從那時(shí)起，參與曼哈頓計(jì)劃的官員和科學(xué)家就分為兩派，一派支持原子彈制成后投入使用，另一派則表示對(duì)這種想法很恐懼。這種分歧并不只存在于軍人和文職人員之間，愛德華?泰勒一開始就堅(jiān)持走強(qiáng)硬路線，而最初就主張禁止使用核武器的卻是核物理學(xué)家們。甚至在德國已有原子彈的傳說還未澄清以前，他們中的一些人就已深信美國應(yīng)該與世界科學(xué)家們分享這個(gè)新發(fā)現(xiàn)。在他們的催促下，1944年8月26日下午4點(diǎn)，尼爾斯?玻爾拜訪總統(tǒng)，討論這一問題。派玻爾完成這件事其實(shí)并不是一個(gè)明智的選擇，因?yàn)樗軉??？偨y(tǒng)的時(shí)間本就寶貴，他卻啰唆了一個(gè)半小時(shí)才進(jìn)入正題。無論如何，羅斯福并未同意玻爾的意見，就把他送走了。然后，玻爾向丘吉爾求助，丘吉爾聽他講了半個(gè)小時(shí)后，生氣地向帶他進(jìn)來的查韋爾勛爵問道：“他到底在說什么？政治還是物理？”

其實(shí)他兩方面都談了。很多（或許是大多數(shù)）科學(xué)家們都認(rèn)為，制造原子彈對(duì)全人類來說都要求道德責(zé)任。應(yīng)對(duì)希特勒所擁有的炸彈是一回事，應(yīng)對(duì)日本人是另一回事。1945年的日本在物理學(xué)理論和科技方面并不先進(jìn)，所以他們爭(zhēng)論說：既然日本人自己不可能制造出這樣的武器，美國人就不該用這樣的武器攻擊他們。這個(gè)問題的提出就把政治和物理提升到了科學(xué)治國的高度。這種情況史無前例，而且在戰(zhàn)爭(zhēng)期間，特別是太平洋上正在進(jìn)行毀滅性空襲期間，思考這類問題確實(shí)不是個(gè)好時(shí)機(jī)。亞歷山大?薩克斯作為一名使者，比玻爾要強(qiáng)些。他是總統(tǒng)的好朋友，5年前，就是他說服總統(tǒng)啟動(dòng)了這個(gè)20億美元的研究。薩克斯現(xiàn)在和玻爾的意見一致。于是，1944年12月，他去白宮拜訪了總統(tǒng)。據(jù)說，他與總統(tǒng)談了很久，內(nèi)容就不得而知了。羅斯?？偨y(tǒng)去世后，薩克斯說，總統(tǒng)同意：如果試驗(yàn)成功，就應(yīng)邀請(qǐng)同盟國和中立國的科學(xué)家們共同進(jìn)行第二次試驗(yàn)，并應(yīng)就核武器所產(chǎn)生的影響寫一份詳細(xì)的報(bào)告，供同盟國和中立國科學(xué)家們傳閱；迫使敵人撤離指定區(qū)域，向敵人展示原子彈的威力，之后給他們最后一次機(jī)會(huì)，如果還不投降，那就即刻殲滅。

一年后，薩克斯將這份非同尋常的備忘錄上交給了新任戰(zhàn)爭(zhēng)部長羅伯特?帕丁森。但羅斯福并沒有在上面簽字，而且這次談話沒有任何在場(chǎng)證人。前任戰(zhàn)爭(zhēng)部長史汀生是羅斯福關(guān)于X計(jì)劃（史汀生總把曼哈頓計(jì)劃稱為X計(jì)劃）的聯(lián)絡(luò)人，但他從未向史汀生提及此事。