然而，北京政變的局勢(shì)很快就惡化了。奉軍張作霖不守諾言，拋開(kāi)政變前與馮玉祥“保證奉軍不入關(guān)”的君子協(xié)定，待曹錕、吳佩孚一倒臺(tái)，就揮兵入關(guān)。馮玉祥考慮到孫中山先生來(lái)京還需要一段時(shí)間，又錯(cuò)誤地先請(qǐng)段祺瑞出面維持，段祺瑞輕而易舉地奪取了“中華民國(guó)”臨時(shí)執(zhí)政的寶座，形成了一個(gè)以段祺瑞為首，段、張、馮聯(lián)合政府。

上臺(tái)后，段祺瑞野心不改，不顧全國(guó)人民的反對(duì)，宣布維持帝國(guó)主義在中國(guó)的特權(quán)，并與駐京的各國(guó)公使勾結(jié)起來(lái)，反對(duì)孫中山北上。段祺瑞、張作霖還聯(lián)合排斥馮玉祥，迫于無(wú)奈，11月24日，馮玉祥通電下野。1925年1月13日，被逼無(wú)奈的馮玉祥就任西北邊防督辦一職。為再助馮玉祥一臂之力，2月15日，《京報(bào)》增發(fā)附刊《西北周刊》，創(chuàng)刊號(hào)上刊登馮玉祥贈(zèng)送邵飄萍的照片，刊名下署“西北邊防督辦”。周刊頭版刊登邵飄萍的文章《開(kāi)發(fā)西北之重要關(guān)系》，文章開(kāi)門(mén)見(jiàn)山地稱(chēng)，本刊發(fā)行之目的，在于開(kāi)發(fā)西北，欲圖西北之開(kāi)發(fā)，不可不先引起國(guó)內(nèi)注意西北問(wèn)題，共同討論，以供邊防當(dāng)局之參考。文章還論述了開(kāi)發(fā)西北的重要意義，指出可以鞏固國(guó)防、減除兵患。

邵飄萍對(duì)土匪出身的張作霖歷來(lái)沒(méi)有好感。1918年張作霖在秦皇島搶劫了北洋政府向日本訂購(gòu)的一萬(wàn)七千支步槍?zhuān)瑫r(shí)為《申報(bào)》記者的邵飄萍迅速發(fā)表文章揭露張作霖，將張搶劫槍支的行為與其土匪出身聯(lián)系起來(lái)，陳詞尖銳，全國(guó)嘩然，張作霖十分難堪，耿耿于懷，一直在尋找機(jī)會(huì)報(bào)復(fù)。對(duì)于軍閥的禍國(guó)殃民，邵飄萍深?lèi)和唇^，經(jīng)常在《京報(bào)》上公開(kāi)指責(zé)奉系軍閥張作霖。

政府的腐敗無(wú)能和革命形勢(shì)的向好發(fā)展，使得政府軍中的一些高級(jí)將領(lǐng)不斷反戈政府，投身革命。奉系軍閥中郭松齡效仿馮玉祥將軍，宣布與國(guó)民軍結(jié)合，改稱(chēng)所屬為東北國(guó)民軍，討伐張作霖。1925年10月，郭松齡獲悉張作霖打算承認(rèn)賣(mài)國(guó)賊袁世凱都不敢完全兌現(xiàn)的“二十一條”為條件，來(lái)?yè)Q取日本大量軍火進(jìn)攻馮玉祥的國(guó)民軍。郭松齡大為震驚，正好當(dāng)時(shí)張作霖委托他去天津成立第三方面軍司令部，統(tǒng)轄三個(gè)軍，郭松齡充分利用這次組建司令部的機(jī)會(huì)，調(diào)配人員，安插心腹，為將來(lái)的倒戈張作霖作了相應(yīng)的準(zhǔn)備。當(dāng)邵飄萍從秘密渠道獲悉郭松齡有倒戈張作霖之意，特意發(fā)表很多贊揚(yáng)郭將軍的文章，甚至不斷做工作。

在與郭松齡的交往中，邵飄萍主動(dòng)宣傳國(guó)民革命的形勢(shì)，曉之以理，動(dòng)之以情，促使郭早日與張作霖決裂。邵飄萍還在馮玉祥和郭松齡兩位將軍中穿針引線，密傳情報(bào)。邵飄萍經(jīng)常派其助手祝文秀秘密送遞文件，往返于京津、東北等地。有次祝文秀往東北奉天送信，剛下車(chē)就發(fā)現(xiàn)有人在把關(guān)搜查，祝文秀那天穿得很漂亮。出站時(shí)，裝出一副貴婦人的派頭，一邊等候搜查，一邊拿出小粉盒子，對(duì)著里面的小鏡子給自己涂脂抹粉，其實(shí)那封秘密信件就放在粉盒的夾層里，幾個(gè)搜查的人朝她看了幾下，不知道她的來(lái)頭，問(wèn)也不敢問(wèn)就放她過(guò)去了。祝文秀就是通過(guò)這樣與北洋軍閥斗智斗勇，往返于京津之間，為馮玉祥和郭松齡傳送密件。