當(dāng)年8月13日，在北伐于淮河流域進(jìn)展不利，政府在上海的集款遇到困難之后，蔣介石辭去了他的總司令職位。1927年7月，張宗昌奪回徐州，孫傳芳發(fā)動(dòng)進(jìn)攻以重占長(zhǎng)江下游。在國(guó)民黨內(nèi)部，蔣受到廣西派李宗仁和白崇禧的反對(duì)，這些人沒(méi)有拒絕他1927年8月12日向軍委提出的辭職。Wilbur，TheNationalistRevolution，p 682。他在家鄉(xiāng)溪口待了一段時(shí)間，于1927年9月途經(jīng)上海準(zhǔn)備去日本作戰(zhàn)略性流亡。當(dāng)戴笠得知他的老上司在法租界時(shí)，便去敲蔣的大門(mén)，自愿為他當(dāng)保鏢。蔣介石顯然沒(méi)有認(rèn)出他過(guò)去的學(xué)生，所以戴笠得自我介紹說(shuō)：我原是黃埔的學(xué)生，現(xiàn)在來(lái)照顧校長(zhǎng)的安全。章微寒：《戴笠與“軍統(tǒng)局”》，第82頁(yè)。這之后不久，蔣于9月28日去了日本。他在那里既說(shuō)服了宋夫人讓他娶她的女兒，又與日本首相田中義一達(dá)成協(xié)議，后者同意幫助他與共產(chǎn)黨作戰(zhàn)，但同時(shí)敦促蔣集中其勢(shì)力于長(zhǎng)江以南，而把北方讓給張作霖和他急躁的日本專家們。當(dāng)時(shí)，反日游行示威在張作霖謹(jǐn)慎的默許下舉行，而南京政府也正在大聲抗議紐約花旗銀行和摩根公司給由日本人經(jīng)營(yíng)的南滿鐵路公司貸款3，000萬(wàn)美元一事。McCormack，ChangTsolininNortheastChina，pp 239—241。

與此同時(shí)，蔣在軍隊(duì)的主要?jiǎng)艛程粕窃谄渌麑④妭兊拿{迫下流亡日本。汪精衛(wèi)企圖在廣州召開(kāi)第四屆中央執(zhí)行委員會(huì)全會(huì)。失敗后，汪答應(yīng)與蔣介石在上海會(huì)面，并討論有關(guān)和解的可能性。在李濟(jì)深被趕出城，張發(fā)奎與陳公博等汪精衛(wèi)的其他擁護(hù)者們自立政府以后，汪精衛(wèi)在11月7日采取了“護(hù)黨救國(guó)”的行動(dòng)，鞏固了他的地位。章微寒：《戴笠與龐大的軍統(tǒng)組織》，第280頁(yè)。但他在全國(guó)的影響卻削弱了，因?yàn)辄h內(nèi)如胡漢民和吳稚暉這類(lèi)元老對(duì)他表示鄙視。自然，蔣介石的地位就相應(yīng)地增強(qiáng)了。11月下旬，國(guó)民黨領(lǐng)導(dǎo)們?cè)谑Y位于法租界的公館里舉行會(huì)談。盡管會(huì)談在1927年12月10日以了無(wú)結(jié)果而休會(huì)，但汪精衛(wèi)被迫邀請(qǐng)蔣介石重新?lián)慰偹玖畹穆毼?。?huì)談一結(jié)束，廣州公社便在12月11日爆發(fā)了起義，結(jié)果是汪精衛(wèi)丟失了在廣東的基地，而蔣介石則于1928年1月4日回到南京，開(kāi)始重建他的軍事聯(lián)盟。5天以后他重獲原來(lái)在國(guó)民黨政府中的最高統(tǒng)帥地位。Wilbur，TheNationalistRevolution，pp 686—696。

在蔣介石再次成為總司令，并由宋子文任財(cái)政部長(zhǎng)以后，蔣顯然想要利用這個(gè)新機(jī)會(huì)，盡可能地來(lái)鏟除他在國(guó)民黨內(nèi)的敵人，并重組某些省一級(jí)的黨委。1928年2月2日，在沒(méi)有共產(chǎn)黨和汪精衛(wèi)的支持者參加的情況下，國(guó)民黨執(zhí)行委員會(huì)第二屆會(huì)議在南京召開(kāi)。會(huì)議接受了蔣介石的提議，決定所有的宣傳均以孫中山“全國(guó)重建計(jì)劃”（這是在孫受到共產(chǎn)黨影響之前提出的）為基礎(chǔ)，以全國(guó)和解及雙方合作的精神來(lái)取代階級(jí)斗爭(zhēng)的意識(shí)形態(tài)，在地方黨組織解散之后重新登記黨員，撤銷(xiāo)在北伐中為統(tǒng)一戰(zhàn)線而負(fù)責(zé)動(dòng)員群眾的各個(gè)部門(mén)（農(nóng)民、婦女、青年、商人等）。新國(guó)民黨只建立了三個(gè)部門(mén)：組織、宣傳和黨訓(xùn)。軍委將由蔣介石委員長(zhǎng)直接領(lǐng)導(dǎo)，而在軍隊(duì)內(nèi)部將重新組織一個(gè)政治訓(xùn)練部，由戴笠的老資助人和朋友戴季陶領(lǐng)導(dǎo)。Wilbur，TheNationalistRevolution，pp 697—699。