一次，程瑞芳設(shè)法從企圖強(qiáng)奸的日本兵手下救走一個女孩，那個女孩所在的地方就像學(xué)院其他地方一樣，地上到處是排泄物。在掙扎中，她的衣服上也沾滿了污穢，導(dǎo)致那名日本兵對她的興致轉(zhuǎn)瞬沒了大半。

那個時代的絕望處境使得中國人和外國人都做出了一些在今天看來很難被接受的決定。12 月23 日，程瑞芳看見一個女孩在被幾個日本兵輪奸后被抬了回來，傷勢嚴(yán)重，連路都走不了。程瑞芳在日記中寫道：“將來南京的雜種還不少呢，可恨! 可恨!”第二天，她見一個日本軍官帶著幾名中國人過來找妓女。明妮·魏特琳跟他們達(dá)成了一個交易，在圣誕夜，為了保護(hù)“良民女子”，她同意日本軍官去搜尋妓女。最終，他們找到了21 個。程瑞芳是這樣想的，如果妓女們被帶出學(xué)院，那這些日本兵就不會進(jìn)來強(qiáng)奸“良民女子”了。這看上去“也有道理”。除了對妓女們做出的不人道行為之外，她所謂的“也有道理”基于一個假設(shè)，那就是日本人還不至于到喪心病狂的地步。到圣誕夜時，拉貝家的花園里也有約600 人露宿。拉貝告訴程瑞芳那天是圣誕節(jié)，程瑞芳回答說就像“在地獄里過節(jié)”。

國際安全區(qū)委員會和他們的中國同事站在同一陣線，但他們之間的關(guān)系也同樣緊張，這或許與那幾周歇斯底里的氛圍有關(guān)。在開始那幾天，日本兵一再對房子和大樓進(jìn)行突擊檢查，順走香煙、白酒和食品，甚至學(xué)院動物科學(xué)實驗室里飼養(yǎng)的小雞也未能幸免于難。程瑞芳苦笑著記錄道：“不但拿此地的東西，連國際委員會的酒和香煙也拿去了。國際委員會這次失面子。先前他們怕我軍搶，想日軍是很好的，開會時總是這樣說，現(xiàn)在覺得不對，（日本人）連安全區(qū)都不承認(rèn)?！睂υS多中國人來說，西方人是盟友，但他們彼此看待時還是帶有等級觀念，這為他們的關(guān)系蒙上了陰影。西方人一直認(rèn)為日本人比中國人更嚴(yán)謹(jǐn)有序，因此當(dāng)委員會被日本人巧取豪奪時，程瑞芳卻大感欣慰也是可以理解的。

暴行的肆虐似乎沒有減弱。就在圣誕節(jié)后，日本人搭建了一座展臺，號召中國士兵自己站出來坦白，并說如果他們這樣做了，就不會傷害他們，但如果以后被發(fā)現(xiàn)，他們會被立刻處死。超過200 名中國士兵站了出來，可他們馬上就被殺害了。接著再沒有人敢站出來坦白了，但日本人依然將那些有嫌疑的年輕男子圍住。一些女難民被要求出來指認(rèn)他們：如果這些男人被認(rèn)出是她們的親戚，他們將被釋放，而那些“沒人認(rèn)領(lǐng)的將被帶走”處死。程瑞芳記錄道：“有一個老太太有膽量，出來認(rèn)了3 個人，其實她不認(rèn)得他們，她就是要救他們。有一個年輕女子也出來認(rèn)她的哥哥，回到里面換件衣服又出來認(rèn)她的親戚，此人真可佩?！睅滋旌?，程瑞芳記述了他的同事魏師傅被從南京下關(guān)區(qū)帶回的消息，她寫道：“他拖去的那一天，下關(guān)那一帶路上沒有路走，走在死人身上，他所有看見的事都是驚人，所以他駭死了！”

安全區(qū)委員會的成員們在事件的記錄上都非常盡責(zé)。他們知道，自己是這次重大戰(zhàn)爭罪行唯一的第三方見證者。他們必須做詳細(xì)的記錄，因為再無其他人能夠完成這件事了。事實上，他們中有些人后來被召喚到“東京審判”中作證。盡管沒幾個中國人有那份魄力記下當(dāng)時的情景，但所有民眾都見證了南京城這恐怖的一幕。戰(zhàn)后，在東京開庭的遠(yuǎn)東國際軍事法庭在判決中是這樣描述那幾周所發(fā)生的一切的：

同時，還發(fā)生了許多起強(qiáng)奸。中國女性或者試圖保護(hù)她的家人，只要稍有反抗，就立刻會被殺死。甚至城中大量未成年的女孩和老年婦女，都被強(qiáng)奸。在強(qiáng)奸過程中，還發(fā)生了多起變態(tài)和虐待行為。許多婦女在強(qiáng)奸后被殺，她們的尸體被燒毀。