此前，蔣在同宋子文、熊式輝一次談話時(shí)雖曾表示：“如果余得如愿下野，則決以在野之身，力護(hù)繼此而成之政府，以求國(guó)基之鞏固，一反汪、胡平素惡習(xí)，而倡導(dǎo)守法之美風(fēng)。天下興亡，匹夫有責(zé)。誰(shuí)謂在野不能報(bào)國(guó)哉?！?但蔣的行動(dòng)卻完全是另一回事，處處給孫科出難題，設(shè)置障礙，逼其倒臺(tái)。在蔣的授意下，“蔣方人物對(duì)時(shí)局均持冷靜態(tài)度，除赴浙者外，在京各委均緘默?！?當(dāng)蔣接陳果夫電，得知“我方留京同志開(kāi)會(huì)多不出席，侄等去留應(yīng)請(qǐng)指示”后，即復(fù)電陳“請(qǐng)?jiān)诰┤棠蛷氖隆保?又電宋子文告以“此時(shí)我方當(dāng)設(shè)法促成各方攻粵為惟一工作”。 蔣的親信劉峙亦電朱紹良表示：“此時(shí)我輩似宜以介公之心為心，暫時(shí)緘默，以觀大局之推移。” 對(duì)于黃埔軍校的動(dòng)向，蔣介石更是相當(dāng)關(guān)注，一旦涉及有關(guān)黃埔軍校的人事安排，蔣毫不遲疑，積極部署。1月9日，當(dāng)蔣得知張治中擬借口養(yǎng)病準(zhǔn)備離京，立即急電張“切不可離去軍校，當(dāng)在京養(yǎng)疴”，并同時(shí)電何應(yīng)欽告以“軍校如改校長(zhǎng)，請(qǐng)速委任文白（張治中）。勿延”。 經(jīng)過(guò)上述布置，最終導(dǎo)致孫科內(nèi)閣上臺(tái)不到一個(gè)月就垮臺(tái)了。

第三次下野時(shí)，蔣介石的布置幾乎如出一轍。此時(shí)，他最需要重新規(guī)劃的是尚未失守的東南沿海各省。1月21日，就在蔣介石下野的當(dāng)天，正式接受宋子文的請(qǐng)辭，任命薛岳為廣東省政府主席、余漢謀為廣州綏靖主任、張發(fā)奎為海南特區(qū)行政長(zhǎng)官。同時(shí)任命張群為重慶綏靖主任、朱紹良為福建省政府主席兼綏靖主任、方天為江西省政府主席、湯恩伯為京滬警備總司令，陳誠(chéng)兼任臺(tái)灣省警備總司令。

蔣介石的上述任命都是經(jīng)過(guò)深思熟慮的。為了同桂系抗衡，他不得不重用與桂系矛盾重重的粵軍將領(lǐng)。這樣一來(lái)，原擔(dān)任廣東省政府主席、廣州綏靖公署主任的宋子文不得不讓位。其原因主要是粵軍將領(lǐng)地域觀念極重，始終未將宋子文看作是廣東人，甚至當(dāng)宋子文1948年出任廣東省主席時(shí)，張發(fā)奎還抱怨道：“惟今后粵政必須由粵人自己來(lái)搞，斷非老宋可以為功。實(shí)際上二十年來(lái)的革命功業(yè)，就是靠廣東人打出來(lái)的，現(xiàn)在廣東人不但不能打理自己的家事，反而要仰承老宋的鼻息，殊為粵人之恥。” 此后，薛岳、余漢謀、張發(fā)奎三名粵籍將領(lǐng)再次為蔣效命，直到海南島解放后才退守臺(tái)灣。

同樣對(duì)福建省政府主席的人選，也令蔣介石大費(fèi)心思。1月12日，蔣還在日記中寫道：“閩省主席人選實(shí)難在閩人中選得其人為苦?！倍藭r(shí)只有朱紹良是蔣身邊少有的親信又是在福州出生長(zhǎng)大的人選。

此時(shí)，除了完全聽(tīng)命于蔣的湯恩伯和陳誠(chéng)外，蔣介石所能指揮的主力部隊(duì)只有遠(yuǎn)在西南的胡宗南部。為了加強(qiáng)對(duì)西南的指導(dǎo)，蔣任命四川人張群駐守西南重慶、成都，直到胡宗南所部被殲后才離開(kāi)大陸。

黃埔2期畢業(yè)的方天原是陳誠(chéng)部屬、18軍第五任軍長(zhǎng)，他在江西省政府主席任內(nèi)的最大功勞，就是協(xié)助18軍第七任軍長(zhǎng)胡璉在江西招募新兵，重建第12兵團(tuán)（轄18軍）。正是胡璉帶著這支新組建的部隊(duì)，一路后撤至廣東潮汕，并轉(zhuǎn)戰(zhàn)金門古寧頭。蔣介石對(duì)此戰(zhàn)給予高度評(píng)價(jià)：“古寧頭大捷，不僅保住了金門，更保住了臺(tái)灣?！?/p>

事實(shí)上在第三次下野之時(shí)，蔣介石已清楚地判斷很難與中共達(dá)成任何和解，只是想透過(guò)桂系與中共的和談來(lái)拖延時(shí)間，加緊布置。特別是對(duì)臺(tái)灣的規(guī)劃。1949年1月10日，他特意派蔣經(jīng)國(guó)到上海，親自督促中央銀行總裁俞鴻鈞將中央銀行庫(kù)存黃金運(yùn)存臺(tái)灣。除了黃金以外，所有外匯也不留給代總統(tǒng)李宗仁。15日，他再次指示俞鴻鈞“中央、中國(guó)兩銀行外匯處理要旨，總勿使兩行外匯為后來(lái)者消耗于無(wú)形，略為國(guó)家與人民保留此一線生計(jì)耳?！?此外，他還指示將前方最需要的“美國(guó)援助之三艦軍械”直接運(yùn)抵臺(tái)灣。 盡管上述布置令代總統(tǒng)李宗仁十分惱火，并多次向蔣提出要將運(yùn)到臺(tái)灣的黃金、外匯運(yùn)回大陸，用以支付同中共的對(duì)抗，但蔣終不為所動(dòng)。