在歐盟總部的架構(gòu)里，歐盟委員會相當于“國務院”，歐盟委員會主席相當于“總理”。正所謂“好事多磨”，巴羅佐還沒到布魯塞爾赴任就風波不斷，讓他嘗到了“欺生”的味道。

第一個是組閣風波，直接導致巴羅佐內(nèi)閣推遲上任近一個月。

按照歐盟的規(guī)則，歐盟委員會的組成人員分配原則是一個成員國一位，由成員國政府與歐盟委員會主席協(xié)商后提名，然后由歐洲議會全會對整個內(nèi)閣進行表決批準。然而，意大利提名的擬任內(nèi)政司法事務委員的歐洲事務部長、天主教徒布蒂廖內(nèi)忽然頭腦發(fā)熱，對敏感的同性戀和婦女事宜出言不遜，得罪了許多歐洲議會議員。于是，一些歐洲議會議員威脅要對巴羅佐內(nèi)閣投反對票，導致了歐盟歷史上罕見的組閣危機。

盡管當時擬投反對票的人數(shù)并未超過半數(shù)，不影響批準結(jié)果，但巴羅佐不希望還沒上臺就跛腿，竟然推遲提交內(nèi)閣名單給歐洲議會。此后，經(jīng)過斡旋，意大利總理貝盧斯科尼同意重新提名當時的外長弗拉蒂尼頂替布蒂廖內(nèi)，巴羅佐內(nèi)閣終于在歐洲議會高票通過。不過，此時離法定正式就任時間已經(jīng)過去了近一個月。

第二個是豪華游艇風波

2005年，德國《世界報》爆料稱，巴羅佐一家應邀到希臘船業(yè)大亨、億萬富翁Spiro Latsis的豪華游艇上度假一個星期，而這恰恰發(fā)生在巴羅佐領(lǐng)導的歐盟委員會批準撥付Latisis的公司1000萬歐元補貼之前一個月。巴羅佐后來解釋說，歐盟委員會的決定是在巴羅佐就任前一個月就已經(jīng)做出，屬于上屆歐盟委員會的決策，與他本人無關(guān)。

但是，英國的歐洲議會議員Nigel Farage并不善罷甘休，聯(lián)合另外70多名歐洲議會議員提出針對巴羅佐的“不信任案”動議，要讓巴羅佐到歐洲議會接受質(zhì)詢。該動議于2005年5月12日提出，巴羅佐于當月26日接受了質(zhì)詢。記得，巴羅佐當時語氣強烈地稱此動議是“不公平、不公正、不合法和愚蠢”，并強調(diào)“我們從未涉及任何商業(yè)事務，玩游艇和我的工作之間沒有任何聯(lián)系。” 在支持巴羅佐的人民黨黨團的運作下，“不信任案”最終不了了之。