩岸風(fēng)聲鶴唳，麥克阿瑟【7】等駐日盟軍高級將領(lǐng)更由于擔(dān)心蔣介石守不住臺灣，被解放軍占領(lǐng)，因此由盟軍總部參謀長阿蒙德草擬了一個將臺灣暫時移交給盟軍總部或聯(lián)合國監(jiān)管的計劃，并告知國民政府駐日軍事代表團(tuán)。

6 月20 日，蔣介石接獲正式信息，立刻通過駐日本東京代表團(tuán)團(tuán)長朱世明聯(lián)系麥克阿瑟，強調(diào)暫管違反中國國民心理，“絕對無法接受”，更與中國在開羅會議堅持爭回臺澎主權(quán)的立場完全相反。他也堅稱，決心與中共作持久戰(zhàn)，國民政府亦決不會成為流亡政府，因此希望麥克阿瑟協(xié)助說服美國政府確保臺灣，中共新政權(quán)同時勸阻托管行動。懷抱著未卜的心情，1949 年6 月21 日下午，蔣介石與蔣經(jīng)國一同搭機(jī)離開岡山，當(dāng)晚抵達(dá)桃園大溪暫歇，之后再轉(zhuǎn)到臺北草山行館居住，暫時結(jié)束了這一段在南臺灣低迷蕭條的日子。